Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,472,140 | C→T | A84A (GCC→GCT) | yfdG → | bactoprenol glucosyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,472,140 | 0 | C | T | 99.5% | 2326.8 / NA | 592 | A84A (GCC→GCT) | yfdG | bactoprenol glucosyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (321/267); minor base A (1/2); total (323/269) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 595 total aligned reads displayed.
TTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472003‑2472276 | cGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGctgctg > 2:3410908/1‑140 (MQ=255) ttCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATg < 1:6534184/140‑1 (MQ=255) tCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgc > 2:6777594/1‑140 (MQ=255) tCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgc > 2:4986747/1‑140 (MQ=255) gTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgcgc < 1:5263035/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCa < 1:5679865/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCa < 2:107860/140‑1 (MQ=255) cTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccc < 2:6668506/140‑1 (MQ=255) gtgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccccc < 1:2324930/140‑1 (MQ=255) aGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgat > 1:7784909/1‑140 (MQ=255) ttgaGCTTCTTCGCGAAGGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGGTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgatgat < 2:5375489/137‑1 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGAATTCAAAATTCACATTCCAGGCATCGACTACAACGAGGCGCGACAAGCGATATGTTGGGGTCAGGGGGACACGGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATaa < 2:2762644/140‑1 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATaa > 1:2486219/1‑140 (MQ=255) aGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTTCATGCGATATGGTGGGTTCAGGGGGACGCTGAGTGCTAGTGTTGGTTGGGCTGCTGATAGATGCGCTCTTCCCCCGCTGATAAc > 2:8959717/1‑140 (MQ=255) cttcttCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAActc < 2:8316744/140‑1 (MQ=255) tcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTc < 2:9228567/140‑1 (MQ=255) cacaTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCa > 2:5612202/1‑140 (MQ=255) aTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGcc < 1:274423/140‑1 (MQ=255) cAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTgg > 2:4588061/1‑140 (MQ=255) ggCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGgtgt < 1:3298156/140‑1 (MQ=255) gCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGtgtg < 1:9278694/140‑1 (MQ=255) tCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACCCTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGTTAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCgg > 2:7846539/1‑140 (MQ=255) tCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCgg > 2:1389324/1‑140 (MQ=255) gACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGtt > 1:7565291/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTCTTCa > 1:8158090/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:4069546/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:8461527/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 1:323718/1‑140 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa > 1:7721791/1‑140 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa > 1:4379549/1‑140 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACGTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa < 2:6305336/140‑1 (MQ=255) cgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaaa < 2:4325335/140‑1 (MQ=255) cTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGt > 2:2036253/1‑140 (MQ=255) cTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGt < 1:7383782/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 2:2196697/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:9004074/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:3906134/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:3798426/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:8268226/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 2:302966/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:6777477/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 1:7038726/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 1:2138899/140‑1 (MQ=255) gCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTg > 1:1723660/1‑140 (MQ=255) tataTGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTc > 2:5272736/1‑140 (MQ=255) tataTGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTc > 2:2367138/1‑140 (MQ=255) tatGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCtt > 1:9167998/1‑140 (MQ=255) atGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCttt > 1:3513631/1‑140 (MQ=255) gTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAg > 2:2889858/1‑140 (MQ=255) gTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAg > 2:574457/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 1:5852290/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 1:4593310/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:6162814/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 2:7180071/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 2:3922737/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt < 1:1604458/140‑1 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:4270233/1‑140 (MQ=255) gTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATg < 1:9418409/140‑1 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa < 1:5081385/140‑1 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa < 2:7708271/140‑1 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 2:3282505/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa < 2:6885311/140‑1 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 2:8591506/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGAGCACATCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCTGCTATACAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 2:3773905/1‑140 (MQ=255) gggACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCACCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATg < 1:5532138/140‑1 (MQ=255) gACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGaa > 1:8008217/1‑140 (MQ=255) acacTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAg < 1:4699686/140‑1 (MQ=255) cacTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGa > 1:1365250/1‑140 (MQ=255) tcTGAGTGCTACTGTTTGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTACCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTATCCGCGATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:7468689/139‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:3048788/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:6877045/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:8049872/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:610379/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGCATGGGCAGCTGAGAGAAGCGCACGTCCCCCGATCAAAACTCTTGACACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTCTGCGGTTTCGGCTCATCAAAGTACAATGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:4195038/140‑1 (MQ=255) tGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat > 2:1687738/1‑140 (MQ=255) tGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat < 1:4061518/140‑1 (MQ=255) gAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtc < 2:73303/140‑1 (MQ=255) gAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACGTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtc < 2:5964078/140‑1 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 2:4747182/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 1:1013205/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 2:723985/1‑140 (MQ=255) tGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATctct < 2:1595932/140‑1 (MQ=255) gCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCtt > 1:2010431/1‑140 (MQ=255) cTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTg < 2:8711671/140‑1 (MQ=255) tACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGt > 1:8449025/1‑140 (MQ=255) cTGTTGGATGGGCTGCTGTTAGATGCGCACTTCCCCCGTTGATAAATCTTGTCACATTCTCGGCAATCATCCTTGTGGGCGGTTTCGTCTATTAAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGtgg > 2:8852378/1‑138 (MQ=255) tGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGAGGCTAACTCTTGTCTCCTTCTCCGCCAGCAGCCTGGTGTGCGGGTTCGTCTTGTCAAAGTTCATTGTCTGTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGGAGt > 2:1306206/1‑140 (MQ=255) gTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCGCTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGtt < 1:1280101/140‑1 (MQ=255) ttGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTc < 2:2616054/140‑1 (MQ=255) ttGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTc > 1:4977086/1‑140 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt < 2:6484788/140‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt < 2:3668411/140‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt < 2:1872495/140‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt > 2:9097948/1‑140 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt < 1:1073104/140‑1 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGTGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 2:7619400/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 1:8585108/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 1:6575262/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc < 1:5935547/140‑1 (MQ=255) ggCTGCTGATAGATGCGCACGTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTGTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCtt < 1:8753997/140‑1 (MQ=255) | TTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472003‑2472276 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |