| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,965,748 | T→C | H134R (CAC→CGC) | gppA ← | guanosine‑5'‑triphosphate,3'‑diphosphate diphosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,965,748 | 0 | T | C | 99.8% | 2241.8 / NA | 638 | H134R (CAC→CGC) | gppA | guanosine‑5'‑triphosphate,3'‑diphosphate diphosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (364/273); minor base A (1/0); total (365/273) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 638 total aligned reads displayed.
GCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGTGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCAA > NZ_CP025268/3965614‑3965883 | gCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGa < 1:8842828/140‑1 (MQ=255) aGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGc < 1:1891409/140‑1 (MQ=255) aGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGc < 2:6834076/140‑1 (MQ=255) aGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGc < 2:7198320/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:1577564/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 2:5582124/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:4986865/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:4434691/140‑1 (MQ=255) cGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATTTCCACCACCAGGCGCTGATCGGCaccacc > 2:6560940/1‑140 (MQ=255) gATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca < 2:6432892/140‑1 (MQ=255) gATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca < 2:2446433/140‑1 (MQ=255) gATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca < 2:5858703/140‑1 (MQ=255) gATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca < 1:3153686/140‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAg < 1:4696164/140‑1 (MQ=255) tAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGc < 2:3130343/140‑1 (MQ=255) aGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCa < 2:8355994/140‑1 (MQ=255) aGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCa < 1:6366172/140‑1 (MQ=255) ttCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGc > 2:75914/1‑140 (MQ=255) tCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGcc < 1:2262106/140‑1 (MQ=255) cagccagGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCt < 1:7572529/140‑1 (MQ=255) gccagGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGa < 2:1544511/140‑1 (MQ=255) gTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAAt > 2:5893781/1‑140 (MQ=255) gTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAAt > 1:6779016/1‑140 (MQ=255) gTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTGACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAAt < 1:9510156/140‑1 (MQ=255) aCGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAg > 1:2811173/1‑140 (MQ=255) cGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGa > 2:4897784/1‑140 (MQ=255) cGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGa > 1:2878222/1‑140 (MQ=255) aGCCCTTCGACTGGCAGTACAACGATGTGGTTAGTGCACCAGTGCCGGTTACCAGTACAGTACGGGCTCCTCCTAAATCCTCCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGt < 2:1861595/140‑1 (MQ=255) aGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGTTTACCAGTTAATTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGAGAAATCAGACGt < 2:7045052/140‑1 (MQ=255) cccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTg > 1:7215056/1‑125 (MQ=255) cccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGc < 1:6431486/140‑1 (MQ=255) cccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCAGATAAATCAGACGTGc < 1:213180/140‑1 (MQ=255) aTCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTc < 2:334926/140‑1 (MQ=255) aTCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTc < 2:3601474/140‑1 (MQ=255) cGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCct > 2:4422011/1‑140 (MQ=255) gcccggCTGAACAACGAGGGGGTGTGGGCACCCGTGCCGGTTACCAGATCAGGACTGGCTCCGCCAAGATCCACCCCCACGCGCTGATCGGCCCCACCCGTGGTGTGAGCAAAGCCCTGATAACTCCCCCGAGCTTCctc < 2:891511/136‑1 (MQ=255) cAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCtt > 1:4285810/1‑140 (MQ=255) cAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCtt < 1:8339960/140‑1 (MQ=255) aGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTc > 2:8784344/1‑140 (MQ=255) gCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc > 2:3268463/1‑140 (MQ=255) gAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGc > 1:7403232/1‑140 (MQ=255) gAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGc > 1:2044486/1‑140 (MQ=255) acaacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTg < 2:2930263/140‑1 (MQ=255) acaacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTg < 2:569681/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 1:4627563/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc > 1:3099349/1‑140 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 1:5210594/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc > 2:7452902/1‑140 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 2:852893/140‑1 (MQ=255) gtggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTATTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTg < 1:3469950/140‑1 (MQ=255) tggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGt > 2:2176288/1‑140 (MQ=255) ggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTa < 1:5086486/140‑1 (MQ=255) tttGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTAcc > 1:8189977/1‑140 (MQ=255) tttGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTAcc > 1:588353/1‑140 (MQ=255) gtgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGa < 2:1427486/140‑1 (MQ=255) tgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGAc > 1:1676567/1‑140 (MQ=255) gCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACa > 1:7995615/1‑140 (MQ=255) cGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCga > 1:1003859/1‑140 (MQ=255) cGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTAGATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAACTCAGACGTGCGTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCga > 1:1246317/1‑140 (MQ=255) tGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCgaga < 1:9175026/140‑1 (MQ=255) tGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCgaga > 1:927525/1‑140 (MQ=255) tGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCgaga < 1:8569294/140‑1 (MQ=255) gTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTc > 2:4157602/1‑140 (MQ=255) ttCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCtt > 1:2517747/1‑140 (MQ=255) ttCAGTACTGGCTCCGCCTAGATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCtt > 1:1762956/1‑140 (MQ=255) cAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTCCCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTg > 1:8972096/1‑140 (MQ=255) cAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTg > 2:128869/1‑140 (MQ=255) tACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAACCCAGACGTGCTACCTCTTCACCGCTGATCACCTGTCCCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCa < 2:226924/140‑1 (MQ=255) tACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCa > 2:1714905/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCCCCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGTTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGCGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaca > 2:6682502/1‑138 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGACTTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 2:7384510/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:6965733/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:3397847/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:3804448/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:2370209/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:6101183/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGAGCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATCAAGCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 2:3880634/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCAACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGAGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACTTGCTACCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATGTCCTGCGCTTTGGCACTaaa > 2:6117164/1‑140 (MQ=255) ccGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATc < 2:7688988/140‑1 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca > 2:9184278/1‑37 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 2:462053/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 2:7899923/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 1:3943002/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 1:3866595/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 2:370813/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCAGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGAACCGGACAACCGAGAATATCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 2:7995859/1‑140 (MQ=255) ccTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAcc < 1:3280242/140‑1 (MQ=255) tatCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCa > 1:4889123/1‑140 (MQ=255) tatCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCa > 2:397159/1‑140 (MQ=255) ccaccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCACTAAAATCACCCGCATTGACg > 2:8113267/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTACCTGCGCTAAGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 2:5383549/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGAGAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 1:782811/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGAGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTTTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg < 2:2733581/140‑1 (MQ=255) ccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCa < 2:6299526/140‑1 (MQ=255) ccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCa < 1:4157602/140‑1 (MQ=255) ccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCa > 1:5465739/1‑140 (MQ=255) ccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCa < 1:5628/140‑1 (MQ=255) caGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCaa > 1:7119756/1‑140 (MQ=255) caGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCaa > 2:9391276/1‑140 (MQ=255) caGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCGTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGCCAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAAGAAAATCACCCGCATTGACGGCaa > 1:5793361/1‑140 (MQ=255) | GCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGTGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCAA > NZ_CP025268/3965614‑3965883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |