| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 2,649,037 | T→C | *771* (TAA→TAG) | pbpC ← | peptidoglycan glycosyltransferase PbpC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 2,649,037 | 0 | T | C | 99.4% | 1207.5 / NA | 350 | *771* (TAA→TAG) | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase PbpC |
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Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
TAAATTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGATTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCAC > NZ_CP025268/2648900‑2649172 | tAAATTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGATATGGCGCGGATTATAATGATCAACTGGGACGTTGACTATTGTTGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGacta < 2:1450371/140‑1 (MQ=255)tAAATTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGacta < 2:8798233/140‑1 (MQ=255) aTTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTg > 1:5780706/1‑140 (MQ=255) ttCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATg < 2:460349/140‑1 (MQ=255) 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aaTCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGc < 2:7177611/140‑1 (MQ=255) cgggACAAAACAGACTATTGCATGCCAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCACTTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGGTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCAtt < 2:6338385/139‑1 (MQ=255) gggACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTc > 1:1003492/1‑140 (MQ=255) cAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGaa < 2:3335680/140‑1 (MQ=255) aaaaCAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGaaa > 1:6472963/1‑140 (MQ=255) aaCAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATg < 1:1478053/90‑1 (MQ=255) aaCAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTACGCCATTCAGAAacc > 1:7807314/1‑140 (MQ=255) cAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAaccac < 2:6402679/140‑1 (MQ=255) cAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAaccac < 2:2659739/140‑1 (MQ=255) cAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGGTCGCCATTCAGAAaccac < 2:5821711/140‑1 (MQ=255) | TAAATTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGATTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCAC > NZ_CP025268/2648900‑2649172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |