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TTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGG > 2:5950600/1‑140 TGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAG > 1:6430654/1‑140 TGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAG < 2:8371969/140‑1 aCCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTTGCAGATGCCTGACG > 2:1115568/2‑140 aCCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACG < 1:7186482/139‑1 GCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCG > 1:1006704/1‑140 TTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC > 1:882497/1‑140 TTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTAGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTACTCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC > 2:4748360/1‑140 ACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621518‑4621379‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |