| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,218,374 | (C)5→6 | pseudogene (306/1685 nt) | btsS ← | two‑component regulatory system sensor histidine kinase BtsS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,218,369 | 1 | . | C | 97.9% | 1782.9 / 26.2 | 521 | pseudogene (311/1685 nt) | btsS | two‑component regulatory system sensor histidine kinase BtsS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/3); new base C (287/222); total (296/225) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 560 total aligned reads displayed.
CAGCGACGAACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑CCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAACCCAAAC > NZ_CP025268/2218230‑2218503 | aGCGACGAACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑c < 1:305263/140‑1 (MQ=255) gacgaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑cccc < 1:4585382/140‑1 (MQ=255) gacgaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑cccc < 2:742598/140‑1 (MQ=255) gacgaACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑cccc < 2:3127458/140‑1 (MQ=255) aaCGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑cccc‑ccat > 1:6497727/1‑137 (MQ=255) aCGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑cccc‑ccatc < 2:811181/140‑5 (MQ=255) gACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAat > 1:6269198/1‑140 (MQ=255) aCCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGAt < 1:3938025/140‑1 (MQ=255) cggcggTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGt > 2:104982/1‑140 (MQ=255) gcggTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTaa > 1:7464914/1‑140 (MQ=255) aTGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAgccgcc > 2:3018386/1‑140 (MQ=255) ggggTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCgg < 2:9241282/140‑1 (MQ=255) gTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCa > 1:5163367/1‑140 (MQ=255) aaaGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGcc > 1:4167255/1‑140 (MQ=255) aaaGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGcc > 2:8158757/1‑140 (MQ=255) aGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCa > 1:7694510/1‑140 (MQ=255) aCTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGTATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAAc < 1:5659719/140‑1 (MQ=255) tttATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCa > 2:1182325/1‑140 (MQ=255) tttATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCa > 2:9140700/1‑140 (MQ=255) ttATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGACTCTCGATGTAAGCCGCCGGGCAGCCCAACCAg > 2:2704536/1‑140 (MQ=255) tATCAGTTCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGGAAGCCTGCAACGATGGGCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATCTCGCTGTCAGCCGCCGGTCCGCACCCCCAGc > 2:7695240/1‑140 (MQ=255) tATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGc > 1:8805319/1‑140 (MQ=255) tATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGc < 1:7031077/140‑1 (MQ=255) tGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCGGCCCACcg > 1:9497628/1‑140 (MQ=255) tGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcg > 2:4265863/1‑140 (MQ=255) tGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcg > 1:4424410/1‑140 (MQ=255) tGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcg > 2:4568463/1‑140 (MQ=255) gcgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcga > 2:5360911/1‑140 (MQ=255) cgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgac > 2:6180815/1‑140 (MQ=255) cgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgac > 2:3728844/1‑140 (MQ=255) cgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgac > 2:2923075/1‑140 (MQ=255) cgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgac > 1:7334401/1‑140 (MQ=255) cgcCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgac > 2:5015277/1‑140 (MQ=255) cgcCCGAGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCAACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGACCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCTGACCACcgac > 2:2043675/1‑140 (MQ=255) cccGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACcgacga > 1:3292197/1‑140 (MQ=255) gcggATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACgaccggac > 2:4095081/1‑140 (MQ=255) ggATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACgaccggaccg < 2:2779206/140‑1 (MQ=255) aGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAg > 1:3445060/1‑140 (MQ=255) cgCTGTGAACCAGGCCACCGAGTACTCCTTCAACGATGGTCGAGATCATTCAACTAAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAg < 2:5923954/139‑1 (MQ=255) gCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgc < 2:7471487/140‑1 (MQ=255) tgtgTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccg > 2:1632266/1‑140 (MQ=255) tgtgTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccg > 1:665036/1‑140 (MQ=255) tgtgTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccg > 1:5441021/1‑140 (MQ=255) tgtACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCCACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccgcc > 1:9226125/1‑140 (MQ=255) tgtACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccgcc > 1:9024068/1‑140 (MQ=255) tgtACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccgcc > 2:8973703/1‑140 (MQ=255) tgtACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccgcc > 2:24102/1‑140 (MQ=255) tgtACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccgcc > 2:5638319/1‑140 (MQ=255) tgtACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAgccgcc > 1:3605381/1‑140 (MQ=255) aCCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCAt > 2:7087322/1‑140 (MQ=255) agcccACCGAGTAATCCTTCACCGCTGGTCGAGATCATGCAACGTAACGCGGGC‑ATGCCCCC‑CATCGAATCTCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCCCCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTAc < 2:6469160/137‑1 (MQ=255) ggCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTAcc > 1:5336543/1‑140 (MQ=255) ggCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTAcc < 2:3807159/140‑1 (MQ=255) ggCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTAcc > 2:2532508/1‑140 (MQ=255) gCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACcg > 2:8653454/1‑140 (MQ=255) gCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACcg > 1:7596894/1‑140 (MQ=255) gCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACcg > 1:2388616/1‑140 (MQ=255) ccACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACcgc > 1:5015505/1‑140 (MQ=255) cACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGACTATCGATGTAAGCCGCCGGGCAGCCCAACCAGCCCACCGTCGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCAGTACcgcg > 1:4046756/1‑140 (MQ=255) cACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACcgcg > 2:4851464/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTACGCCGCCCATTACCGCGcc > 1:5739688/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc > 1:2028604/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc > 1:1833063/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc > 1:9323855/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc > 1:912293/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc > 2:3326339/1‑140 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc < 2:6662477/140‑1 (MQ=255) ccGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGcc > 1:9416764/1‑140 (MQ=255) gAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTa < 2:445276/140‑1 (MQ=255) aaTCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGc > 1:7832441/1‑140 (MQ=255) aTCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTCTCGCa < 1:2655495/140‑1 (MQ=255) aTCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCa > 1:4273040/1‑140 (MQ=255) aTCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCa < 2:4696825/140‑1 (MQ=255) tCCTTCAACGATGGTCGAGATCCTGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CCTCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCCGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCAc < 2:7855055/140‑1 (MQ=255) cAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTa < 1:2886249/140‑1 (MQ=255) cAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTa > 1:815553/1‑140 (MQ=255) gATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTgg < 1:4795318/140‑1 (MQ=255) aTGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGAGGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGc > 1:3740391/1‑140 (MQ=255) tGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCa > 2:359242/1‑140 (MQ=255) tGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCa > 2:6369089/1‑140 (MQ=255) tGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCa > 1:1513673/1‑140 (MQ=255) tGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCa < 2:8444512/140‑1 (MQ=255) tGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑CCCCGCATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGAGCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCTTTACCGCGCCTGTCGCACGGGTATTGGCa > 1:8954587/1‑140 (MQ=255) aggTCGAGATCAGGCAACTAACCGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGCTGGAAGCCGCCGGTCAGCCCACCCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCa < 2:7234804/139‑1 (MQ=255) ggTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCaa > 1:4377716/1‑140 (MQ=255) ggTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCaa > 2:5498391/1‑140 (MQ=255) gTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAAt > 1:2267527/1‑140 (MQ=255) gagaTCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGa < 2:4759356/140‑1 (MQ=255) gagaTCATGCAACTCAACGCGCAC‑ATGCCCCC‑CCACGCATATCGATGTAAGCCGCCGGACAGCCCAACCAGCCCCCCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTCTCGCACGGGTATAGGCAATAGa < 2:6930998/140‑1 (MQ=255) agaTCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGaa < 1:1182325/140‑1 (MQ=255) agaTCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGaa < 1:8010256/140‑1 (MQ=255) tGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTGCCGCGCCTATCg > 2:1415402/1‑114 (MQ=255) tGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTGCCGCGCCTATCg < 1:1415402/114‑1 (MQ=255) tGCAACTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCa < 1:6833303/140‑1 (MQ=255) cTTTACGCGGTCTTTC‑CCCC‑CATCGAATTTCGATGTAAGCCGCCGGTCAGACCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCAGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAAtgtg < 1:1010094/140‑1 (MQ=255) cTTAACGCGGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAAtgtg < 1:8488620/140‑1 (MQ=255) cgcgGTC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAAcc < 1:6406453/140‑1 (MQ=255) cgcgGGC‑ATGCCCCC‑CTTCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCAACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGACTCGTCAATGTGCCAcc > 2:3461383/1‑140 (MQ=255) tC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAACCCAAAc > 2:2255547/1‑140 (MQ=255) tC‑ATGCCCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGACGTTCAGCCCAACCAGCCCACAGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCACATTAGCGCGCCTATCGCTCGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAACCCAAAc > 2:8784077/1‑140 (MQ=255) | CAGCGACGAACGTGACGGCACCGGCGGTAATGGGGTTAAAGACTTTATCAGTGCGCCCGCGGCGGATCAGGATGCTGTGTACCAGGCCACCGAGTAATCCTTCAACGATGGTCGAGATCATGCAACTTAACGCGGTC‑ATG‑CCCC‑CATCGAATATCGATGTAAGCCGCCGGTCAGCCCAACCAGCCCACCGACGACCGGACCGCCGAGTAAGCCGCCCATTACCGCGCCTATCGCACGGGTATTGGCAATAGAATCGTCAATGTGCAACCCAAAC > NZ_CP025268/2218230‑2218503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |