| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,396,984 | T→C | G331G (GGT→GGC) | nnr → | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,396,984 | 0 | T | C | 99.5% | 1911.8 / NA | 550 | G331G (GGT→GGC) | nnr | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (368/179); minor base A (2/1); total (370/180) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 550 total aligned reads displayed.
CGAGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCCTG > NZ_CP025268/4396847‑4397120 | cGAGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCa < 1:2943407/140‑1 (MQ=255) aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:1148610/1‑140 (MQ=255) aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc < 2:7275164/140‑1 (MQ=255) aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:2391132/1‑140 (MQ=255) gTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCa > 1:3521803/1‑140 (MQ=255) cTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAaga > 1:6358024/1‑140 (MQ=255) tGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAagag > 1:3272739/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:1036178/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:2602004/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:213569/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACAGTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCCTGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGCCTGGGCCGATGGGGTGGTGCTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCCCGAGt > 2:6317223/1‑140 (MQ=255) cGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTgggg > 2:2653319/1‑140 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGa > 2:1827858/1‑140 (MQ=255) aaaaCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaaaa > 2:5999440/1‑140 (MQ=255) aaaaCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaaaa > 1:7650239/1‑140 (MQ=255) aaaaCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaaaa > 1:503260/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGCATGGGCCGATGTGGTGGTGAGTGGTCCCGGGCTGGGCCAGCACGGGTGGGGGAACAAAGCACTGct > 2:7111511/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:1250554/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:3111590/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAAGTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 2:3414517/1‑140 (MQ=255) ctgctgACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGt > 2:3513686/1‑140 (MQ=255) ctgctgACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGt > 1:599889/1‑140 (MQ=255) gctgACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTg < 1:4891616/140‑1 (MQ=255) gCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAttt > 1:7917305/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCACGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTGGAGAAtttt > 1:6450221/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 2:6153761/1‑140 (MQ=255) ggAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAc < 1:6604768/140‑1 (MQ=255) gAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCACAcc > 1:7137196/1‑140 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGCCTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:1380094/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:7256183/140‑1 (MQ=255) tGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCAGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgttg > 2:5337219/1‑140 (MQ=255) tGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTAACGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGAATGGTCCCTGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgttg > 1:8775881/1‑140 (MQ=255) tGGTGCAAGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGAAGTGGAGGTGATTGGACACGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCTCAAACAGAtgttg > 2:9053957/1‑140 (MQ=255) ggTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgttgt > 1:388422/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:1522699/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:2907094/1‑140 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGa < 2:7496252/140‑1 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGa > 2:1473037/1‑140 (MQ=255) tGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATg > 1:6565877/1‑140 (MQ=255) cccgACGCTGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATCGCCCGATGGGGTGGTGAATGGTCCCGGACTGGGCCACCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATATTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 2:7761264/137‑1 (MQ=255) aCTGACGTTGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTTATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 2:5162775/140‑1 (MQ=255) aCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 1:4209241/140‑1 (MQ=255) aCTCACGATGGACCCTCTTACCGAACGCCCGGACTGGGCCGAGGTGGGGGTCAATGGTCCCCGCCGGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAACAGCACGGCACCAAGTAGAGACTCTTCGCACCCCGAGGTTGTGGGATGCCg < 2:4987293/140‑1 (MQ=255) cTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGa < 2:6647205/140‑1 (MQ=255) cTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGa < 2:643801/140‑1 (MQ=255) cTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGACAGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGAATGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGa < 2:4419643/140‑1 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGACTTTTCGCAAACCGAGGTTGTGGGATGCCGATg > 2:7884026/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:5550827/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGGCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCCCTGCAAATAGTTGAGTATTTTCGCAAAGCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 2:3199089/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGAGTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGCTg > 1:2590293/1‑140 (MQ=255) aCGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAATCCGATGTTGTGGGATGCCGATGc > 1:9172936/1‑140 (MQ=255) cGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCa < 2:6804068/140‑1 (MQ=255) gATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCAt > 1:5660064/1‑140 (MQ=255) tGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTg > 1:2776112/1‑140 (MQ=255) tGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGACAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTg > 2:1619054/1‑140 (MQ=255) gACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGaa > 2:5640113/1‑140 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc > 1:2007151/1‑140 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctg > 1:7455218/1‑140 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctg < 2:5777372/140‑1 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGGTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctg > 1:8876796/1‑140 (MQ=255) ctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctgct < 2:4601119/140‑1 (MQ=255) ttACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAACAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctgctg < 2:2333466/140‑1 (MQ=255) ccGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGca > 2:218540/1‑140 (MQ=255) ccGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGca > 2:6935846/1‑140 (MQ=255) gAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaat < 2:85385/140‑1 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 1:6074440/1‑140 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 1:8588759/1‑140 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 1:4517092/1‑140 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 1:8136874/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAATGTTGAGAATGTTCGCAAACCGATGGTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:1886637/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGACTTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:9273049/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:7363863/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:5792986/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:1280222/1‑140 (MQ=255) gCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaat < 1:4737352/140‑1 (MQ=255) ccTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCaatcaatc > 1:4088812/1‑140 (MQ=255) gAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGa > 2:2901897/1‑140 (MQ=255) gAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTGGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGa > 1:6805817/1‑140 (MQ=255) ctGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGTGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 2:7605972/139‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:953864/140‑1 (MQ=255) gggCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAg > 1:5262468/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 2:7999259/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 1:457914/1‑140 (MQ=255) aTGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcac > 1:3591499/1‑140 (MQ=255) aTGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcac > 1:5348453/1‑140 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca > 2:8872370/1‑140 (MQ=255) gtggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATcg < 1:5736485/140‑1 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 2:8272947/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt < 1:1654688/140‑1 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 1:3410484/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 2:3829491/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa < 1:8705406/140‑1 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg > 1:8313458/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg < 1:9010095/140‑1 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 2:8458474/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 2:3592742/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 2:4751417/1‑140 (MQ=255) cccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgcc < 2:5454109/140‑1 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt > 2:6536162/1‑140 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt > 2:4086320/1‑140 (MQ=255) | CGAGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCCTG > NZ_CP025268/4396847‑4397120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |