| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,266,812 | T→C | *313* (TAA→TAG) | tdcA ← | transcriptional regulator TdcA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,266,812 | 0 | T | C | 99.1% | 1125.6 / NA | 330 | *313* (TAA→TAG) | tdcA | transcriptional regulator TdcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (180/147); minor base A (2/1); total (182/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
GTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > NZ_CP025268/3266675‑3266947 | atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc > 1:7403769/1‑140 (MQ=255) aTAGCAACCGGCAGATAGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACt < 2:5890321/140‑1 (MQ=255) aCCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTAtt > 1:6902741/1‑140 (MQ=255) aCCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTAtt > 2:1676535/1‑140 (MQ=255) cGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTaa < 1:7293316/140‑1 (MQ=255) cAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGTTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTg > 1:2055213/1‑140 (MQ=255) cAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTg < 2:91887/140‑1 (MQ=255) gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:7522612/140‑1 (MQ=255) gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:584179/140‑1 (MQ=255) gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:8393493/140‑1 (MQ=255) gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:8992597/140‑1 (MQ=255) gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:9159662/140‑1 (MQ=255) aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:2435907/140‑1 (MQ=255) aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:7567290/140‑1 (MQ=255) tCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 1:8669166/140‑1 (MQ=255) tCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 1:2929725/140‑1 (MQ=255) tCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 2:334875/140‑1 (MQ=255) gTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCg > 1:6218147/1‑140 (MQ=255) tATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGt > 1:2122602/1‑140 (MQ=255) gTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 1:6291631/140‑1 (MQ=255) tAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTac < 1:2566706/140‑1 (MQ=255) tAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTac < 1:5806380/140‑1 (MQ=255) aaTATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTTCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCTTCTaca < 2:62176/140‑1 (MQ=255) atatGCATTATAACACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 2:1918544/140‑1 (MQ=255) atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTTAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTTACCAACTTCTTTTAATTGCCTTCTTCTacac < 2:3924862/140‑1 (MQ=255) atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTNAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTNCCTTCGTCTacac < 1:5540086/140‑1 (MQ=255) atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAATACAAATAACTATCCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac > 2:8207432/1‑140 (MQ=255) atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTTCCTTCGTCTacac > 2:460891/1‑140 (MQ=255) atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 2:7907144/140‑1 (MQ=255) atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 1:4186891/140‑1 (MQ=255) tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTCACCGTAACCGACACCTGCACGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc > 1:1017671/1‑140 (MQ=255) tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc > 2:5066553/1‑140 (MQ=255) tGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCa > 1:6016139/1‑140 (MQ=255) tGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCa > 1:6770561/1‑140 (MQ=255) cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc < 1:6443065/136‑1 (MQ=255) cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt > 2:3510633/1‑140 (MQ=255) cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt > 1:3458618/1‑140 (MQ=255) aTTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATta > 1:5151772/1‑140 (MQ=255) ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 2:2386638/140‑1 (MQ=255) ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:8409676/140‑1 (MQ=255) ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 2:5551109/140‑1 (MQ=255) ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:8539659/140‑1 (MQ=255) ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:143368/140‑1 (MQ=255) ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGATTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 2:9052587/140‑1 (MQ=255) ttATAAAACCTCGTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 2:4724820/140‑1 (MQ=255) tataATACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCAGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAAAAAACAAAATACTATTAATTGCCTTCGTCTACACAAATtata > 2:5306582/1‑140 (MQ=255) tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 1:1160187/1‑140 (MQ=255) tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 1:1756809/1‑140 (MQ=255) ccTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa < 2:6719867/140‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa < 1:4373652/140‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa < 2:2084032/140‑1 (MQ=255) ctctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAAt > 1:7970687/1‑140 (MQ=255) ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGAt < 2:7273084/134‑1 (MQ=255) ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa > 1:712629/1‑137 (MQ=255) ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 1:4036031/1‑140 (MQ=255) ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 1:4955869/1‑140 (MQ=255) tCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTCTAAGATGAATActc > 2:4285370/1‑140 (MQ=255) cGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct < 2:1376543/140‑1 (MQ=255) cGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct < 1:7005458/140‑1 (MQ=255) cGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCAATTATAAGATGAATActct < 1:5519772/140‑1 (MQ=255) aaTTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCt > 2:5767789/1‑140 (MQ=255) aaTTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCt > 1:2790545/1‑140 (MQ=255) gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 2:8609080/1‑140 (MQ=255) gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:8932074/1‑140 (MQ=255) gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTcaacca > 1:4003865/1‑140 (MQ=255) gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAGTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 2:1601423/1‑140 (MQ=255) tAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCaa < 1:6742479/140‑1 (MQ=255) accgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTACGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGa > 1:1307618/1‑140 (MQ=255) ccgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAt > 1:879503/1‑140 (MQ=255) taaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATaa < 1:2493793/101‑1 (MQ=255) taaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgct > 1:2311204/1‑140 (MQ=255) aaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgctg < 1:4888616/140‑1 (MQ=255) accgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgctgc > 2:7721289/1‑140 (MQ=255) acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCtttttt > 1:4587709/1‑140 (MQ=255) gacagacaGGTTGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGAt < 1:8255937/140‑1 (MQ=255) acagacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCACAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGAtc > 2:8309089/1‑139 (MQ=255) cagacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATaa > 2:3069151/1‑140 (MQ=255) cagacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATaa > 2:4895204/1‑140 (MQ=255) gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:2866255/1‑140 (MQ=255) gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:7058704/1‑140 (MQ=255) gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 2:4437648/1‑140 (MQ=255) gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 2:1247914/1‑140 (MQ=255) gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:905431/1‑140 (MQ=255) gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:5296944/1‑140 (MQ=255) gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:3793888/1‑140 (MQ=255) acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 1:7763211/1‑140 (MQ=255) agGTGGATTATTTATGTGTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTCATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTGTAATACGCTCAttttt > 2:9100616/1‑140 (MQ=255) tttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATAcc > 2:7350507/1‑140 (MQ=255) tatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACcgc > 1:9251878/1‑140 (MQ=255) tatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGATAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACcgc > 2:1749422/1‑140 (MQ=255) tttAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCa < 1:6250085/140‑1 (MQ=255) tctaaaaaaaAACACATAACTAACCAACTTCAATTAATTTCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAAGTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCa < 2:6308154/138‑1 (MQ=255) taaataaaAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCata < 1:4471531/140‑1 (MQ=255) taaataaaAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCata < 2:8892702/140‑1 (MQ=255) aataaaAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATAtt > 1:317133/1‑140 (MQ=255) aaaaCAAATAACGAACCAACTTCTATTACTTGCCTTCGTCGACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCAGACCGCGGCATATTGTGc < 2:6902741/140‑1 (MQ=255) aaCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCca < 1:1513617/140‑1 (MQ=255) aaCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCca < 1:59166/140‑1 (MQ=255) aataacTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAgg > 2:2840231/1‑140 (MQ=255) ataacTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGt < 2:7058704/140‑1 (MQ=255) | GTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > NZ_CP025268/3266675‑3266947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |