Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,088,812 | A→G | G251G (GGT→GGC) | tsuA ← | thiosulfate utilization transporter TsuA/YeeE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,088,812 | 0 | A | G | 99.8% | 2211.1 / NA | 637 | G251G (GGT→GGC) | tsuA | thiosulfate utilization transporter TsuA/YeeE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (374/262); minor base T (0/1); total (374/263) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 637 total aligned reads displayed.
CTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACACCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGATGA > NZ_CP025268/2088675‑2088948 | cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAACTGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 2:7429603/140‑1 (MQ=255) cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 1:3915203/140‑1 (MQ=255) cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 2:5618375/140‑1 (MQ=255) ggCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcccc < 1:7153506/140‑1 (MQ=255) cACCGAAGCCCATCAGTACACCTCCTAACCCGCTAAGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCACACGAAGATCCCTAACACCAGTTAAACGCCCCat < 2:396756/140‑2 (MQ=255) cACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAg < 1:6598046/140‑1 (MQ=255) cACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAg < 2:8959766/140‑1 (MQ=255) aCCGAAGCCCATCAGTACACCACCCACCCCGCGACGTACTGTTGTTTGAGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAACTGACCCCACGAAGTTCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGt < 2:252961/140‑1 (MQ=255) gacgCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTaa < 1:8157208/137‑1 (MQ=255) gAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCGTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTaa > 2:1498067/1‑140 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt > 2:1942557/1‑140 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt > 2:8005/1‑140 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt > 1:3731827/1‑140 (MQ=255) cAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCa > 2:7633075/1‑140 (MQ=255) tACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGt < 2:7295710/125‑1 (MQ=255) tACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGt > 1:3319244/1‑140 (MQ=255) accaccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCAc > 1:1203571/1‑140 (MQ=255) accTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcg < 2:1629017/140‑1 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGTAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCGCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 1:7544143/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGTCAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 2:8740633/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 2:862947/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCAACAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATTTCACCcgc > 2:6830574/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGGAATGTGGTTTGTGCCTCAGCTGCGCGAACGCGGAACGCGCGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGACCACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 2:623794/1‑140 (MQ=255) cTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgcg > 1:7002654/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAc > 1:2916259/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAc > 1:7318498/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAc > 1:6408112/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAc > 2:8358070/1‑140 (MQ=255) cccGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCAGCGACCa > 2:3519438/1‑140 (MQ=255) cGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGa < 1:21096/140‑1 (MQ=255) cGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGa < 2:8903380/140‑1 (MQ=255) cGCTACGTAATGTTGATTGTGCATCAGCGGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAAAAAATGACCCCACGAAGATCCCGAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGa < 2:3357896/140‑1 (MQ=255) gCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaa > 2:4580529/1‑140 (MQ=255) gCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaa > 1:7614980/1‑140 (MQ=255) cTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaaa > 1:4867561/1‑140 (MQ=255) tACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAAt > 2:8191267/1‑140 (MQ=255) tACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAAt > 1:6695922/1‑140 (MQ=255) tACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAAt > 1:9480090/1‑140 (MQ=255) aCGTAAGGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGACGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTCATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAAtt > 2:132065/1‑140 (MQ=255) gTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGc < 1:974891/140‑1 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:1008221/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:4524845/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:4102233/1‑140 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc > 2:4051842/1‑140 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc > 1:9239134/1‑140 (MQ=255) gCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAACACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAAGATTGGCCGt > 2:7075134/1‑140 (MQ=255) aGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTgggg > 2:2946628/1‑140 (MQ=255) aGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTgggg > 2:2105071/1‑140 (MQ=255) aGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTgggg > 1:3039567/1‑140 (MQ=255) aGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTgggg > 1:4367815/1‑140 (MQ=255) gcgcGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGACCACGCCCCAGTGACTGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATGGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 2:6011121/1‑140 (MQ=255) gcgcGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt < 1:5360457/140‑1 (MQ=255) gcgcGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 1:8326452/1‑140 (MQ=255) gcgcGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 1:5137790/1‑140 (MQ=255) gcgcGAACGCCGCACTCACCGCTCGCCTTGGCTGCACAAAATGACCCCACGAAGATCCCTCACTCCAGGAAACCGCCCCAGTTACTGTATTTCATGTCCCCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt < 2:6483801/140‑1 (MQ=255) cgAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGAt > 2:9153811/1‑140 (MQ=255) aCGCGGACCTCACGGCAATCTTTGTCTTCAATAAATGACCCGACGAAGAACCTTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTcc < 2:1135862/140‑1 (MQ=255) aCGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAg < 2:3795059/113‑1 (MQ=255) aCGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTcc < 2:7820406/140‑1 (MQ=255) cgGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTaa > 1:5453290/1‑140 (MQ=255) ggAACTCACGGCTCGCTATGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGTAAGTGATTCCTAAc < 2:4803071/140‑1 (MQ=255) cACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAAc > 2:6628210/1‑140 (MQ=255) aCGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACa > 1:8783970/1‑140 (MQ=255) gCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGc < 1:8657184/140‑1 (MQ=255) cTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCg < 1:188348/140‑1 (MQ=255) gCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTcc < 1:7443009/140‑1 (MQ=255) tttGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCgg < 2:2692733/140‑1 (MQ=255) ttGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTACCACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGt < 1:4253251/140‑1 (MQ=255) tGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGA‑CCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTg < 1:7880398/140‑1 (MQ=255) cTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCt < 1:2505149/140‑1 (MQ=255) cTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCt < 2:3128873/140‑1 (MQ=255) gCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTc < 1:2729104/140‑1 (MQ=255) cAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCa > 1:8856809/1‑140 (MQ=255) cAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCa > 1:1676418/1‑140 (MQ=255) cAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGGTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGACTATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCa > 2:9358269/1‑140 (MQ=255) aTAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACt > 2:5854415/1‑140 (MQ=255) aaaTGACCCCACGAAGATCCCGAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCa < 2:6988379/140‑1 (MQ=255) aTGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAgg > 1:5869551/1‑140 (MQ=255) cccACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGTATATTTGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCa > 2:2296458/1‑140 (MQ=255) cccACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACt < 1:1356099/131‑1 (MQ=255) gAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTa < 1:8505462/140‑1 (MQ=255) aaGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTaa < 1:3405592/140‑1 (MQ=255) aTCCCTAACCCCAGGAAAACGCCCCAGAAAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAg < 1:6041826/140‑1 (MQ=255) aTCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAg < 1:6845885/140‑1 (MQ=255) tCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAgc > 1:2022495/1‑140 (MQ=255) ccAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGACGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCaaa > 2:948046/1‑140 (MQ=255) ccAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCaaa > 1:3212199/1‑140 (MQ=255) ccAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCaaa < 2:1719398/140‑1 (MQ=255) ggAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGTGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCACACCg > 1:1513468/1‑140 (MQ=255) ggAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGACGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCg > 2:4274149/1‑140 (MQ=255) ggAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCg < 1:9051898/140‑1 (MQ=255) ggAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCg > 1:2210805/1‑140 (MQ=255) ggAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCg < 1:4731436/140‑1 (MQ=255) gAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGa > 1:2621801/1‑140 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACNCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 1:5595827/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 2:6432519/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 1:630816/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 2:527667/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 2:5094175/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 2:4152047/140‑1 (MQ=255) | CTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACACCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGATGA > NZ_CP025268/2088675‑2088948 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |