| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 183,437 | +A | coding (1144/1212 nt) | cdaR → | DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 183,437 | 1 | . | A | 99.6% | 1963.5 / ‑1.6 | 505 | coding (1144/1212 nt) | cdaR | DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base A (262/239); total (264/241) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
GCAACCGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCT > NZ_CP025268/183298‑183569 | cAACCGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑Tgga < 1:2580964/140‑2 (MQ=255) aCCGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑Tggatg < 1:1973869/140‑4 (MQ=255) cGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑Tggatgaa < 2:1215293/140‑6 (MQ=255) cGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑Tggatgaa < 1:106306/140‑6 (MQ=255) cGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑Tggatgaa < 1:1375020/140‑6 (MQ=255) cGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑Tggatgaa < 1:9168424/140‑6 (MQ=255) cGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑Tggatgaa < 1:5973956/140‑6 (MQ=255) cTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATCCCCTGGAGTATCGGCTTCATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAaga > 2:1767295/1‑140 (MQ=255) cTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAaga < 1:3406970/140‑1 (MQ=255) cTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTAATAGTAATACCGTGGAGTATCGGCTTACTCGTATATCGGAACTGACGGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGAGGCTGGATGTGGCGTTACACC‑TGGATGAaga > 2:3766691/1‑140 (MQ=255) ggCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGc < 1:8885072/140‑1 (MQ=255) ggCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGc < 1:2396426/140‑1 (MQ=255) gccaCGTCAAAGGCGTTGATTATTCATCGTAATACCCTTGAGTCTCGGCTTAATCGTCTATCGGAACTGACCGGGCGTGATTTGGGCCATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑GGGATGAAGAGCg < 2:5085325/137‑1 (MQ=255) aaCGTCAAAGGCTTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTTTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGt < 2:9284829/140‑1 (MQ=255) aaCGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGt < 2:5811774/140‑1 (MQ=255) tCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGt > 1:1240070/1‑140 (MQ=255) aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 1:1869477/140‑1 (MQ=255) aaaGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTa < 1:5343255/140‑1 (MQ=255) aGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATg < 1:3699206/140‑1 (MQ=255) aGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATg < 2:6915416/140‑1 (MQ=255) aGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATg < 2:6610535/140‑1 (MQ=255) gttgttTATTCATCGTAATACCCTGGNGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGtt < 1:7146756/140‑1 (MQ=255) gttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGtt < 1:8650832/140‑1 (MQ=255) ttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTa > 2:7223679/1‑140 (MQ=255) tgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑CGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTaa < 1:5093127/140‑1 (MQ=255) tATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGtt < 2:2803034/140‑1 (MQ=255) ttCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGtt < 1:7654521/125‑1 (MQ=255) cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 2:875777/140‑1 (MQ=255) cGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcgg > 1:2764592/1‑140 (MQ=255) cGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcgg > 1:5166667/1‑140 (MQ=255) gTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcggc > 2:5558870/1‑140 (MQ=255) tAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGgcggcg < 1:4115411/140‑1 (MQ=255) tACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTg > 1:8505436/1‑140 (MQ=255) tACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTg < 1:8255417/140‑1 (MQ=255) cccTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGc < 2:2617985/140‑1 (MQ=255) tGGCGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGAGTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGTGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 2:7393822/1‑140 (MQ=255) tGGAGTCTCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCGTGATTTGGGCAATTTTGATTACCGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGAGGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 2:8373867/1‑140 (MQ=255) tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 2:8581106/1‑140 (MQ=255) ggAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAt < 2:8054837/140‑1 (MQ=255) ggAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGATTGATGTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGAGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAt < 2:8879612/140‑1 (MQ=255) tATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATg < 2:6122270/108‑1 (MQ=255) tATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTTAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTccc > 2:7898461/1‑140 (MQ=255) tATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTccc > 2:5631107/1‑140 (MQ=255) tATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTccc > 2:1320149/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:4470389/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:4811889/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:3945144/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:5559237/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:8154309/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:2410784/1‑140 (MQ=255) tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:1510526/1‑140 (MQ=255) tCGGCGTACTCGTCTATCGGAACGGCCCGTGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAGTCCCCt < 2:9766077/140‑1 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc > 2:7509967/1‑140 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc > 2:194725/1‑140 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc > 2:2144000/1‑140 (MQ=255) cGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc > 1:1294536/1‑140 (MQ=255) cTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGc < 2:1016845/140‑1 (MQ=255) cTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGc < 1:2913263/140‑1 (MQ=255) cTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGc < 1:3619486/140‑1 (MQ=255) ttAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGcc > 1:5423188/1‑140 (MQ=255) tAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCgg < 1:929335/91‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCTGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 2:3298043/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGTCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 2:5744424/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:9460880/140‑1 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:8129482/140‑1 (MQ=255) aTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGa < 1:3274060/140‑1 (MQ=255) aTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGa > 2:6199016/1‑140 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGTGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 2:6998204/140‑1 (MQ=255) tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:6814035/140‑1 (MQ=255) cGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGt < 1:7426075/88‑1 (MQ=255) tatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTa > 1:8774610/1‑140 (MQ=255) atCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTag < 1:3928566/140‑1 (MQ=255) cacagACCGTGCATGAAGTGGTCAATTTTGATGACAGGTAGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTTGA‑TGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGATGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGACGGGTAGAgggg < 2:9420392/136‑1 (MQ=255) cTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGaa < 1:9676918/140‑1 (MQ=255) gACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATg < 1:4648555/140‑1 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTcccc < 1:503161/114‑1 (MQ=255) aCCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 1:4828891/1‑140 (MQ=255) ccGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGcc < 1:1692905/140‑1 (MQ=255) gCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGTGTAGAGGGGAATGCCCGaa > 2:5270200/1‑140 (MQ=255) gCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGaa > 2:3975124/1‑140 (MQ=255) gCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGaa > 2:3472134/1‑140 (MQ=255) gCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGaa > 2:9203120/1‑140 (MQ=255) gCTTGATTTGGGCAAGTTTGATGACAGGGTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAATAGCGGTAGGTTTTGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTGCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGaa < 2:9325786/140‑1 (MQ=255) aTTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAAc > 2:4236734/1‑140 (MQ=255) tGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGt < 1:2197045/140‑1 (MQ=255) ggCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCa > 1:7844474/1‑140 (MQ=255) ggCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCa > 2:957716/1‑140 (MQ=255) ggCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCa > 1:4496898/1‑140 (MQ=255) tgatgaCAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGa < 2:1628740/140‑1 (MQ=255) tgctgcTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCACAGCCCGACCGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcgcg < 2:4585818/140‑1 (MQ=255) ctgctgTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGtt > 2:6436218/1‑140 (MQ=255) gctgTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAg < 2:7715908/140‑1 (MQ=255) ctgTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGt < 2:5001073/140‑1 (MQ=255) tATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGtttt > 1:5785928/1‑140 (MQ=255) tgGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTNCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCa > 1:6277043/1‑140 (MQ=255) gCGTTACTAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCATCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTTCGCGTTAGTTTTTCCAGa < 1:7475705/140‑1 (MQ=255) cGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGCTTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:6416398/1‑140 (MQ=255) cGTGACAAC‑TGGATGCAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCGGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGCGAGTTTTTCCAGAt < 2:3221296/140‑1 (MQ=255) tACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:2092219/1‑140 (MQ=255) tACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGATGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAAACGTCAGTTAGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:6551655/1‑140 (MQ=255) | GCAACCGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCT > NZ_CP025268/183298‑183569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |