| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,965,748 | T→C | H134R (CAC→CGC) | gppA ← | guanosine‑5'‑triphosphate,3'‑diphosphate diphosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,965,748 | 0 | T | C | 99.9% | 2317.5 / NA | 660 | H134R (CAC→CGC) | gppA | guanosine‑5'‑triphosphate,3'‑diphosphate diphosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (373/286); minor base A (0/1); total (373/287) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 661 total aligned reads displayed.
CCTGCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGTGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCAAG > NZ_CP025268/3965611‑3965884 | gCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGa < 1:1328461/140‑1 (MQ=255) ccccAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGAt > 2:8386708/1‑140 (MQ=255) cccAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATc < 1:2213278/140‑1 (MQ=255) cccAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACGGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATc < 2:2502356/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:5601629/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:884963/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:3861693/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 2:6459488/140‑1 (MQ=255) tACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcacca < 2:3049658/140‑1 (MQ=255) aCGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcaccac < 1:2682919/140‑1 (MQ=255) aCGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcaccac < 2:3584069/140‑1 (MQ=255) aCGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcaccac < 1:3745475/140‑1 (MQ=255) cGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCaccacc > 2:7645430/1‑140 (MQ=255) cGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCaccacc > 1:4543225/1‑140 (MQ=255) cGATCGGCAAAATAGCGTTCCACCCAGGTCACGCAGCCCATCGACAGTCTGAACAACGAGGTTGTTAGTGCACCCGTGCCGTTTACCAGTTAACTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCaccacc > 2:8216277/1‑140 (MQ=255) gATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca < 1:121124/140‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAg < 2:6253524/140‑1 (MQ=255) ggCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGc > 1:4305131/1‑129 (MQ=255) ggCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtgg > 2:7217080/1‑140 (MQ=255) gCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtggt > 2:7137195/1‑140 (MQ=255) aGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCa > 2:3291981/1‑140 (MQ=255) cGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAAc > 1:2128695/1‑140 (MQ=255) cGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAAc > 1:1684194/1‑140 (MQ=255) gTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACg > 2:6541572/1‑140 (MQ=255) ttCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCCCCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGc > 2:4561480/1‑140 (MQ=255) tCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGcc < 2:2397117/140‑1 (MQ=255) cagccagGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCt < 2:3894655/140‑1 (MQ=255) agccagGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTg < 1:8732834/140‑1 (MQ=255) gccagGTGACGCAGCCCTTCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTTCACCCGTGCCTGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCTACTATATCCACCACCAGGCGCTGATCTGCACCACCAGTGGTGTGAGCAAAGCCCTGa < 2:6083911/140‑1 (MQ=255) gccagGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGa < 1:6468678/140‑1 (MQ=255) gccagGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGa < 1:1069124/140‑1 (MQ=255) gTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAAt > 2:1225850/1‑140 (MQ=255) tGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATc < 1:4014898/140‑1 (MQ=255) aCGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCAGCATATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGAGTGAGCAACGCCCTGATAAATCat > 2:1775639/1‑139 (MQ=255) gCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGAc < 2:8076184/140‑1 (MQ=255) cAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca > 2:4945388/1‑108 (MQ=255) gCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTg > 2:6963882/1‑140 (MQ=255) cccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGc > 1:1847105/1‑140 (MQ=255) cccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGc > 1:8329189/1‑140 (MQ=255) ccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCt < 1:5038684/140‑1 (MQ=255) aTCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTc < 2:1942570/140‑1 (MQ=255) cGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCct > 2:2108415/1‑140 (MQ=255) ggCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCa > 1:5723161/1‑140 (MQ=255) ggCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCa > 2:2977272/1‑140 (MQ=255) ggCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCa > 1:5190224/1‑140 (MQ=255) gCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc < 2:8954631/140‑1 (MQ=255) gCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc > 1:7144863/1‑140 (MQ=255) cTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAcc > 2:2690824/1‑140 (MQ=255) tGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCg < 1:2979502/140‑1 (MQ=255) tGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCg > 1:5406628/1‑140 (MQ=255) tGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCg < 1:1456910/140‑1 (MQ=255) acaacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTg > 1:8387758/1‑140 (MQ=255) acaacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTg < 1:8521901/140‑1 (MQ=255) acaacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTg < 2:7788623/140‑1 (MQ=255) acGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATc < 1:9350344/140‑1 (MQ=255) acGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCAGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATc < 1:744504/140‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCa > 1:8926034/1‑140 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc > 2:5390208/1‑140 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc > 2:1309788/1‑140 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 1:4135052/140‑1 (MQ=255) tggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGt > 1:3540176/1‑140 (MQ=255) tggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGt > 1:8086417/1‑140 (MQ=255) gtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTAc > 2:73453/1‑140 (MQ=255) gtgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGa < 1:979609/140‑1 (MQ=255) gtgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGa < 1:9248305/140‑1 (MQ=255) gtgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGa < 1:6633174/140‑1 (MQ=255) cGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCga > 1:778687/1‑140 (MQ=255) ccGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAAt > 1:4408824/1‑140 (MQ=255) ttCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCtt > 2:4193505/1‑140 (MQ=255) ttCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCtt > 1:9097040/1‑140 (MQ=255) tACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCa > 2:1538916/1‑140 (MQ=255) cTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAAt > 1:6005112/1‑140 (MQ=255) cTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAAt > 2:5140852/1‑140 (MQ=255) gCTGCGCGTCTATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGTGCCACGCCCTGATAATGCAGACGTGCGTCCTCTGCACCGCTGATCACCTGTCCCGGTCAGGCGAGAGTTTGCTGCGGTTTGGcgggaca > 2:3815843/1‑134 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCACTaaa > 2:8462939/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 2:34596/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:5291511/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:6352885/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:736100/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:76485/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:798749/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 2:590472/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 2:2247069/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCACTAAAATCAc > 2:9223013/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCACTAAAATCAc > 1:6858160/1‑140 (MQ=255) cTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAccc < 2:4782704/140‑1 (MQ=255) tataTCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc > 2:8880372/1‑80 (MQ=255) atCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCAt < 1:7030568/140‑1 (MQ=255) atCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCAt > 2:5213460/1‑140 (MQ=255) accaccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGAc > 1:4842338/1‑140 (MQ=255) ccaccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACg > 1:2446081/1‑140 (MQ=255) ccaccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACg > 1:1002519/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 1:5481840/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATATCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 1:8699339/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGAAAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 2:8557724/1‑140 (MQ=255) ccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCa > 1:3475779/1‑140 (MQ=255) ccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCa < 1:3291981/140‑1 (MQ=255) caGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCaa > 2:4333297/1‑140 (MQ=255) caGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCaa > 2:5598201/1‑140 (MQ=255) caGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCaa > 2:5794203/1‑140 (MQ=255) | CCTGCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGTGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCAAG > NZ_CP025268/3965611‑3965884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |