| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,026,646 | A→G | *246* (TAA→TAG) | fliP → | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,026,646 | 0 | A | G | 99.8% | 2024.2 / NA | 581 | *246* (TAA→TAG) | fliP | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (297/283); minor base T (0/1); total (297/284) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 590 total aligned reads displayed.
GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACG > NZ_CP025268/2026509‑2026781 | gCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTagag > 2:6711304/1‑140 (MQ=255) ccAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCACTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAgaga > 1:1316402/1‑140 (MQ=255) ccAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAgaga > 1:5916936/1‑140 (MQ=255) aGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAgg < 2:5128599/140‑1 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 1:7397928/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 1:8394040/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 1:8595009/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 2:5883988/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTCAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCCGAGCTTGTACAGCTAGAGAGGCa > 2:5725611/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCa > 2:8277631/1‑140 (MQ=255) ttGATGGCATTGGGGCTGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGctatgt > 1:6278175/1‑135 (MQ=255) tGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATg > 1:338988/1‑140 (MQ=255) tGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATg > 1:4090203/1‑140 (MQ=255) ggCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCATTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGacac < 2:3734963/140‑1 (MQ=255) gCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACAcc < 1:432966/140‑1 (MQ=255) aTTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAAAGACACCTg > 2:441052/1‑140 (MQ=255) tGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGaa > 1:4382387/1‑140 (MQ=255) ggggCTGATGCTGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTAAACACTGTAGCTGTTTGTACTGCTGGATGGCTGGCAATTGCTGGACGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACTCCTGAAt < 2:8065923/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 1:2804544/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 2:121224/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCATTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTAAAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 2:4537845/140‑1 (MQ=255) gatgatgatGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCgg < 1:6103937/140‑1 (MQ=255) ctgatgctgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTTCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGt < 2:7875483/139‑1 (MQ=255) atgatgatgGTTCCCACAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCGGGTCGGTTCGCGGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGt < 2:7239773/140‑1 (MQ=255) tgatgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTc > 1:4928253/1‑140 (MQ=255) gatgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCa > 1:420954/1‑140 (MQ=255) tgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatg < 1:1256963/140‑1 (MQ=255) tgatgGGTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCTATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatg < 2:9260486/140‑1 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGTTGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:8050645/1‑140 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTCGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:1049391/1‑140 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:4610301/1‑140 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:5393118/1‑140 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat < 1:2722927/140‑1 (MQ=255) ttCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgatg < 2:6476849/140‑1 (MQ=255) ccaccaTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGaa < 2:4192958/140‑1 (MQ=255) ccaccaTTGCTCTGCCCATTAACCTGATGCTGTTAGTACTGGTGGATGGCTGGCAAGTGCTGGTAGGTTAGCGGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGATGCAACATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTTaa < 2:7365243/140‑1 (MQ=255) accaTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGc > 1:656690/1‑140 (MQ=255) caTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGa > 2:8557550/1‑140 (MQ=255) ctctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGaaa > 2:9014905/1‑140 (MQ=255) ctctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGaaa > 1:7954075/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAATTGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGACAGTcgc > 1:6734650/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:5388512/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:3576835/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:3162821/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 1:8249264/1‑140 (MQ=255) tAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTgg > 2:2466911/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 2:4845135/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 1:2307770/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 1:1877028/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACAGAAGCGATGAAAGTCGCGCTTGCACTg > 2:6283808/1‑140 (MQ=255) gATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTgg > 2:6134664/1‑140 (MQ=255) gATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTgg < 1:4802454/140‑1 (MQ=255) aTGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGc > 2:2529995/1‑140 (MQ=255) aTGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGc > 2:8775865/1‑140 (MQ=255) gCTGTCTGTCCTGGTGGATGGCTGGCCAGTGCGGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAACAGGACACCAGACTCGGTCCAGATGATGGGGACAGAAGCGATGCAAGTCGCGCTGGCACTGGCTg < 2:2742072/140‑1 (MQ=255) tGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGcc < 1:3259166/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGTGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc < 1:8941774/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc > 2:1559971/1‑140 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc < 1:3976618/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc < 1:5834507/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGACGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc < 1:5176639/140‑1 (MQ=255) tttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCATAGCTTTTACAGCTAGAGAGGAAAAAAGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGCCTGcccc > 2:3900911/1‑140 (MQ=255) tttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGcccc > 1:2014333/1‑140 (MQ=255) ttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCg < 1:2586783/140‑1 (MQ=255) ctGTACTCGCGGATCGCAGCCAATTGCGTGGCTGTGCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGAGAGAGACGAAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATCTGGACTGAAGCGAGGAAAGTCGCTCTGGCACCGGCTGCCCCg < 2:7712296/139‑1 (MQ=255) gTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCt < 2:2142529/140‑1 (MQ=255) aCTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAt < 2:3482164/140‑1 (MQ=255) ggtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgt > 2:2639370/1‑140 (MQ=255) ggtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgt > 1:2978534/1‑140 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg > 1:8747281/1‑140 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg > 2:9142191/1‑140 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg > 1:9137591/1‑140 (MQ=255) ggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTgg < 2:3271437/140‑1 (MQ=255) gATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGt > 1:8106145/1‑140 (MQ=255) gggcAATTGCGGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGtt < 1:9444714/139‑1 (MQ=255) ggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTg > 2:6401370/1‑140 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 2:4055283/140‑1 (MQ=255) ttGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACAACTGACTCGTTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTAGCGATGGAACTGTCTGCCGCTCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCAc > 2:2280292/1‑140 (MQ=255) ggTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGcc < 2:7617788/140‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTCGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCt > 1:3155775/1‑140 (MQ=255) gTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCt > 2:4341549/1‑140 (MQ=255) gTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCt < 1:7207980/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:5636736/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:1564390/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCGAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 2:4652319/140‑1 (MQ=255) gTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatc > 2:8386736/1‑140 (MQ=255) gTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatc > 2:8144497/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGACTCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 1:7604427/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:1992137/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 1:3883210/140‑1 (MQ=255) cAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTAtttt > 1:1789045/1‑140 (MQ=255) agCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCa < 2:4972960/140‑1 (MQ=255) cTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAgg < 1:3647896/140‑1 (MQ=255) ttttACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGgc < 1:1433321/140‑1 (MQ=255) tttACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAATCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGTCTGCCCCGCTATTGTAGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGgcc < 2:1006048/140‑1 (MQ=255) ttACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTCTTTTGCAGgccg < 2:6960301/140‑1 (MQ=255) ttACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGgccg > 1:6435134/1‑140 (MQ=255) ttACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCAAGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGgccg < 2:1744261/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 2:656690/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGAAGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGGAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCGGGAGTTTGCAGGCCGCCACg > 2:8871185/1‑140 (MQ=255) | GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACG > NZ_CP025268/2026509‑2026781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |