Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,096,538 | C→T | A283T (GCA→ACA) | yggR ← | type IV pilus twitching motility protein PilT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,096,538 | 0 | C | T | 99.4% | 1968.9 / NA | 516 | A283T (GCA→ACA) | yggR | type IV pilus twitching motility protein PilT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (301/211); minor base G (3/0); total (305/211) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 522 total aligned reads displayed.
CGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGCGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACC > NZ_CP025268/3096402‑3096674 | cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGtt > 1:1924896/1‑140 (MQ=255) cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGtt > 1:7950527/1‑140 (MQ=255) gTCACAAANGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCNACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTa > 1:5602505/1‑140 (MQ=255) gTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTa > 2:8308885/1‑140 (MQ=255) caACCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCa < 2:6671065/140‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCa < 1:5392097/140‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCa < 2:3249410/140‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAAGCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCa < 1:7438640/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGc < 1:3292773/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATATCTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCTGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCATATTCCCCACCGAGGGTGTGTTAATAAGCAAt < 2:7955420/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGTATCCAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCact > 1:6555213/1‑138 (MQ=255) gCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAAt < 1:6674339/140‑1 (MQ=255) cccTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTACCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAAtt > 2:5629916/1‑140 (MQ=255) ccTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTc > 2:6143543/1‑140 (MQ=255) cccccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAAt > 1:3189679/1‑140 (MQ=255) ccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAAGTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAgc < 1:2120402/140‑1 (MQ=255) cACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAgcg < 2:6961704/140‑1 (MQ=255) cACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAgcg < 2:6880890/140‑1 (MQ=255) cACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAgcg > 1:467560/1‑140 (MQ=255) ggTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcg < 1:2254428/140‑1 (MQ=255) gTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTACTCAGCAAGTCAAATAGCGACAcgc > 2:9073890/1‑140 (MQ=255) gTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCACTTCAAATAGCGCCAcgc > 2:2995869/1‑140 (MQ=255) gTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgc > 2:2474816/1‑140 (MQ=255) tGCTGATAACTCTGCTGTAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgcg > 2:3464368/1‑140 (MQ=255) tGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgcg > 1:1560782/1‑140 (MQ=255) tGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCAcgcg < 1:7637979/140‑1 (MQ=255) gCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGt < 1:5987606/140‑1 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2:6716736/1‑138 (MQ=255) tgctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGttt > 1:4098081/1‑140 (MQ=255) tgctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGttt > 1:1025709/1‑140 (MQ=255) ctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCACTTCAAATCGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTAt > 2:1397480/1‑140 (MQ=255) ctgAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATCGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTAt > 2:6408929/1‑140 (MQ=255) tgAAACGTTAACATCCACACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAAGTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATc > 1:8856492/1‑140 (MQ=255) cGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACtt > 2:2859022/1‑140 (MQ=255) atcatcCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAg > 1:8438357/1‑140 (MQ=255) atcatcCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAg > 1:3518889/1‑140 (MQ=255) tcatcCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGc < 2:9293932/140‑1 (MQ=255) atcCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCTAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCtt > 2:3093905/1‑140 (MQ=255) tcCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCttt < 1:3097501/140‑1 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tgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCAc < 1:9136839/140‑1 (MQ=255) tgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCAc < 2:449159/140‑1 (MQ=255) tgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAAGTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCAc < 2:8602298/140‑1 (MQ=255) tgcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGG‑TTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACt > 1:4544881/1‑140 (MQ=255) gcCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACt > 1:5014669/1‑140 (MQ=255) cccGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTg > 2:9479127/1‑140 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ggTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAg > 1:9524971/1‑140 (MQ=255) ggTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAAGTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACGGCCCGTAAACTACCTGCCAg < 1:8786265/140‑1 (MQ=255) gTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGt < 1:6288456/140‑1 (MQ=255) gTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCGTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGt < 1:985097/140‑1 (MQ=255) aCTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGa > 1:6862812/1‑140 (MQ=255) aCTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTACAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGa > 2:718323/1‑140 (MQ=255) cTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGAt > 2:5044973/1‑140 (MQ=255) ggTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCa < 2:3531325/140‑1 (MQ=255) gTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCAc < 2:7549464/140‑1 (MQ=255) gTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTGTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCAc > 1:8338713/1‑140 (MQ=255) tttCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgg < 2:2078081/140‑1 (MQ=255) tttCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgg < 2:7244220/140‑1 (MQ=255) tCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgggg > 1:7833494/1‑140 (MQ=255) tCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTGTATCCACTTCCAGCGTTTGTGACAGCACTGACCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACgggg > 2:198883/1‑140 (MQ=255) tCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCttt > 2:6004876/1‑140 (MQ=255) tCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCttt > 2:235247/1‑140 (MQ=255) cgcgAATCAAATTCCCCACCGCTTGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACTCGACCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGAAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCttgt > 2:8491703/1‑138 (MQ=255) cgcgAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCtttt > 1:6338795/1‑140 (MQ=255) ctCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGGTAATCAGCACTTCAATTAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTGCCAGCTTTTGTGACAGCTCTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGTTTACGCACGGGGTCTTTTTCCTg > 2:7634298/2‑140 (MQ=255) aTCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTg < 2:412139/140‑1 (MQ=255) cAAATTCCCCACCGCGTGTGTGTTAATCATCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTgcg < 2:7060926/140‑1 (MQ=255) aTTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCg > 1:2508613/1‑140 (MQ=255) ccGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGaa > 1:1467816/1‑140 (MQ=255) gcgGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATc > 1:6134895/1‑140 (MQ=255) gcgGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGGTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCCGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATc > 1:2718056/1‑140 (MQ=255) cgGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATcc > 2:4312049/1‑140 (MQ=255) gtgtgtTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCGTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACTCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATccacc > 2:4804000/1‑140 (MQ=255) gtgtgtTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATccacc < 1:2385995/140‑1 (MQ=255) | CGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGCGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACC > NZ_CP025268/3096402‑3096674 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |