Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 1,643,849 | T→C | *166* (TAA→TAG) | rzpQ ← | DUF2514 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 1,643,849 | 0 | T | C | 99.5% | 708.4 / NA | 204 | *166* (TAA→TAG) | rzpQ | DUF2514 domain‑containing protein |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCTTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTC > NZ_CP025268/1643718‑1643985 | taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:6795183/1‑140 (MQ=255) taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:4336467/1‑140 (MQ=255) taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:6823446/1‑140 (MQ=255) aataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa < 1:6501218/140‑1 (MQ=255) 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2:8460135/1‑140 (MQ=255) ttAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGt < 2:5197367/140‑1 (MQ=255) tACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCAtt > 1:1713404/1‑140 (MQ=255) | TAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCTTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTC > NZ_CP025268/1643718‑1643985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |