| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,936,791 | (G)6→5 | pseudogene (1097/1180 nt) | purT → | formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,936,786 | 0 | G | . | 98.1% | 2457.9 / 27.1 | 526 | pseudogene (1092/1180 nt) | purT | formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/4); new base . (223/293); total (229/297) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 570 total aligned reads displayed.
ATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTG > NZ_CP025268/1936647‑1936925 | tGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTACGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgg > 2:382197/1‑140 (MQ=255) gTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgggg < 1:7428166/140‑1 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:1288689/140‑1 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGGAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 2:8388555/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGGAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:3267745/140‑1 (MQ=255) ccTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 2:5012460/1‑140 (MQ=255) cTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgggggtg > 2:8836660/1‑138 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa > 2:8238304/1‑140 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGACTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:6567541/135‑1 (MQ=255) cAGCTTCTGCCGTTATACTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGCTAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa < 2:5280354/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGCATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:3808507/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:5742504/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:8504464/140‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:7249902/140‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTTATTCTGCCCCAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAGTGTGCAGAATGCCGAAGGCGCGGA‑GTTGCAGATTCGTGTATGTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg > 2:8050459/1‑140 (MQ=255) ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 1:488804/140‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 1:7555940/140‑1 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCGGAATGTCACGGTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTGATTTGGTACGCCGGATCTTGAGGGCTGCCGGCGGC‑GGGGGGTGGCACTggg > 1:9651998/1‑139 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 2:560395/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:5864779/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:9477730/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:3003788/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 2:1687284/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:4233946/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGGAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATGTGGTAAGCCGGAAATTGAGGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:4123121/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGGCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTAGTTGGTCAGCCGGAAATTGATGGCCGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACGGGc > 2:2228373/1‑140 (MQ=255) cTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCt < 1:9150463/140‑1 (MQ=255) tGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTa < 1:2110022/140‑1 (MQ=255) tGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTa < 1:1441040/140‑1 (MQ=255) tGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTa < 1:3344424/140‑1 (MQ=255) gTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGc < 1:5290924/140‑1 (MQ=255) ttATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 1:6311983/140‑1 (MQ=255) ttATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTGGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGTGGTGGCACTGGATACTGCa < 2:3513011/140‑1 (MQ=255) gtATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 2:4637584/139‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 1:2269478/140‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 1:7940156/140‑1 (MQ=255) cTGCCACAACTGACCAGTCAGAAGGTCACGTTTGATATTGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGATTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GTGGGTGGCTCTGGCTACTGCagagag < 2:6440333/140‑1 (MQ=255) gCCACAACTGACCAGTCAGTATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGGTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtg > 2:279830/1‑140 (MQ=255) gCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtg < 1:200314/140‑1 (MQ=255) aCTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGttgttg < 1:9349506/140‑1 (MQ=255) cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 2:231479/140‑1 (MQ=255) cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 1:5477938/140‑1 (MQ=255) gACAAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGAAGATTCGTTTATTTGGTAAGCAGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGATGTTGACg > 2:7195035/1‑140 (MQ=255) ccAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGcc > 1:6433865/1‑140 (MQ=255) tCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGTCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg < 2:9559118/140‑1 (MQ=255) tCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg < 2:4149290/140‑1 (MQ=255) aTGTCCCGTTTGATAATGTGCCGAATGCCGTAGGCGCAGT‑TTTGCCGATTCGGTTAGGTGGTGCGCCGGCCGTTGATGGCAGCCGTCGTGTGGGGGG‑GGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGGTGGTGACGCCATTGATcgc > 2:3998713/1‑140 (MQ=255) tttGATAATGTGCTGAATGCCGGAGGCGCCGA‑GTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATGGATGGCAGCCGTCGCCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGATGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 2:7013147/140‑1 (MQ=255) tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGCTTCGTTTAATTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 2:6012993/140‑1 (MQ=255) tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 1:1225404/140‑1 (MQ=255) tAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAcgccg > 2:1216367/1‑140 (MQ=255) tgtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGccgccg > 2:4367568/1‑140 (MQ=255) gtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCgg > 2:3114722/1‑140 (MQ=255) gtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCgg < 1:6540417/140‑1 (MQ=255) gtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCgg < 1:4017080/140‑1 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTTTTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCggc > 2:1947409/1‑139 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:8857828/140‑1 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 2:9028820/140‑1 (MQ=255) tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 2:9228198/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAgg < 2:334740/140‑1 (MQ=255) aaTGCCGTAGGCTCAGA‑TATGCAGATTCGTTTATTTGGTATGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGt < 2:9427543/140‑1 (MQ=255) aaTGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTCAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGt < 1:6079411/140‑1 (MQ=255) tGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 2:6868371/140‑1 (MQ=255) tGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 2:2115294/140‑1 (MQ=255) gCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaaa > 2:5655553/1‑140 (MQ=255) cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:2824841/1‑140 (MQ=255) cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:1033543/1‑140 (MQ=255) cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 2:9668176/1‑140 (MQ=255) cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:6972847/1‑140 (MQ=255) tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:8136055/140‑1 (MQ=255) tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:5578146/140‑1 (MQ=255) tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa > 1:178554/1‑140 (MQ=255) tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:769326/140‑1 (MQ=255) aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 1:3614300/140‑1 (MQ=255) aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 1:8693587/140‑1 (MQ=255) aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 2:9336636/140‑1 (MQ=255) aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 1:4326693/140‑1 (MQ=255) ggCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGGAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACa < 2:1101225/140‑1 (MQ=255) gcgcAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAg > 1:498757/1‑140 (MQ=255) gcgcAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAg > 2:870329/1‑140 (MQ=255) gcAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:61416/123‑1 (MQ=255) gCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAAccc > 1:4437298/1‑140 (MQ=255) gTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaaaa > 1:2464152/1‑140 (MQ=255) tttATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaaaaa > 1:6788743/1‑140 (MQ=255) ttATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaaaaaa < 1:9723693/140‑1 (MQ=255) ttATTGGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATAGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaacaaaa < 2:7307243/140‑1 (MQ=255) gCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACaaaaa < 1:6679727/140‑1 (MQ=255) ccGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAAAGCTAAAAAAAt > 2:7453766/1‑140 (MQ=255) gAAATTGATGTCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACCCTACAAAAATGcc < 1:6456039/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTTCTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGTAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAATCCGGCAAAAAAACGCTACAAAATTGcc < 2:1799839/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 2:760346/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 2:6221435/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 1:156747/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 1:4668802/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 1:8274806/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 2:4762113/140‑1 (MQ=255) gAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGcc < 1:8916105/140‑1 (MQ=255) ccGTCGTCTGGGGGG‑GGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGACGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCgg < 1:2634247/140‑1 (MQ=255) ccGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCgg < 1:5031694/140‑1 (MQ=255) ggggggTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTg < 2:1400083/140‑1 (MQ=255) | ATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTG > NZ_CP025268/1936647‑1936925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |