| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,786,415 | +C | pseudogene (334/4580 nt) | ypjA ← | adhesin‑like autotransporter YpjA/EhaD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,786,411 | 1 | . | C | 98.4% | 2802.8 / 29.5 | 813 | pseudogene (338/4580 nt) | ypjA | adhesin‑like autotransporter YpjA/EhaD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/7); new base C (407/393); total (413/400) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 879 total aligned reads displayed.
GCTACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑C‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGAACA > NZ_CP025268/2786273‑2786545 | tACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑cc < 2:7798556/140‑1 (MQ=255) tACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑cc < 1:6972015/140‑1 (MQ=255) ccaccaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑cccc < 2:6786189/140‑2 (MQ=255) accaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgt < 2:5773482/140‑4 (MQ=255) accaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgt > 1:7570878/1‑137 (MQ=255) accaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgt > 1:5128168/1‑137 (MQ=255) ccaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgtc < 1:1244870/140‑5 (MQ=255) caTCAATGAGTATTCCGTTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgtca > 2:8875848/1‑135 (MQ=255) caTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgtca > 2:5300724/1‑135 (MQ=255) caTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgtca < 1:263182/140‑6 (MQ=255) caTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgtca > 1:6564367/1‑135 (MQ=255) caTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑ccccgtca < 1:5291465/140‑6 (MQ=255) tCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATg > 2:1238270/1‑140 (MQ=255) tCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATg > 1:6768387/1‑140 (MQ=255) tCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCATCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATg > 2:3184519/1‑140 (MQ=255) aaTGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGACGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGaa < 1:8956307/140‑1 (MQ=255) tGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAAtt > 2:4700005/1‑140 (MQ=255) ttCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGt > 2:2470646/1‑140 (MQ=255) aTTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATACACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGc < 1:9716060/140‑1 (MQ=255) aTTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGc < 2:8295837/140‑1 (MQ=255) ttCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGcc < 2:937137/140‑1 (MQ=255) ttCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGcc > 2:1775439/1‑140 (MQ=255) ttCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGcc > 1:192027/1‑140 (MQ=255) tCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTACTTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa < 1:1635757/140‑1 (MQ=255) tCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa > 2:1426591/1‑140 (MQ=255) tCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa > 1:4777265/1‑140 (MQ=255) tCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa > 1:8830715/1‑140 (MQ=255) tCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa < 1:7498896/140‑1 (MQ=255) tCGCACTCCCTCCCACTTCGCGTGAAGCACCGACCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGAGTGCCACTCTCGAGTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CGCCCGTCATGAATGGACTGTCTGCCa < 2:5700163/140‑1 (MQ=255) cGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCAAc > 1:2275019/1‑140 (MQ=255) gCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCAcc > 2:3792760/1‑140 (MQ=255) ctccctccCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGtt < 1:3141419/140‑1 (MQ=255) tccctcccTCTACGCTTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTa < 1:775300/140‑1 (MQ=255) tccctcccTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAAGTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTa < 2:2714640/140‑1 (MQ=255) ccctccctCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 1:1443540/140‑1 (MQ=255) ccctccctCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 1:7973849/140‑1 (MQ=255) ccctccctCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 1:9364670/1‑140 (MQ=255) ccctccctCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 2:7973849/1‑140 (MQ=255) ctccctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTGTAGAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATg < 2:2173073/140‑1 (MQ=255) ccctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGt < 2:7271810/140‑1 (MQ=255) ccctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGt < 2:5033544/140‑1 (MQ=255) cctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGtt > 1:2971891/1‑140 (MQ=255) ctctACGCGTGAAGCACCGCCCTTACTGGTCGTTCCATTGCTGAGACCCCCTTTATAACCGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATGGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 2:8448257/140‑1 (MQ=255) cgcgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGTTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGtatta > 1:2075683/1‑140 (MQ=255) cgcgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGtatta > 2:3457824/1‑140 (MQ=255) cgcgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGtatta > 2:6246026/1‑140 (MQ=255) cgcgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑cc < 2:4197293/98‑1 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCCCCGTTAATGGTTGTattatt > 1:4597864/1‑140 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTattatt > 1:1004182/1‑140 (MQ=255) aaGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa < 1:1846838/116‑1 (MQ=255) aaGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa > 2:1846838/1‑116 (MQ=255) aaGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑c‑cc < 1:9532799/92‑1 (MQ=255) aaGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTAATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGACGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTCGTAGcc > 2:5168832/1‑140 (MQ=255) gCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg > 1:6346601/1‑140 (MQ=255) gCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCca < 1:423157/140‑1 (MQ=255) cccTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCACCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CACCCGTCAAGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTAGTAGCCTGCCCcac > 2:6000396/1‑140 (MQ=255) aTTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAAtt < 1:3531815/140‑1 (MQ=255) tCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTCATGGTTGTATTATTCGCCTGCCCCACAAAATTGTTa > 1:9766810/1‑140 (MQ=255) tCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTa > 2:2986182/1‑140 (MQ=255) cGTTCCATTGCTGAGACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTAt < 2:8600060/140‑1 (MQ=255) gTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATg < 2:4472573/140‑1 (MQ=255) gTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATg > 1:3788578/1‑140 (MQ=255) ttCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGa > 2:1692607/1‑140 (MQ=255) ttGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTcc > 2:3941960/1‑140 (MQ=255) cTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCtat > 1:8257229/1‑140 (MQ=255) tGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCtata < 1:4928425/140‑1 (MQ=255) attcccccTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATGGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCCTGAATTGACTGTCTGCCCCGGGTAATGGTTGTATTCTTAGCCTGACCCTCCAAATTGTTATGACTTCCTGTATc > 2:1070006/4‑140 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTAAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATc > 2:4823657/1‑140 (MQ=255) tACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCt < 1:5738846/140‑1 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGatat > 2:9677169/1‑140 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGatat > 1:4076322/1‑140 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGatat < 2:9168092/140‑1 (MQ=255) tataAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATcca > 1:3363376/1‑140 (MQ=255) ataAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATccac < 1:2450634/140‑1 (MQ=255) aCGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa < 1:7322655/140‑1 (MQ=255) cGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAAGGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGAt > 2:7547675/1‑140 (MQ=255) cGTCCTGATAGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGAt > 2:8097061/1‑140 (MQ=255) gTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGAtt > 1:8388612/1‑140 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTc > 2:3331821/1‑140 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTc > 2:8978010/1‑140 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTc > 2:36208/1‑140 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAAATGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTc > 2:6591917/1‑140 (MQ=255) ccTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCa > 2:5545835/1‑140 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCaa > 1:4450095/1‑140 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCaa > 2:4343369/1‑140 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCaa > 2:5463804/1‑140 (MQ=255) aTTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATaa < 2:7686222/140‑1 (MQ=255) gCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc < 1:2795240/140‑1 (MQ=255) gCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc < 1:556347/140‑1 (MQ=255) cACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACtt < 1:6206799/140‑1 (MQ=255) ctctCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTcc < 1:8604008/140‑1 (MQ=255) tcGATTGTCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTTCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCCGATTCAATAAGACAACCAtt > 2:2863996/1‑140 (MQ=255) tCGTACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAACTTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATAcc < 2:8775551/140‑1 (MQ=255) tACCTGTGGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCg > 2:2043898/1‑140 (MQ=255) aCCTGTGGAAAGACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGc < 2:1590180/140‑1 (MQ=255) tgGAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGa > 1:8093198/1‑140 (MQ=255) ggAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc > 1:5913009/1‑80 (MQ=255) ggAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGaa > 1:6406704/1‑140 (MQ=255) ggAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGaa > 2:9489800/1‑140 (MQ=255) gAAATACC‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGAAc > 1:9081726/1‑140 (MQ=255) | GCTACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑C‑CCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGAACA > NZ_CP025268/2786273‑2786545 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |