| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,791,274 | A→G | C244R (TGC→CGC) | waaH ← | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,791,274 | 0 | A | G | 99.8% | 2216.1 / NA | 632 | C244R (TGC→CGC) | waaH | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (83/548); minor base T (0/1); total (83/549) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 644 total aligned reads displayed.
CGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATG > NZ_CP025268/3791138‑3791410 | cGTTGGCGGGTATGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCTCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:405609/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTACGACTATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACCCGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATGCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:9360196/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:399791/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:4430048/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:7808995/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:8590143/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:3052271/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:4268/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:7999428/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:8521407/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:1554177/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:9485193/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGAGAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:1845837/140‑1 (MQ=255)cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAAGTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:4984285/140‑1 (MQ=255)cGTGGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGTAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:8658249/140‑1 (MQ=255)cGTGGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:9168411/140‑1 (MQ=255) ttGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTaa < 1:37978/140‑1 (MQ=255) gCGGGTACGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAACTCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCt < 2:2955280/140‑1 (MQ=255) gCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCt < 1:1146320/140‑1 (MQ=255) gCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCt < 1:5187034/140‑1 (MQ=255) ggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTaa < 2:8818315/140‑1 (MQ=255) ccGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:4501123/121‑1 (MQ=255) cGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGtt < 2:6749322/140‑1 (MQ=255) ttGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAAtt < 1:6068531/140‑1 (MQ=255) tGCGCACCGCATGGCAAACACGCTATGCCACGTAAGGTATTTTCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCATAATATAGTGACGTTGATAATTa < 2:6993913/140‑1 (MQ=255) tGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATCATGTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATAGAGTGACGTTGAGAATTa > 2:2806949/1‑140 (MQ=255) tGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTg > 2:7651044/1‑127 (MQ=255) tGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTa < 1:2254175/140‑1 (MQ=255) gcACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAgg < 2:1055237/140‑1 (MQ=255) cACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGt < 1:3659394/140‑1 (MQ=255) cACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGt > 2:7107542/1‑140 (MQ=255) ccGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTTCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTTATAATTAAGGttt < 1:545324/140‑1 (MQ=255) ccGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATCGTGACGTTGATAATTAAGGttt > 2:5646567/1‑140 (MQ=255) ccGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGttt < 1:1708799/140‑1 (MQ=255) gCATGGCAAACACGCAACGCCTCGTAAGTTATTTGCTGCTGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGttttt < 1:9032640/140‑1 (MQ=255) ccATGGCACACACGCACGCCCTCCTAAGAAATATCCTGCTGACATTCCGCAAAACTCATAATATTGTCGGCACAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGTTAATTAAGGttttt < 2:5813927/139‑1 (MQ=255) gCACACACGAAATGCCTAGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGTATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTAGATTTAATTTATCCATCAGGCGGTTAATCTTAATATATTGACGTTTATAATTAAGGTTTTTATTcc < 2:3408204/140‑1 (MQ=255) gCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 2:1501474/140‑1 (MQ=255) gCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 2:1783593/140‑1 (MQ=255) gCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 1:7416076/140‑1 (MQ=255) cAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTccc < 1:7938660/140‑1 (MQ=255) cAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTccc < 2:3755272/140‑1 (MQ=255) cAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTGGATAATTAAGGTTTTTATTccc < 2:4856875/140‑1 (MQ=255) cAAACACGCAATGCCTCGGAAGGTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTACTTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATGccc < 2:5200771/140‑1 (MQ=255) aaCACGCACTGCCTCGTAAGTTATTAGCTGATGAAATTCCGGATAACTCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCtt < 1:5938428/140‑1 (MQ=255) aaCACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCtt < 1:4622363/140‑1 (MQ=255) acacGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTg > 1:5214124/1‑140 (MQ=255) cGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCt < 1:502540/140‑1 (MQ=255) aTGCCTCGTAAGTTCTTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCACTTGTCTATGc > 2:1607538/1‑140 (MQ=255) ccTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGAATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAc < 1:312754/140‑1 (MQ=255) tCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGACATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCg < 2:5479975/140‑1 (MQ=255) cGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGa < 1:3011050/140‑1 (MQ=255) tAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 2:2456411/140‑1 (MQ=255) tAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 2:3148271/140‑1 (MQ=255) tAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 2:7520439/140‑1 (MQ=255) tAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 1:1971016/140‑1 (MQ=255) gtaGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAACTCATAATTTTGTCGGCATAATTTCTAGTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTATTCTTAATATAGGGACGTTGATAATTTAGGTTTTTAGTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 2:6322370/138‑1 (MQ=255) aGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATACTTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATGTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATGAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCa < 2:9109367/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:5428452/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:3317267/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:7819237/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:2316847/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:123745/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:1045340/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:2570341/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:7107542/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:2779480/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAAGCATAATTTTGTCGTCATAATTTCGATTTACTTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:2245344/140‑1 (MQ=255) tATTTGCTGATGAAAGTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:8305541/140‑1 (MQ=255) tttGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGAc < 2:6513439/140‑1 (MQ=255) gCTGATGAAATTCCGGATAAATCATACTTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGta < 1:7592047/140‑1 (MQ=255) tgatgaAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGtatt < 1:6645570/140‑1 (MQ=255) tgaAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATg < 1:8047236/140‑1 (MQ=255) tgaAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATg < 2:4447572/140‑1 (MQ=255) tgaAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATg < 2:6141430/140‑1 (MQ=255) aTTCCGGATAACTCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGa < 1:2473410/140‑1 (MQ=255) ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAATGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:5939254/140‑1 (MQ=255) ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 1:7013685/140‑1 (MQ=255) ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 1:7300805/140‑1 (MQ=255) ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:4728230/140‑1 (MQ=255) gaccGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 1:6199805/138‑1 (MQ=255) ggATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACTTATTATGCAGataata < 2:2685496/140‑1 (MQ=255) gATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAatat < 1:6416303/140‑1 (MQ=255) aTAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGTTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATAtt < 2:1194079/140‑1 (MQ=255) aTCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTtata < 1:5755454/140‑1 (MQ=255) aTTTTGTCGGCATATTTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGa < 1:8135371/140‑1 (MQ=255) aTTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGa < 1:9378388/140‑1 (MQ=255) aTTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGa < 2:195237/140‑1 (MQ=255) aTTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGa < 2:3305147/140‑1 (MQ=255) tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTAtt < 1:8799696/79‑1 (MQ=255) tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGc < 2:3834598/140‑1 (MQ=255) gTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCt < 1:2084859/140‑1 (MQ=255) gTCGGCATAATTTCGATATAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATCTAGTGACGTTGATAATTAAGGATTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCt < 1:8409793/140‑1 (MQ=255) tCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAAGTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTc > 2:7327725/1‑140 (MQ=255) tCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGGGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTc < 1:6860049/140‑1 (MQ=255) gCATAATTTCGATTGAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGt < 1:487662/140‑1 (MQ=255) tCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATcgcg < 2:4377721/140‑1 (MQ=255) tttAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGcgcacg < 1:4196818/140‑1 (MQ=255) tAATGTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTAGTCCCGTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGcgcacgca < 2:3625118/140‑1 (MQ=255) ggcgggTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATg > 1:1433586/1‑140 (MQ=255) | CGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATG > NZ_CP025268/3791138‑3791410 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |