| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,743,290 | +C | intergenic (‑66/‑116) | yiaJ ← / → galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,743,289 | 1 | . | C | 96.4% | 820.5 / 21.6 | 253 | intergenic (‑65/‑117) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/3); new base C (131/112); total (138/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
ACTCTGGCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑C‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAA > NZ_CP025268/3743150‑3743420 | aCTCTGGCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑aa > 1:1117309/1‑140 (MQ=255) tctGGCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑cc > 2:4331777/1‑139 (MQ=255) ctGGCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGAGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑cca > 2:7766428/1‑138 (MQ=255) tGGCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑ccaa > 1:8796476/1‑137 (MQ=255) tGGCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATATAT‑AA‑ccaa > 1:7436360/1‑137 (MQ=255) ggCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑ccaat > 1:4505824/1‑136 (MQ=255) ggCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑ccaat > 1:7933672/1‑136 (MQ=255) ggCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑ccaat > 1:9529233/1‑136 (MQ=255) cTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTg > 1:5130827/1‑140 (MQ=255) ttCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGa < 2:5935556/140‑1 (MQ=255) ggACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGCTGGTAGCGCGAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGAGTTTTATg > 1:1595866/1‑140 (MQ=255) ggACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATg > 2:2174169/1‑140 (MQ=255) gACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGt > 2:5513334/1‑140 (MQ=255) ctctTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCttt < 1:8667124/140‑1 (MQ=255) ttttCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGaa < 2:5222964/140‑1 (MQ=255) ttttCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTATTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGaa < 1:5087334/140‑1 (MQ=255) ccTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCCCTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGGCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGGCGTTCACGATCTCGACCGATCAGTTAG‑AACC‑AATGGAGGTGTATGTCTGTTGGAATtc > 2:8037618/1‑140 (MQ=255) ccTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCATAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATtc > 2:1072448/1‑140 (MQ=255) gcgcCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATtcatc > 2:9175537/1‑140 (MQ=255) gcgcCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATtcatc > 2:3018680/1‑140 (MQ=255) gcgcCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATtcatc < 2:5032459/140‑1 (MQ=255) gcgcCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATtcatc > 2:6831903/1‑140 (MQ=255) gagcaaTCTCGTTCTCTTTTTTTCACATCACTTCTTTCCACATTTTGTCGCGTCCTGATGTTCGCTCACATTGTGCCGTAGTACACGATCTCGAGAGATAATTTTTCAC‑C‑CAATGATTTTTATGTCTTTTGAAATtcatc > 2:8827474/6‑140 (MQ=255) cgcCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATtcatca < 2:5067804/140‑1 (MQ=255) gcCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCaa > 2:3682552/1‑140 (MQ=255) gcCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCaa < 1:4764201/140‑1 (MQ=255) ccATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAAt < 2:223545/140‑1 (MQ=255) ccATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAAt < 2:5368029/140‑1 (MQ=255) cATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATC > 2:1781720‑M1/1‑140 (MQ=255) cATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATC > 2:4534806‑M1/1‑140 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgc > 2:8602602‑M1/1‑133 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgc > 1:2661666‑M1/1‑133 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:8510527‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:4105585‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:4449666‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:1947132‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:735253‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTGTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:903252‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCATTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:6854134‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTGTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:8331263‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTGTCCCATCACTACTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:2477480‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTATTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTGTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:8447114‑M1/140‑9 (MQ=255) tctTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcctt < 2:1435548‑M1/140‑11 (MQ=255) tttCCCATCACTTCTTTCCCCATTGTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaa < 1:3529067‑M1/140‑17 (MQ=255) tCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaa < 1:6765226‑M1/140‑19 (MQ=255) ccATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagt < 2:6189541‑M1/140‑21 (MQ=255) tcccttcgttccCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:2953545‑M1/137‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:3810785‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:4243561‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:2698330‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:7131676‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:8863725‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:3617737‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:9131906‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAAGTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:4225141‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTATGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:6465180‑M1/140‑24 (MQ=255) tcttTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgata < 1:5311593‑M1/140‑29 (MQ=255) cttTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatat > 2:2781022‑M1/1‑111 (MQ=255) tCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgtgatagt > 1:1010137‑M1/1‑108 (MQ=255) ccATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttga < 2:3973930‑M1/140‑36 (MQ=255) ccATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgagcgatatatttga > 1:7635184‑M1/1‑105 (MQ=255) aTTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaa > 1:7741319‑M1/1‑103 (MQ=255) ttttGACGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaat < 1:3078947‑M1/140‑39 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatc < 1:3269807‑M1/140‑40 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 1:3994‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 1:2638654‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 1:5958208‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AAGTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttggtctaaagtgatcgatatatttggaatcgagtttcgc > 1:8176236‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAAGTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 2:6930849‑M1/1‑92 (MQ=255) tAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaa > 2:1906124‑M1/1‑83 (MQ=255) gcgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatt > 1:1470512‑M1/1‑81 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcatgtttcgcatattgaaattt > 1:798371‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 1:5385275‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 2:7601573‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 2:1290766‑M1/1‑80 (MQ=255) gcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatttt > 2:6014496‑M1/1‑79 (MQ=255) aGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagc > 1:8964012‑M1/1‑75 (MQ=255) tgtgCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AAGTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagcca > 1:3377913‑M1/1‑73 (MQ=255) ccGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaa > 1:3333497‑M1/1‑69 (MQ=255) aGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcg > 1:9329138‑M1/1‑65 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaatgtgatcgatatatttgaaatcaagtttcggatattgtaattttaagccaaaaaagcgat > 2:9024907‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttagcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:4852798‑M1/1‑63 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 2:13102‑M1/1‑61 (MQ=255) aCGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaa < 1:2219136‑M1/140‑81 (MQ=255) aCGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTATATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaa < 1:4400925‑M1/140‑81 (MQ=255) aTCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGAATTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaa < 1:5631652‑M1/140‑84 (MQ=255) tctcGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaa > 2:7270969‑M1/1‑56 (MQ=255) tctcGACAGATAATTTAT‑AA‑CAAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcctttttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaa < 2:2375737‑M1/140‑85 (MQ=255) tcGACAGATAATTTAT‑AA‑CAAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaac > 2:2814399‑M1/1‑54 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑ACTTGATTTTTATGTCGTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 2:5140784‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaataca > 1:959246‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 1:1641200‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 2:5675959‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagcaaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 2:7903362‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATGTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaatagcgatcaaaaaaaca > 1:8078041‑M1/1‑53 (MQ=255) aCAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatctttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaag < 1:721508‑M1/140‑90 (MQ=255) tatTTCT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTATTGAAATACATCAATCagattgccatgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcc < 2:8089213‑M1/139‑96 (MQ=255) aaTTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcc < 2:1615186‑M1/140‑96 (MQ=255) aaTTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTATTTAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcc < 2:321994‑M1/140‑96 (MQ=255) aTTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcct > 2:6526103‑M1/1‑44 (MQ=255) | ACTCTGGCTTCCGGCTGGACGCTCTTTTTCCTGCGCCATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑C‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAA > NZ_CP025268/3743150‑3743420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |