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Only 100 of 711 total aligned reads displayed.
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cgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggccgaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggccttttgaaagggagggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 2:9080835‑M2/120‑140 (MQ=255) tCGCTCGAATCGTACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTGCGCCGATGAGTGCTATCTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTTAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 2:2756708/140‑1 (MQ=38) tCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:3691479/140‑1 (MQ=255) tctagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatattttattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGc < 1:4621782‑M2/24‑1 (MQ=255) gCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 1:3525252/1‑140 (MQ=255) gCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCGTCCCCGATGAGTTAAAACTTTCACAATATACCCGATGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 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atcgaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa < 1:8129812/140‑1 (MQ=255) aaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 2:7290870‑M2/32‑1 (MQ=255) cttggtcgaagcttctcatccttccccgcttgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 2:629200‑M2/35‑1 (MQ=255) ttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTc > 2:8944349‑M2/105‑140 (MQ=255) ggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:8482175‑M2/38‑1 (MQ=255) ggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 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tgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGgc > 1:6393474/1‑140 (MQ=255) tgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGgc > 2:7000349/1‑140 (MQ=255) aTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGca < 2:7420560/140‑1 (MQ=255) ttATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcat > 2:2335426/1‑140 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTc > 2:1545036‑M2/20‑73 (MQ=255) gtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCatat > 2:4054058‑M2/18‑140 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGATGTCGATGTCGGCAGATTTAGAGTCTGGTCGGTGTGGCCGCTCGGGTACCCCACCTCGGGGGGATGCTTTGTAGTGGGCTGCTCGCGTCTCGGGAGGCGGGGCGcagcggcg > 2:6555677/1‑134 (MQ=9) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCaa > 2:7509351‑M2/15‑140 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCaa > 1:7987388‑M2/15‑140 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCaa > 2:2139287‑M2/15‑140 (MQ=255) gaaggattCGAACCTTCGCAGTCGATGTCGGCAGATTTCCAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcg < 2:7917961‑M2/132‑1 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgcg > 1:1913614‑M2/7‑140 (MQ=255) | GTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCT > NZ_CP025268/1293437‑1293712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |