| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 150,778 | C→T | A3T (GCT→ACT) | yadC ← | fimbrial tip‑adhesin YadC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 150,778 | 0 | C | T | 99.5% | 2989.2 / NA | 795 | A3T (GCT→ACT) | yadC | fimbrial tip‑adhesin YadC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (498/289); minor base A (1/3); total (503/292) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 795 total aligned reads displayed.
AAGGTCATCTGTGCGGCAGTGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGCCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCAT > NZ_CP025268/150642‑150914 | aTCTGTGCGGCAGTGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCAtttt > 1:1135771/1‑140 (MQ=255) tCTGTGCGGCAGTGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCAttttt > 2:1171213/1‑140 (MQ=255) tCTGTGCGGCAGTGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCAttttt > 1:2063351/1‑140 (MQ=255) cAGTGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATg < 1:46208/140‑1 (MQ=255) cAGTGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATg < 2:8641082/140‑1 (MQ=255) tGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGttt < 1:9353342/140‑1 (MQ=255) gggCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTCTCTGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGATAAAAAAAGAATGTTCCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTa < 2:3037641/140‑1 (MQ=255) gggCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTa < 2:6898884/140‑1 (MQ=255) gggCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTa < 1:6650039/140‑1 (MQ=255) gCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTAtt > 1:494134/1‑140 (MQ=255) gCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGNGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTAtt < 1:5594119/140‑1 (MQ=255) ttATCAACTCCTGCATTATTNCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCNTTTTTACNCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGttt > 1:5524524/1‑140 (MQ=255) aTCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTgc < 1:867863/140‑1 (MQ=255) aaCTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCt > 2:3193907/1‑140 (MQ=255) cTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGATAAAATAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTAATCCAATGTTTCTTTATTGTGTTGTTTTGGGCTGt > 2:7417895/1‑140 (MQ=255) cTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGGACTGACTGTCTTACAACAAGATTTAAGTGCTAATAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTATTATTTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTTTTATTGTTTGAGCTGattt > 2:8491524/1‑140 (MQ=255) cTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTTTTACAACTAGAATACAGTGCTATTATAAGTATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCATTGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGtttt > 2:2475929/1‑140 (MQ=255) cTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGtttt < 1:8365243/140‑1 (MQ=255) cTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCGTTATTGTTATGGTTTGCGCTGtttt > 1:3065585/1‑140 (MQ=255) cATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTtttgt < 1:5093916/140‑1 (MQ=255) tttCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAATAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTtgtgtgtt > 2:9372509/1‑140 (MQ=255) tttCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTCTGGTTTGCGCTGTTTTtgtttgtt > 2:7248552/1‑140 (MQ=255) tttCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTtgtttgtt > 1:3208615/1‑140 (MQ=255) aTAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCgtagt < 2:3444540/140‑1 (MQ=255) aTAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCgtagt < 1:5320980/140‑1 (MQ=255) aaaCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGATTACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTaaa < 2:174965/140‑1 (MQ=255) aCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAata < 2:8888310/140‑1 (MQ=255) aCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAata < 2:9228172/140‑1 (MQ=255) aCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAata < 2:2703735/140‑1 (MQ=255) ttGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATc < 2:4588581/140‑1 (MQ=255) ttGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGAGAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATc < 1:6943583/140‑1 (MQ=255) gTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTa > 2:3621364/1‑92 (MQ=255) gTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCa > 1:2901748/1‑140 (MQ=255) gTATATGAACTGACTGTATTACAAAAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTACAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCa > 2:6403724/1‑140 (MQ=255) atGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTaa > 1:2723669/1‑140 (MQ=255) gCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAaca > 1:4011205/1‑140 (MQ=255) actgactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTgcg < 1:4209901/99‑1 (MQ=255) actgactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAAcaca > 2:5115173/1‑140 (MQ=255) actgactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAAcaca > 1:9052590/1‑140 (MQ=255) actgactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAAcaca < 1:2501127/140‑1 (MQ=255) actgactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAAcaca < 1:788315/140‑1 (MQ=255) actgactgTAGTACAACCAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAAcaca < 2:6490121/140‑1 (MQ=255) ctgactgTAGTACAACAAGACTCCAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCCATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTCAATATCCACTAACACAt < 2:4681579/140‑1 (MQ=255) gactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAATTATCCACTATCACATgg > 2:2160305/1‑140 (MQ=255) gactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATgg > 2:3778145/1‑140 (MQ=255) gactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATgg > 2:4403841/1‑140 (MQ=255) gactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATgg > 1:6533835/1‑140 (MQ=255) gactgTATTACAACAAGAATACAGTGATAAAAAAATAATGTACCTGAAGATAGGCTTCATTATTACTCCAATGTTACTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATgg > 1:4767096/1‑140 (MQ=255) gTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCa > 1:1440379/1‑140 (MQ=255) tATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTGTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCAt > 1:4376584/1‑140 (MQ=255) aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTCTGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATa > 2:8133761/1‑140 (MQ=255) aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAata > 2:7823779/1‑119 (MQ=255) aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATa > 1:7262585/1‑140 (MQ=255) aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATa > 2:2265771/1‑140 (MQ=255) aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATATTTACTCCAATGTGTCTGTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCAACTAACACATGGCTCATa > 2:5711098/1‑140 (MQ=255) ttACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTGTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATaa > 1:6204706/1‑140 (MQ=255) tACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAg < 1:2279591/140‑1 (MQ=255) caacaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGtt < 2:6993264/140‑1 (MQ=255) aacaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAata < 2:4959840/114‑1 (MQ=255) aacaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTg < 1:1235514/140‑1 (MQ=255) aacaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTg > 2:3976359/1‑140 (MQ=255) aacaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCAGTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGGTATTAGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTg > 1:8261687/1‑140 (MQ=255) acaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCACTGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGa < 1:8024487/140‑1 (MQ=255) caaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTGTGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAc > 1:3854566/1‑140 (MQ=255) caaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAc < 2:2351670/140‑1 (MQ=255) caaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAc > 2:1605459/1‑140 (MQ=255) aaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcc < 1:16664/140‑1 (MQ=255) aaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcc < 2:2845262/140‑1 (MQ=255) aaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcc < 1:349239/140‑1 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcaa > 2:1293121/1‑138 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCa > 1:8452660/1‑140 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCa > 1:7385468/1‑140 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCa > 2:6680888/1‑140 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCa > 1:1027241/1‑140 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCa > 2:4117513/1‑140 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCa > 2:2033625/1‑140 (MQ=255) aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATACACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcaa > 2:5398821/1‑138 (MQ=255) gAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAg < 1:3599395/140‑1 (MQ=255) aaTACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGa < 2:7697530/140‑1 (MQ=255) cAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTa < 1:7769054/140‑1 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAGCAGATGTAaca > 1:6400411/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAaca > 2:1041204/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAaca > 2:835728/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAaca > 1:5821458/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAaca > 1:6111139/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAaca > 1:7560846/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAaca > 2:6059481/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAaca > 2:4776905/1‑140 (MQ=255) cTAAACAAAGACTGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGCCCAGATGTAACACt < 1:1802405/140‑1 (MQ=255) cTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACt > 2:1830057/1‑140 (MQ=255) cTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACt < 2:5840982/140‑1 (MQ=255) cTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACt > 1:4450271/1‑140 (MQ=255) cTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACt > 1:3706922/1‑140 (MQ=255) cTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACt < 2:9078052/140‑1 (MQ=255) cTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCAATAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACt > 2:5251787/1‑140 (MQ=255) cTAAAAAAAGAAGGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTACCACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACt < 2:2972028/140‑1 (MQ=255) aaaaaaaGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCa > 2:6229069/1‑140 (MQ=255) aGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAg > 1:8848705/1‑140 (MQ=255) aGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAg > 2:8227056/1‑140 (MQ=255) cTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCGACTAACACATGGCTCATAAGTTGAGCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAttt > 1:9534782/1‑140 (MQ=255) | AAGGTCATCTGTGCGGCAGTGGAGGGGCCTCGATAGTTATCAACTCCTGCATTATTTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGCCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCAT > NZ_CP025268/150642‑150914 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |