Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,843,404 | A→T | intergenic (‑120/‑140) | ascG ← / → ascF | DNA‑binding transcriptional regulator AscG/PTS cellobiose/arbutin/salicin transporter subunit IIBC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,843,404 | 0 | A | T | 98.7% | 1926.2 / NA | 533 | intergenic (‑120/‑140) | ascG/ascF | DNA‑binding transcriptional regulator AscG/PTS cellobiose/arbutin/salicin transporter subunit IIBC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); major base T (291/232); minor base G (0/7); total (292/241) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.61e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 533 total aligned reads displayed.
TTCCAGCATCGTCGTCATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAAATCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATAACAGGATAA > NZ_CP025268/2843267‑2843537 | tCCAGCATCGTCGTCATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCa < 1:6732623/140‑1 (MQ=255) tCCAGAATCGTCGTCATCATTTTCATCCCTTTACCCGCAATCAACGCAGTGTACTGCACGGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGAACGGTTTCACAAATATAAAAAATGATCAATTCa < 2:5395922/140‑1 (MQ=255) gCATCGTCGTCATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCActct < 1:3686771/140‑1 (MQ=255) cATCGTCGTCATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCActctc > 1:5930117/1‑140 (MQ=255) aTCGTCGTCATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCActctct < 2:8140187/140‑1 (MQ=255) gtcgtcATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCTCTCTCTTGc > 2:6734874/1‑140 (MQ=255) tcgtcATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCt < 1:5070414/140‑1 (MQ=255) tcatcaTTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTAt < 2:4049051/140‑1 (MQ=255) tcatcaTTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTAt < 2:7853289/140‑1 (MQ=255) tcatcaTTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCATTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTAt < 2:3792489/140‑1 (MQ=255) tcatTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTa < 2:5534642/140‑1 (MQ=255) ttCATCCCTTTACCCGCAATCACCGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGAc < 1:6022939/140‑1 (MQ=255) ttCATCCCTTTACACGCAATCACCGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGAc < 2:4709034/140‑1 (MQ=255) cATCCCTTTCCACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCGTGCTTATTTAGTGACaa < 2:2088917/140‑1 (MQ=255) cATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACaa < 2:3889548/140‑1 (MQ=255) cATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACaa < 1:9482583/140‑1 (MQ=255) ttACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCa > 2:283857/1‑140 (MQ=255) tACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCAt > 2:5489038/1‑140 (MQ=255) cAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGAtttt > 1:7710134/1‑140 (MQ=255) aaTCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTtg > 2:2310083/1‑140 (MQ=255) aaTCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTtg > 1:4923134/1‑140 (MQ=255) aaTCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTtg > 1:1001596/1‑140 (MQ=255) aaTCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTtg < 1:2643014/140‑1 (MQ=255) tCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTtgtg < 1:4633285/140‑1 (MQ=255) caCGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATNGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGaa < 1:5564947/139‑1 (MQ=255) cGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAAc > 1:5139115/1‑140 (MQ=255) cgtgtACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCgg < 1:8322331/139‑1 (MQ=255) aGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACACTTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCgg < 2:3013613/140‑1 (MQ=255) aGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCgg < 2:731711/140‑1 (MQ=255) aGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCgg < 1:6599832/140‑1 (MQ=255) gtgtACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGt > 1:1454731/1‑140 (MQ=255) gtgtACTGCACCGATTGCCGATTGTCCTTGCAAAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAAAACACTCTCTTGCAGAATTCGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGt > 2:9076124/1‑140 (MQ=255) cTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCtt < 1:8126526/140‑1 (MQ=255) cTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCtt < 1:3363299/140‑1 (MQ=255) tGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTa > 1:7957955/1‑140 (MQ=255) cACCGTTTGCCGAATGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAAt > 1:9108342/1‑140 (MQ=255) aCCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAAtt > 1:9215753/1‑140 (MQ=255) cGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAATTATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTcc > 2:9362345/1‑140 (MQ=255) cGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACCACTCTTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTcc > 2:6803675/1‑140 (MQ=255) cGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTcc > 2:3135775/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 2:2198768/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 2:197954/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 2:5101269/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 1:7252465/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 2:637760/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 2:6672444/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 1:2949616/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 2:720322/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTATCACAAATATAAAAAATGACCAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGt > 2:4822944/1‑140 (MQ=255) tttGCCGATTGTCATTGCACAATCGGAGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGATTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTAGTTAGTGAACAATATTCATGATTTTGTGATACCGGTTTCTAAATTCCGt > 2:8246854/1‑140 (MQ=255) tGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGttt < 1:7436505/140‑1 (MQ=255) gCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTc > 1:4711937/1‑140 (MQ=255) tCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCgg < 2:9148009/140‑1 (MQ=255) tCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCgg > 1:2071891/1‑140 (MQ=255) ttGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAACCCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCAt > 1:1216380/1‑140 (MQ=255) tGCACAATCGGCGGGAAAAAGATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCAtt < 2:7991785/140‑1 (MQ=255) aTCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCg > 2:9408747/1‑140 (MQ=255) tCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGt > 2:6022429/1‑140 (MQ=255) tCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGt > 1:1343139/1‑140 (MQ=255) tCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGt > 1:1530358/1‑140 (MQ=255) cggGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACg < 1:4005306/140‑1 (MQ=255) cggGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTGTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACg > 1:443977/1‑140 (MQ=255) aaaaaTATTCTGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTTTTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGa < 1:3448839/140‑1 (MQ=255) aaaaaTATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGa > 1:1877007/1‑140 (MQ=255) ccctcttCACGTGACCGGATACACAAATATCAAACATCAACAACTCACTCTCTTGCTAATTTAGAGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCAGCGGCATTTGTCCGTCACGTCGACt < 2:7695757/135‑1 (MQ=255) aaaTATTCATGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGATCAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACAGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACt < 2:1192482/140‑1 (MQ=255) atTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATa > 2:7356140/1‑140 (MQ=255) aGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATaacaa < 2:3368260/140‑1 (MQ=255) aGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATaacaa < 1:5431314/140‑1 (MQ=255) ggTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTGTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGCCTGATaacaac > 1:7773022/1‑140 (MQ=255) gagACCGGTTTCACAACTAGAAAAAAGGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACt < 1:9061812/138‑1 (MQ=255) gACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTAc < 1:3134823/140‑1 (MQ=255) gACCGGTGTCACAAATATAAACAATGAACAAGTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGAGAACAACTAc < 2:8904574/140‑1 (MQ=255) aCCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACa > 1:1791191/1‑140 (MQ=255) ccGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACAt < 2:6468598/140‑1 (MQ=255) ccGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACAt < 1:2002160/140‑1 (MQ=255) ccGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACAt < 2:5215877/140‑1 (MQ=255) ccGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACAt < 2:3492599/140‑1 (MQ=255) ccGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACAt < 2:2630021/140‑1 (MQ=255) cGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATc > 1:8821358/1‑140 (MQ=255) cGGGTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTAACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCAGGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATc < 2:1029445/140‑1 (MQ=255) gTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTa < 1:635086/140‑1 (MQ=255) gTTTCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTa > 1:8623396/1‑140 (MQ=255) tttCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTAc > 2:8717373/1‑140 (MQ=255) ttCACAAATATAAAAAATGAACACTTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTAcc < 1:6899884/140‑1 (MQ=255) ttCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTAcc < 2:1544026/140‑1 (MQ=255) ttCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTAcc < 2:4408155/140‑1 (MQ=255) tCACAAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACAt > 2:2409625/1‑134 (MQ=255) acaAATATAAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCAGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTa < 2:134506/140‑1 (MQ=255) tataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGAt < 1:4356270/140‑1 (MQ=255) tataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGAt > 1:7043054/1‑140 (MQ=255) tataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGAt > 1:2218854/1‑140 (MQ=255) ataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATa > 2:1442225/1‑140 (MQ=255) ataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATa > 1:5758149/1‑140 (MQ=255) ataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATa > 2:6200476/1‑140 (MQ=255) ataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATa > 2:1624710/1‑140 (MQ=255) ataAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATa > 2:5905348/1‑140 (MQ=255) taAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATaa < 2:7084157/140‑1 (MQ=255) taAAAAATGAACAATTCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATaa < 1:7533098/140‑1 (MQ=255) aaaaaaaTGAACAATTCACTCTCTTTCTTAATTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATaa < 1:6043495/139‑1 (MQ=255) | TTCCAGCATCGTCGTCATCATTTTCATCCCTTTACACGCAATCAACGCAGTGTACTGCACCGTTTGCCGATTGTCCTTGCACAATCGGCGGGAAAAATATTCAGGTGACCGGTTTCACAAATATAAAAAATGAACAAATCACTCTCTTGCTTATTTAGTGACAACTATTCATGATTTTGTGAAACCGGTTTCTTAATTCCGTTTCAGCATCGGCATTTTTCCGTCACGTCGACTGATAACAACTACATCTACCCTACTGATAACAGGATAA > NZ_CP025268/2843267‑2843537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |