| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 1293101 | 31 (0.060) | 240 (0.500) | 67/236 | 2.2 | 55.0% | noncoding (114/132 nt) | CXP41_RS06840 | RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | 1293574 = | 366 (0.760) | noncoding (66/85 nt) | CXP41_RS06855 | tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 394 total aligned reads displayed.
GCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292965‑1293240 | gCAACGCACACTCGCTGCCGCACGAGACGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTACCCCTCATTGCAAGAATTTTTATTTGCGTTTTATTTTGTCAGTTCTTGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcga < 2:7114454/140‑4 (MQ=0) cGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacct > 1:4344026‑M1/1‑133 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacct > 1:7330712‑M1/1‑133 (MQ=255) ctctctCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttc > 1:2579102‑M1/1‑131 (MQ=255) tctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACGTTTGGAAGTGGTGGGGGGGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaa > 1:3867319‑M1/1‑128 (MQ=255) cGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtc < 2:617229‑M1/140‑16 (MQ=255) ggcgcTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatg > 2:6896959‑M1/3‑121 (MQ=255) cGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgac < 1:1354343‑M1/140‑22 (MQ=255) cGCTCGAGTCGCACCGTGGGCGACGCTTCTCATCCGTCCCCGCAAGGGCAGAATAGTTAATTGCGGAGTCGATGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgac < 2:6052311‑M1/140‑22 (MQ=255) gCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTGAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTTAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGTTTcgaaccttcgaagtcgatgacg > 1:5103007‑M1/1‑118 (MQ=255) ctctAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:8901981‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCGTCACATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGAAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 2:8582706‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGACGACCCTTGGTCTACGCTTCTCATCGTTCCCCGCATGGGCATAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTCAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:7966566‑M1/140‑24 (MQ=255) tCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAGTTAATAGCGGGTTCGTTGGGAAGTTCAGGGTCTTTTGAATGTGATGTTGGGGGGGGAAGGATTcgcaccttcgaagtcgaggtcggc > 1:2214674‑M1/1‑116 (MQ=255) ctagtcgaaccTTGGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccatcgaagtcgatgacggca < 1:2015427‑M1/135‑26 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 2:4102874‑M1/140‑26 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:8680003‑M1/140‑26 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGACGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:5869736‑M1/140‑26 (MQ=255) gAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGACAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcag > 2:2513774‑M1/1‑114 (MQ=255) aaCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagtgttac > 1:4953778‑M1/1‑108 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:898230‑M1/138‑39 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 2:9341425‑M1/138‑39 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGGGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagagtg > 2:558481‑M1/3‑102 (MQ=255) agtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:4745877‑M1/138‑39 (MQ=255) gtcGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgc > 1:9363895‑M1/2‑101 (MQ=255) tCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgct < 1:7603151‑M1/140‑41 (MQ=255) tCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgct < 2:909489‑M1/140‑41 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc > 2:1347863‑M1/1‑91 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 2:7514424‑M1/140‑50 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 1:2790655‑M1/140‑50 (MQ=255) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccg < 2:4584047‑M1/140‑52 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATAGTTAAGTGCGGATGCGTTGGGACGTTCAGGGACGTTTGCAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgg > 2:5497402‑M1/1‑84 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 2:1153520‑M1/1‑83 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 1:6949136‑M1/1‑83 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 2:580376‑M1/1‑83 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatgtacagtctgctccctttggccgctcggg > 2:920895‑M1/1‑83 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 2:3188885‑M1/120‑39 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaa > 2:5669806‑M1/1‑81 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaa > 1:2322333‑M1/1‑81 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 1:3718028‑M1/140‑61 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac > 1:2387934‑M1/1‑80 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 1:3035970‑M1/140‑61 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 2:8895841‑M1/140‑61 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccc > 2:2350775‑M1/1‑78 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga > 1:5617282‑M1/1‑77 (MQ=255) gggCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGTTATTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacc < 1:7838587‑M1/140‑67 (MQ=255) gggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacc > 1:7932741‑M1/1‑74 (MQ=255) gggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacc < 1:9516839‑M1/140‑67 (MQ=255) ggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacca > 2:7685124‑M1/1‑73 (MQ=255) ggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacca > 1:9111513‑M1/1‑73 (MQ=255) gCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccac > 2:737696‑M1/1‑72 (MQ=255) gCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATTcgaaccatcgaattcgatgacagcagatttacagtctgatcccaaaggccgctcgggaaccccaccac > 2:7132390‑M1/1‑72 (MQ=255) aGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggg < 1:7175707‑M1/140‑71 (MQ=255) tatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggta < 1:1413140‑M1/140‑75 (MQ=255) ttAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattc < 1:1003743‑M1/140‑78 (MQ=255) tAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattca > 1:1870435‑M1/1‑62 (MQ=255) aaTTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgct < 1:1687199‑M1/140‑80 (MQ=255) tGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggaaatcctatt > 2:7952783‑M1/1‑58 (MQ=255) cGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacgggtaaatgaattttt > 2:221134‑M1/1‑56 (MQ=255) cGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 2:3350475‑M1/81‑26 (MQ=255) cttgagaGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAt < 1:550990/134‑1 (MQ=11) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc > 2:7830647/1‑140 (MQ=255) ggACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCAGCGGCAACGCTCACTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCATGGTCGAACCATCTAAACCTTACCCGCATg > 2:182963/1‑140 (MQ=11) ggACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGGCCTGCGGCACCGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTGTCATCCTGGCCCGCagg > 1:5274909/1‑138 (MQ=11) cTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCATCCCCGCATGGGc > 2:1003743/1‑140 (MQ=255) ttttGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 1:1475954/140‑1 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggaaatgcttttttctggccagctcacagatcgggcagcg > 1:6555892‑M1/1‑30 (MQ=255) ttGAAAGTGAGGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGa < 1:215068/140‑1 (MQ=255) gTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgca < 2:3653117‑M1/140‑118 (MQ=255) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggaaatgatttttactggccttctcccttatcgtgaagcggggcgcatc > 2:3849946‑M1/1‑21 (MQ=255) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatca < 2:4798794‑M1/140‑121 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatat > 2:4258987‑M1/1‑17 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggactgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatat > 2:6515349‑M1/1‑17 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:3505628‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:313205‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:8104183‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 2:717581‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 2:7490992‑M1/37‑24 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg > 2:9047519‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg > 1:7490992‑M1/1‑14 (MQ=255) tggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatccaa > 2:7589632‑M1/1‑13 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcataataacaaatt > 2:5306681‑M1/1‑11 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgatcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatg > 1:4153883‑M1/1‑11 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaaggctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatg > 2:4215513‑M1/1‑11 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 1:1220353‑M1/140‑133 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttac < 2:1546091‑M1/93‑86 (MQ=255) aGGTTTcgcaccttcgtagtcgttgacggcagttttacatgctgctccctttggccgctcgggaaccccaccccggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:2116842‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:5217975‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg > 2:2998523‑M1/1‑6 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:7685124‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:6130643‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacg < 2:5027302‑M1/75‑70 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctcccattggccgctcgggaaccccaccacggtgtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:3234226‑M1/140‑135 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg > 2:2669817‑M1/1‑3 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg < 1:6848745‑M1/140‑138 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg < 1:4730454‑M1/140‑138 (MQ=255) ttcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgcacccttctcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgc > 2:815566‑M1/1‑2 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggcagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgct > 1:5966049‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgct < 2:2288012‑M1/140‑140 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgct > 2:9415253‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292965‑1293240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |