Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 939,446 | (A)7→8 | intergenic (‑289/‑255) | trxB ← / → lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 96.3% | 3232.3 / 87.0 | 848 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (11/20); new base A (226/588); total (238/610) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1031 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC > NZ_CP025268/939300‑939572 | ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 1:2020477/1‑140 (MQ=255) ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 1:4655780/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 1:2663738/1‑140 (MQ=255) cTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaa > 1:2153317/1‑140 (MQ=255) cTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaa > 2:3576941/1‑140 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaa < 1:6862814/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaa < 1:8569686/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaa < 2:4101374/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGATTTATAAGCCGATTAAATGATGACTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaa < 1:6525782/140‑2 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaaca < 2:52695/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaaca < 1:2565264/140‑4 (MQ=255) aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCATGGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaacag < 2:6034574/140‑5 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCTATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaacagt < 1:5865730/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATTTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaacagt < 2:3862360/140‑6 (MQ=255) ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTa > 2:7061361/1‑140 (MQ=255) ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaaca > 1:8218561/1‑134 (MQ=255) ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACAGTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTc > 2:669454/1‑140 (MQ=255) cTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTta > 2:9185765/1‑140 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 1:8919182/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 2:6330953/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 2:824593/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 1:5012421/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 2:2663738/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 1:9045102/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 2:8397602/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 2:7841734/140‑1 (MQ=255) tagataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTtat < 2:1304953/137‑1 (MQ=255) ttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaa > 2:7426148/1‑126 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTatat < 2:1026969/140‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTatat < 2:8779354/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATgcg < 1:5182422/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATgcg < 2:9606753/140‑1 (MQ=255) aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGTCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATgcgc < 1:7613912/140‑1 (MQ=255) aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATgcgc < 1:5491044/140‑1 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCa < 2:5705916/140‑1 (MQ=255) gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATaa > 1:7111533/1‑140 (MQ=255) gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aaaaaaaa > 1:7830898/1‑117 (MQ=255) aTTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAAc < 1:3502509/140‑1 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aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:6202502/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:4077986/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:3119036/140‑1 (MQ=255) attatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGAATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgc < 2:1193498/137‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 1:4539283/140‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 1:145792/140‑1 (MQ=255) gatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcat < 2:2025182/140‑1 (MQ=255) tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 1:6984692/140‑1 (MQ=255) tgaATAAACGCCCATGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTTCTAAAAATCGATTTTTTGCTTTGACAATCCACTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:4403720/140‑1 (MQ=255) aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCAt < 2:4790496/126‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATTTTGTACTAAACATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:8658195/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:1183042/140‑1 (MQ=255) caaccGCCCCTGTGACTGACTATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTCTGACACTCCCCTGGTGTTTTGCTAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:6501390/136‑1 (MQ=255) aaaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATa > 1:9691576/1‑140 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTTCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 2:4652012/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:4326162/140‑1 (MQ=255) ccccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATg < 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aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 1:1671283/140‑1 (MQ=255) atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAg < 2:3348151/140‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:6402738/109‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:9533223/109‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACca > 1:1810495/1‑107 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt > 2:7716822/1‑118 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 1:2441105/140‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 1:8412369/140‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 1:6303/140‑1 (MQ=255) tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:3715302/140‑1 (MQ=255) tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:3024625/140‑1 (MQ=255) ggCATGTTGTACTAAACATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCAGGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAAt < 2:9449462/140‑1 (MQ=255) tgttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTAGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATTCATGTAAATACCATGATTACCGTGCTAGTGAAATCTAc > 2:2164276/1‑140 (MQ=255) gttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACg > 1:3306574/1‑140 (MQ=255) gttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACg > 1:9359162/1‑140 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:171365/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:8710055/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:7613297/140‑1 (MQ=255) tgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATTTGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTa > 1:7397131/1‑140 (MQ=255) tgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc > 1:1297795/1‑134 (MQ=255) tgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTa > 1:7711293/1‑140 (MQ=255) gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAt < 2:2353722/140‑1 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc > 1:3903111/1‑140 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc > 2:3201543/1‑140 (MQ=255) tCGATGTTTTTCTTTGACAATCCCCTGGTGTTGTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTCAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACa < 1:4834335/140‑1 (MQ=255) cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAg > 2:3748944/1‑140 (MQ=255) cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAg > 1:3021754/1‑140 (MQ=255) ttttGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg < 1:2891920/86‑1 (MQ=255) ttttGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg > 2:2891920/1‑86 (MQ=255) 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CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AAAAAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC > NZ_CP025268/939300‑939572 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |