| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,244,790 | (C)6→5 | pseudogene (915/1042 nt) | galS ← | HTH‑type transcriptional regulator GalS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,244,785 | 0 | C | . | 99.4% | 2397.5 / 7.0 | 507 | pseudogene (920/1042 nt) | galS | HTH‑type transcriptional regulator GalS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base . (200/301); minor base G (0/3); total (201/306) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 537 total aligned reads displayed.
CACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCG > NZ_CP025268/2244647‑2244920 | acaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccc < 1:3515910/140‑1 (MQ=255) acaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccc < 2:1022621/140‑1 (MQ=255) aTTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctg > 2:3630014/1‑138 (MQ=255) aTTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctg < 2:2377402/140‑3 (MQ=255) aTTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCAGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctg > 1:9700745/1‑138 (MQ=255) gTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGt > 1:6782992/1‑140 (MQ=255) ttACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGtt < 2:5750880/140‑1 (MQ=255) aCATCGCCTGCTTTGTTGCGTTAGGGATCGCCGCCGCATTCAGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAACACAGGGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCg < 2:4363381/140‑1 (MQ=255) cGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTgg > 2:5014618/1‑140 (MQ=255) ccTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCt > 1:9322627/1‑140 (MQ=255) tGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTaa > 2:5980854/1‑140 (MQ=255) gATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAAt > 1:4736418/1‑140 (MQ=255) tttGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAAttt < 1:2644229/140‑1 (MQ=255) ttgttgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTc > 1:703674/1‑140 (MQ=255) gttgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGc < 2:5854382/140‑1 (MQ=255) gttgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGc < 1:4076928/140‑1 (MQ=255) ttgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGcc > 2:6486327/1‑140 (MQ=255) tgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCa > 2:8693180/1‑140 (MQ=255) gAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCAt > 2:329032/1‑140 (MQ=255) ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa > 1:8868109/1‑140 (MQ=255) ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 1:3656229/140‑1 (MQ=255) ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 1:4149003/140‑1 (MQ=255) ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 2:5414242/140‑1 (MQ=255) ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 1:5939833/140‑1 (MQ=255) ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 1:5514179/140‑1 (MQ=255) tAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGaa > 1:1294150/1‑140 (MQ=255) gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 2:1338375/140‑1 (MQ=255) gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:6650817/140‑1 (MQ=255) gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:5363436/140‑1 (MQ=255) gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 2:621577/140‑1 (MQ=255) gccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATggg > 1:3121684/1‑140 (MQ=255) ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 1:1939491/140‑1 (MQ=255) cgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAAc > 1:910740/1‑140 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 1:5153001/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 1:2191171/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 1:6196138/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:5549354/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:3149476/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 1:8799116/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 1:1794166/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGAACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:1862091/140‑1 (MQ=255) tcccgcctgtAGCGTCAGAATGGCGTCGCACTTTCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCACTATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACg < 2:2514036/133‑1 (MQ=255) cTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACgg < 1:7244023/140‑1 (MQ=255) tGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGt > 1:6057983/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCACTGGGATAACGCACGGTCg > 1:8336595/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCg > 2:6695545/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGCGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCCAGGCCAGTTCGGTGGCTAAGTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGt > 2:1566670/1‑140 (MQ=255) gCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTg < 1:4571791/140‑1 (MQ=255) gCGACAGAAAGGCGCCGCACTAACGTCGGCATAAACCAGTGGCTGGCACGCGGATCAATCTTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTg < 2:8828270/140‑1 (MQ=255) aCAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCgg < 1:5689915/140‑1 (MQ=255) aCAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCgg > 2:1434826/1‑140 (MQ=255) aCAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAAGTGCgg > 2:8371760/1‑140 (MQ=255) cAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCggg < 1:5615821/140‑1 (MQ=255) aGAATGGCGACTCACTAACGTCGGCATAAATCAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGt < 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gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 2:3732473/140‑1 (MQ=255) gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATAGTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 2:6320983/140‑1 (MQ=255) aaTGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCg > 1:3248676/1‑140 (MQ=255) cGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTa > 2:2724025/1‑140 (MQ=255) cGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACg < 1:4003941/140‑1 (MQ=255) cACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACggg > 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aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 2:3490701/140‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 1:8081093/140‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 1:7688603/140‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 2:8028964/140‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 2:1994141/140‑1 (MQ=255) tCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGa < 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1:1522155/1‑140 (MQ=255) ccTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAAt < 1:2381279/140‑1 (MQ=255) | CACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCG > NZ_CP025268/2244647‑2244920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |