Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,146,507 | +T | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK → | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,146,507 | 1 | . | T | 98.8% | 1952.3 / 9.5 | 507 | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/3); new base T (220/280); total (223/284) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 545 total aligned reads displayed.
ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑G‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639 | cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACACAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gt > 1:3267978/1‑139 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gt > 2:2280070/1‑139 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCAGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTCTCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAATCACGAAGAACAAA‑g‑gt > 1:8569942/1‑139 (MQ=255) ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtgac > 2:6320833/1‑136 (MQ=255) ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtgac < 1:3521397/140‑5 (MQ=255) ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtgac > 1:3376482/1‑136 (MQ=255) gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGtt > 2:9329546/1‑140 (MQ=255) aCAACTGGCGCTGGCATGTTCCGAGGCTTTCAACACCCAACACACAGCCGGATTGGATTCGAACGTCGAGGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTAGCGGTAAGCCCGCGGTGCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTg < 2:197654/140‑1 (MQ=255) aCTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCCAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGa > 2:5901157/1‑140 (MQ=255) cTGGCTCTGGCATTTGCCGAGTCTTTAAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATTCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 2:3625829/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 1:675775/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 2:510140/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 1:8947864/1‑140 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTGGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 2:2963827/140‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATc > 1:3983658/1‑140 (MQ=255) ggCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCg > 1:2907924/1‑140 (MQ=255) cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCCACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGt < 2:2150690/140‑1 (MQ=255) cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGt < 2:2490425/140‑1 (MQ=255) cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGt < 1:2005732/140‑1 (MQ=255) cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGc > 2:5433723/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGGTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGc < 1:3005964/140‑1 (MQ=255) tGGCAGTTGCCGCGGCTGACACCCCCCACCACCAAGCCGGACTTGATCCTAACGGCGATGCCGGTGCAGATTTCTGTGCTATCGGTACGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGGTGCGATCGGTGcc < 2:8488679/140‑1 (MQ=255) ggCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCa > 1:380117/1‑140 (MQ=255) ggCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCa > 2:3149210/1‑140 (MQ=255) cATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACg > 1:8260585/1‑140 (MQ=255) cATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACg > 1:9372309/1‑140 (MQ=255) tttGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGt < 2:9043012/140‑1 (MQ=255) gCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGAGCCACGGTAAc > 2:3041338/1‑140 (MQ=255) gAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAATATTTCATTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGa < 2:1499603/140‑1 (MQ=255) atgCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt < 1:3742906/138‑1 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GTT‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt < 2:4411945/140‑1 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 2:5599473/1‑140 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAAAACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGACACGGTAAATGAt > 1:2253241/1‑140 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 1:5433723/140‑1 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc > 1:6965938/1‑140 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 1:7892736/140‑1 (MQ=255) gCTCTCAACACCCAACACACAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 1:8062987/140‑1 (MQ=255) tCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAATAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTcc > 2:6031308/1‑140 (MQ=255) cAACACCGTACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGGGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCCATACACGAAAATCATA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTCACTGATGCCTCcg > 2:2603081/1‑140 (MQ=255) cAACACCCAACACTAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCGCGCGGTTCTGCAAAACACGATTAACATT‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCGACGGTTACTGATGCCTCcg < 2:1800015/140‑1 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 2:6520367/140‑1 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 2:5973392/140‑1 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 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ccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTAc > 2:83931/1‑140 (MQ=255) ccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTAc > 2:7954080/1‑140 (MQ=255) aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTACCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGATGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 1:7349929/1‑140 (MQ=255) acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 1:1566835/1‑140 (MQ=255) caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 2:7734522/140‑1 (MQ=255) caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 1:192419/140‑1 (MQ=255) caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 1:4685946/140‑1 (MQ=255) aGCCGGATTTGATNGTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCGACGGTAANTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAg > 1:6251680/1‑140 (MQ=255) gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa > 1:9544580/1‑140 (MQ=255) gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa < 1:8666723/140‑1 (MQ=255) cGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAATG‑T‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTTATGCCTCCGAGGTACTGGCGACAGAtt > 2:5271379/1‑140 (MQ=255) aTGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAAtc < 2:2774102/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:6538012/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:7541648/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:1005232/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:9487395/140‑1 (MQ=255) cGATGCCGGTGATGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGata < 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ccGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATaataat < 2:9651425/140‑1 (MQ=255) ccGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATaataat < 2:6183474/140‑1 (MQ=255) ccGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATaataat > 2:3471956/1‑140 (MQ=255) gTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAg > 2:4548122/1‑140 (MQ=255) tGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGt < 1:2722373/140‑1 (MQ=255) aGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGc < 1:2445229/140‑1 (MQ=255) tggCTCTCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCAcc < 1:7518747/138‑1 (MQ=255) tATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGcc > 2:3870936/1‑140 (MQ=255) tCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCtt > 2:3712426/1‑140 (MQ=255) aaGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAg < 2:5647434/140‑1 (MQ=255) cccGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCaa > 2:1007383/1‑140 (MQ=255) cccGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGGACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCaa < 1:4294977/140‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:4097235/140‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 1:5736462/140‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 1:6052349/140‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGGTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAAGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:6872394/140‑1 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATACTCATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCTGCAATAcc > 2:1293738/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 2:8997167/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 2:3385532/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 1:2116116/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 1:1855852/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 1:1706878/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATCATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 2:6627061/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc > 2:8096084/1‑126 (MQ=255) cacGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 1:7200441/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 1:7623167/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 1:847023/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGa > 1:5077624/1‑140 (MQ=255) cacGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAACGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTATTACGGTGa > 1:9797134/1‑140 (MQ=255) aaaaCAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCg > 1:1348608/1‑140 (MQ=255) | ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑G‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |