| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,101,377 | T→C | *388* (TAA→TAG) | CXP41_RS05705 ← | IS3‑like element IS3 family transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,101,377 | 0 | T | C | 99.7% | 1097.1 / NA | 333 | *388* (TAA→TAG) | CXP41_RS05705 | IS3‑like element IS3 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (192/140); minor base A (1/0); total (193/140) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |