| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 3,016,591 | T→C | *257* (TAA→TAG) | yqeC ← | selenium cofactor biosynthesis protein YqeC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 3,016,591 | 0 | T | C | 99.8% | 2121.1 / NA | 609 | *257* (TAA→TAG) | yqeC | selenium cofactor biosynthesis protein YqeC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (270/337); minor base A (1/0); total (272/337) | |||||||||||
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Only 100 of 609 total aligned reads displayed.
GGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑CTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGTTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTAA > NZ_CP025268/3016455‑3016727 | gggAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTa < 2:9326238/140‑1 (MQ=255)gggAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGCTa < 1:4539803/140‑1 (MQ=255)gggAGACGAGCCTCCGCTATCAACAATATGCGCCATAGCAAACGGACAACTTTGCTCTTCGAGTTTAGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGCATATCCACTCAGTAACCCCCAATACCCGGGCCGCTa < 2:3005665/140‑1 (MQ=255) ggAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATATCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACAAACCTCAATGGATATCCTTTCAGTAAACCGGAATACCCGGGCCGCTaa > 2:3200459/1‑140 (MQ=255) 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1:8759921/1‑140 (MQ=255) aCCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACAt > 2:2427421/1‑140 (MQ=255) aCCCGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACAt > 1:2296825/1‑140 (MQ=255) cccGGAATCCCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACAtt > 2:1830788/1‑140 (MQ=255) cccGGAATACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACAtt > 1:1957710/1‑140 (MQ=255) aaTACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGaa > 1:2682682/1‑140 (MQ=255) aaTACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGaa < 1:2735751/140‑1 (MQ=255) aaTACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGaa > 2:7450723/1‑140 (MQ=255) aaTACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGaa > 1:5799654/1‑140 (MQ=255) tACCCGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGaaaa > 1:746153/1‑140 (MQ=255) ccGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACg > 2:2131640/1‑140 (MQ=255) cGGGCCGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACgg > 1:7227321/1‑140 (MQ=255) gCCGCTAAGTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTa < 2:7831198/140‑1 (MQ=255) ccGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTTCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAACAACGGTTac > 2:2830564/1‑139 (MQ=255) ccGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCACTCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTaa > 2:3854164/1‑140 (MQ=255) ccGCTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATAACGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACAATGAGAAAAACGGTTaa > 2:3728476/1‑140 (MQ=255) | GGGAGTCGAGCCTCGGCTATCAACAATTTGCGCCATAGCAAACGGACAATTTTGCTCTTCGAGTTTTGCAGCCTCTGTGAAAATATTCATACCAACCTCAATGGATAT‑CTTTCAGTAACCCGGAATACCCGGGCCGTTAATTCACAAATCTGCGCGCGATTGCAGGATGTTCTTGTATATCGCCCAGCCAGATTGCCTCTACGTCGTGTTGTTGCAGCGGTTGAAGGAGCTCGCTTTGTGCAATCGCATTCTCACATTGAGAAAAACGGTTAA > NZ_CP025268/3016455‑3016727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |