| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 1292745 | 435 (0.760) | 20 (0.040) | 18/234 | 10.4 | 5.4% | noncoding (114/132 nt) | CXP41_RS06830 | RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | 1293574 = | 323 (0.660) | noncoding (66/85 nt) | CXP41_RS06855 | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP025268/1292587‑1292745‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCAT > NZ_CP025268/1293574‑1293691 TATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGA < 1:4511461/140‑1TATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGA < 1:4511390/140‑1TATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGA < 1:3293796/140‑1 cTGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAT < 2:3378815/139‑1 ATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAT < 1:1125985/140‑1 ATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAT < 1:9692474/140‑1 ATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAT < 1:2015381/140‑1 TGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGACGCGATG > 2:4540813/1‑140 TGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATG > 2:7728011/1‑140 TGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATG < 1:9500381/140‑1 TGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATG < 1:1140778/140‑1 GGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATTCGATTCGCTTATCCGACCTTCAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCGATCGGGCAAAATTCTCTCTGAGTAACAGGTTTTGATTATTTATTGAAGCGATGG < 2:1909707/140‑1 GGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGG > 2:7570055/1‑140 GGGCACGGTGCGGGGTGAGGTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGG < 2:2082341/140‑1 GGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTTTCCGACGTACAGGTGAGGATATTGTAGGCCCGGTATACGTGGTGCGATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTCAGGAAGCGATGGT < 2:7688849/140‑1 GGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATTTTGTAGGCCCGGTAAACGGGGTGCCATCGGGCGAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGT > 2:8247899/1‑140 GGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTCAACGTGGTGGCCTCGGGCACTATTTGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAGGGT > 2:9101132/1‑140 GGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGT > 2:6008589/1‑140 GGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGT > 2:9101426/1‑140 GCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTG < 2:349050/140‑1 GCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTG < 1:8828823/140‑1 CACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGG < 2:9488909/140‑1 CACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGG < 1:5425529/140‑1 CACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGG < 1:3728916/140‑1 ACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT < 1:2993186/140‑1 ACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT < 2:2487366/140‑1 ACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT < 2:5054813/140‑1 ACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT < 1:1585719/140‑1 ACGGTGCGGGGTGAGGTGTCGGATGCGCGTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT < 2:3144552/140‑1 ACGGCGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT < 2:7732816/140‑1 CGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGCTGCGCTTCGCTTATCAGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAAGAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTG > 2:3278497/1‑140 CGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTG < 2:9180876/140‑1 CGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTG > 1:7572976/1‑140 CGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTGGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTG > 2:3278490/1‑140 GGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGG > 1:4807815/1‑140 GGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCGTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTGTTGAGTATGTAAGGAAGCGATGGTGGTGG > 1:7487759/1‑140 GTGCGGGGTGAGTTGTCTGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGG < 2:842008/140‑1 GTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGG < 1:1667562/140‑1 GTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGG < 1:303600/140‑1 GTGCGGGGTGAGTGGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGG < 1:4625091/140‑1 TGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCCAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGGGGTGGGG > 2:1401650/1‑140 TGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGG > 1:9602779/1‑140 TGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGAGTATTTTAGGAAGCGATGGTGGTGGGG > 1:6483786/1‑140 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGCTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:1957863/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 1:2497209/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:2257755/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:2257530/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 1:3021344/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:5203458/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 1:2319719/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:3139400/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 1:2001663/140‑1 GCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGATTATCCGACCTACAGGGGATGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGTTTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:2045697/140‑1 GCGGGGAGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGTCCCGGTACACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACATGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:8279411/140‑1 GGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAG > 2:138190/1‑140 GGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAG < 1:8070655/140‑1 GGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAG < 2:6048818/140‑1 GGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGG > 2:2549864/1‑140 GGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTAACCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCTATATTAGCTGGGAGTAACAGGTGTTGAGTAGTTATGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGG > 2:8724604/1‑140 GTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGTTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGGAGGA < 2:517893/140‑1 GTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGA < 2:4196643/140‑1 GTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGA < 2:6403884/140‑1 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GTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCG > 2:2720366/1‑140 GTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCG > 1:7810701/1‑140 CGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGT > 1:2394939/1‑115 TTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATGATTTAAGGAAGTGCTGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAC < 2:3048956/140‑1 ATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGG < 2:7810701/140‑1 ACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG > 1:5155329/1‑105 ACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:5155329/105‑1 GGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGGAGTCGATGTCGGCTGTGTTACAGTC > 1:5478123/1‑140 GAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTG < 1:958612/140‑1 TATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGACCCTTCGAAGACGATGACGGCAGATTTACAGTCTTCTCCC > 1:6829272/1‑140 TGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACCGGTTTTGATTAGTTAAGGACGCGACGGTGGTGGGGGAAGGATTCGTACCTGCGACGTCGATGGCGGCAGTTGTCCAGTCTGCTCGCTTg > 1:8831956/1‑139 CCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG > 1:9034820/1‑80 CCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:9034820/80‑1 GTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGG > 1:5967353/1‑140 TCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCG > 2:5986312/1‑79 TCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCG < 1:5986312/79‑1 TCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG > 1:8292436/1‑62 TCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGG < 2:8292436/62‑1 CAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGC < 1:1924351/113‑1 AATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGG < 2:7344820/48‑1 ATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTT < 2:5967353/140‑1 GAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCA > 2:4432240/1‑76 GAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCA < 1:4432240/76‑1 TTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGA > 1:1454453/1‑43 TTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGA < 2:1454453/43‑1 CGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCAT < 2:6829272/140‑1 TATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP025268/1292587‑1292745‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCAT > NZ_CP025268/1293574‑1293691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |