| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,215,618 | T→C | pseudogene (386/405 nt) | tfaP → | tail fiber assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,215,618 | 0 | T | C | 99.9% | 2661.2 / NA | 785 | pseudogene (386/405 nt) | tfaP | tail fiber assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (426/358); minor base A (1/0); total (427/358) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 785 total aligned reads displayed.
CAATAGCAGACAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATT > NZ_CP025268/1215481‑1215753 | aaTAGCTGACAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTAc < 1:1678297/140‑1 (MQ=255) gCAGACAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTCCGCCt > 2:5883636/1‑140 (MQ=255) aCAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGCTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGAGTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCgg < 2:4519964/140‑1 (MQ=255) aCAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCgg < 1:8327223/140‑1 (MQ=255) aCAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCgg < 2:4015753/140‑1 (MQ=255) aCAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCgg < 2:7107514/140‑1 (MQ=255) aGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCa > 2:789504/1‑140 (MQ=255) tGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGt > 2:7273550/1‑140 (MQ=255) tGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGt > 2:416601/1‑140 (MQ=255) tGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGt > 1:2571389/1‑140 (MQ=255) ggCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGtt < 1:8839688/140‑1 (MQ=255) ggCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGtt < 1:4361918/140‑1 (MQ=255) ggCAGGGAAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAAGATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATAGTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGtt > 1:2870475/1‑140 (MQ=255) gCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGttc < 2:9305833/140‑2 (MQ=255) gCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGttc < 2:5651452/140‑2 (MQ=255) gCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGttc > 1:397423/1‑139 (MQ=255) cAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGttca < 2:5710565/140‑3 (MQ=255) ggTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATCTAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGttcaggc > 1:8507069/1‑135 (MQ=255) tAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCa > 1:1872615/1‑140 (MQ=255) tAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCa > 1:1340070/1‑140 (MQ=255) ggCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGAt < 1:6989643/140‑1 (MQ=255) ggCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGAt < 1:5447112/140‑1 (MQ=255) cATTGGGAAGACTGAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTTGAACTGTTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACAt < 2:5385217/140‑1 (MQ=18) ggAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgc > 1:9122499/1‑140 (MQ=255) ggAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgc > 2:6018628/1‑140 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGACGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:3098263/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:5167602/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:1721055/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:6463971/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:2477212/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:5639911/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:7439620/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:4194114/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:2053063/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:3660321/140‑1 (MQ=255) aGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGcgcg < 2:2773559/140‑1 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:3505052/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACAGCCGGCGCggg > 2:5799141/1‑139 (MQ=255) ttAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGc > 1:9248242/1‑140 (MQ=255) agaagaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGACTGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGt < 2:6337857/140‑1 (MQ=255) agaagaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGt < 2:5221702/140‑1 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 1:4534243/1‑140 (MQ=255) aTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTg > 2:1856153/1‑140 (MQ=255) aaCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATCTTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCa > 2:2700114/1‑140 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gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 1:4915816/1‑140 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca < 1:5757854/140‑1 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca < 2:6697736/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 2:4946810/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 2:7468183/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 1:2784062/140‑1 (MQ=255) tGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGt > 2:3282687/1‑140 (MQ=255) ggAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGtt < 1:3077719/140‑1 (MQ=255) aaGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 1:5938603/121‑1 (MQ=255) aGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAg > 2:8199500/1‑140 (MQ=255) gCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGt < 1:3886172/140‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGAGATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGGTAAGTCTg > 1:1137494/1‑140 (MQ=14) cTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCTATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTg > 2:7618347/1‑140 (MQ=255) cTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATAGTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTg > 1:3290532/1‑140 (MQ=255) tGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGttt < 2:5046000/140‑1 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 2:4808225/1‑140 (MQ=255) tGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgc > 2:3472249/1‑140 (MQ=255) tGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgc < 1:2221978/140‑1 (MQ=255) gATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcc < 1:4779329/140‑1 (MQ=255) aTACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcct > 1:3765604/1‑140 (MQ=255) aTACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcct > 2:2879129/1‑140 (MQ=255) tACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcctg > 1:9440395/1‑140 (MQ=255) aTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTTCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCTTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGt < 1:6373511/140‑1 (MQ=14) aTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGt < 2:8999646/140‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGt > 1:1584946/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCATTTCAGGCCAGATGACATCCGGAGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGGCAATGGACTCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGAGTCa > 2:6440840/1‑140 (MQ=14) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 1:7150519/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 1:6683565/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 1:102101/1‑140 (MQ=255) gTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGtt < 1:8579306/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGtt < 1:8103541/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGtt > 1:8716548/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 2:3767868/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 1:7613983/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 2:4725563/1‑140 (MQ=255) cgcCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTAGCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTAc > 2:6572923/1‑140 (MQ=255) ccAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGt > 1:5257452/1‑140 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCTGGCCTGATGACATGCGGCGCGGTGCTGGTCTCTGTTGCCGGCACCGCGTCATTGTAAGACCGCCCAGCGTTAAGTCTGGTTGTGTCTGCCTGCGGCAGTTTACGTc > 2:8490138/1‑140 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc > 2:803059/1‑140 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc > 1:1244727/1‑140 (MQ=255) atatTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCgg > 2:4249305/1‑140 (MQ=255) tGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTg > 2:873083/1‑140 (MQ=255) aaTGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCa > 2:6919700/1‑140 (MQ=255) aaTGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCa > 1:2040203/1‑140 (MQ=255) tGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAt < 1:8199500/140‑1 (MQ=255) | CAATAGCAGACAGTGGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATT > NZ_CP025268/1215481‑1215753 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |