| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,156,813 | A→G | *318* (TAA→TAG) | fabH → | beta‑ketoacyl‑ACP synthase III |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,156,813 | 0 | A | G | 99.8% | 1433.4 / NA | 415 | *318* (TAA→TAG) | fabH | beta‑ketoacyl‑ACP synthase III |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (257/156); minor base T (1/0); total (259/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 415 total aligned reads displayed.
GGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAAGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGGCGCTGG > NZ_CP025268/1156676‑1156949 | gTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGAt > 1:2002121/1‑140 (MQ=255) gTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGAt < 1:2262954/140‑1 (MQ=255) gTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGAt < 1:3007900/140‑1 (MQ=255) gTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCCGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGAt > 2:9242114/1‑140 (MQ=255) tAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGTGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGAtt < 1:7138426/140‑2 (MQ=255) tAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATa < 2:8477848/140‑1 (MQ=255) tAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATa < 2:7039121/140‑1 (MQ=255) tAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATa < 1:8965816/140‑1 (MQ=255) ccTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGAt > 1:8630172/1‑140 (MQ=255) ctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaa > 2:9032758/1‑140 (MQ=255) ctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaa > 1:587908/1‑140 (MQ=255) ctGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaa > 2:4824258/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCCGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaa > 2:6812851/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaa > 2:2139477/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaaa > 1:3964749/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaaa > 1:7460848/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTaaaa > 1:4894323/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGACTTTGGCGGTGGATTCACCTGGTGCTCCGCGCTGGTTCGGTTCTAGGATATGGAGTaaaa > 2:3512217/1‑140 (MQ=255) cGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAAc > 1:725614/1‑140 (MQ=255) ccTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATg > 1:1647567/1‑140 (MQ=255) tctGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGAc > 1:4367080/1‑140 (MQ=255) tctGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGAc > 1:6168784/1‑140 (MQ=255) tGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGc > 2:6328426/1‑140 (MQ=255) gTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCa < 1:8221023/140‑1 (MQ=255) gTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTg > 2:274548/1‑140 (MQ=255) gTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTg > 1:7570691/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 1:8833074/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 2:5106842/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 2:1962441/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 1:6346826/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 2:6001008/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGc > 1:6922903/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATAAAAACATGACGCAATTTGc > 1:5039369/1‑140 (MQ=255) cgcgcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCAt > 2:3857537/1‑140 (MQ=255) cgcgcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTGTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCAt > 1:2416817/1‑140 (MQ=255) gcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtg > 1:5708667/1‑140 (MQ=255) gcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtg > 2:5360316/1‑140 (MQ=255) gcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCGAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtg > 1:1004847/1‑140 (MQ=255) gcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCGGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtg > 2:6574527/1‑140 (MQ=255) gcTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCAATAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAAGTTGCATAtg > 2:3933445/1‑140 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 1:7039411/140‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 2:8401429/140‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 1:8469029/140‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgt < 2:8819158/140‑1 (MQ=255) tGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTtgtg > 2:1732953/1‑140 (MQ=255) gATGAATCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCAGGGTCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTAGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGtt < 2:426935/140‑1 (MQ=255) tGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTcc < 1:5103700/140‑1 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGGCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTGTCGAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg < 2:6934222/140‑1 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCTATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 1:1784588/1‑140 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 1:1416123/1‑140 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTGTGGCGGGGGAGTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCGAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg > 2:8017397/1‑140 (MQ=255) tACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGCTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAg < 2:738333/140‑1 (MQ=255) cgcgACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACCCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAggg < 2:6265737/140‑1 (MQ=255) gACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTtc > 1:4685956/1‑140 (MQ=255) gggCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCa < 2:6428016/140‑1 (MQ=255) gcgcATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCaaa > 1:6606414/1‑140 (MQ=255) gcgcATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCATTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTGTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCaaa < 1:9209415/140‑1 (MQ=255) gcgcATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTAGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTAGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCaaa > 2:8958611/1‑140 (MQ=255) tAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTg < 1:3404830/140‑1 (MQ=255) cGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATg < 1:2719294/140‑1 (MQ=255) ggCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATgctg > 2:7782355/1‑140 (MQ=255) ggCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATgctg > 2:7654600/1‑140 (MQ=255) cAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATgctggc < 2:9335813/140‑1 (MQ=255) cAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATgctggc < 1:9306507/140‑1 (MQ=255) gTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGCTTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATgctggctg > 2:308579/1‑140 (MQ=255) gTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATgctggctg > 2:1412821/1‑140 (MQ=255) ggTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGata < 1:5461085/140‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCCCCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcg < 1:780096/140‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcg < 2:4372619/140‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcg < 1:4077872/140‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcg > 1:4575069/1‑140 (MQ=255) tGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcg < 1:8743333/140‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcg < 1:5541346/140‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTCTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcg < 2:7231297/140‑1 (MQ=255) gCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAAGTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcgg > 2:7507556/1‑140 (MQ=255) cTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcggc > 2:4661716/1‑140 (MQ=255) cTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATggcggc < 2:2517998/140‑1 (MQ=255) ttGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGgcggcg < 1:9110540/140‑1 (MQ=255) gAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAg < 1:2105336/140‑1 (MQ=255) tttGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATcc < 2:785123/140‑1 (MQ=255) tGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTCTCCAATTGTCGAAGAAACGtt > 1:3662236/1‑140 (MQ=255) ggggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGttt < 2:2898256/140‑1 (MQ=255) gggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTTGGATATGGATTAATACATGACGCATTTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTATCAAACAGTTGGAATGCTGGCTGCTATGGCGGCGAGCGATCCTGTTGTCGAAGAAACGGTTg > 2:5754517/1‑140 (MQ=255) gggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCTGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTg > 1:260685/1‑140 (MQ=255) gggCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTg > 1:735983/1‑140 (MQ=255) gggCTCCGCGCTGGTTCGATTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGAATTTGTGTTCCCTGGCCAGGGTACTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCAAATTGTCGAAGAAACGTTTg > 2:497924/1‑140 (MQ=255) ccGCGCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGaa > 2:4507666/1‑140 (MQ=255) cgcgCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAg > 1:6851393/1‑140 (MQ=255) cgcgCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAg > 2:3661144/1‑140 (MQ=255) cgcgCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAg > 2:1307899/1‑140 (MQ=255) cgcgCTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAg > 2:8719001/1‑140 (MQ=255) cgcgCTGGTTCGTTTCGAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCGGGACAGGGATCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATCTGGCTGCGAGCGATCCAATGGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAg > 2:5226392/1‑140 (MQ=255) gcgcTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGc > 2:112413/1‑140 (MQ=255) cTGGTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTc > 1:1275382/1‑140 (MQ=255) ggTTCGTTTCTAGGAGAAGGATTAAAACATCACGCAATTGGCATTTGTGTTCCCTGGCCTGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGATCTAGCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCATCTg < 2:820351/140‑1 (MQ=255) ggtCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTTGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATCTGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTgc < 2:1049991/138‑1 (MQ=255) gTTCGTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTgc > 1:5276876/1‑140 (MQ=255) gTTTCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTgcggcg < 1:9394200/140‑1 (MQ=255) tttCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGgcgc < 1:1491711/140‑1 (MQ=255) ttCTAGGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGGCGCt < 1:7635147/140‑1 (MQ=255) | GGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCTCCGCGCTGGTTCGTTTCTAAGATAAGGATTAAAACATGACGCAATTTGCATTTGTGTTCCCTGGACAGGGTTCTCAAACCGTTGGAATGCTGGCTGATATGGCGGCGAGCTATCCAATTGTCGAAGAAACGTTTGCTGAAGCTTCTGCGGCGCTGG > NZ_CP025268/1156676‑1156949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |