Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NZ_CP025268 | 261979–262008 | 296291–296268 | 34261–34313 | 231 [229] | [228] 231 | [CXP41_RS01280]–intF | [CXP41_RS01280],ykfI,yafW,ykfH,ykfG,yafX,ykfF,CXP41_RS01315,CXP41_RS01320,CXP41_RS01325,CXP41_RS01330,yafZ,ykfA,perR,CXP41_RS01355,CXP41_RS01360,CXP41_RS01365,ykfC,CXP41_RS01385,mmuP,mmuM,fbpC,CXP41_RS01405,CXP41_RS01410,CXP41_RS01410,CXP41_RS01420,CXP41_RS01425,yagB,CXP41_RS24560,yagA,yagE,yagF,yagG,yagH,xynR,argF,argL,CXP41_RS01470,CXP41_RS01480,CXP41_RS01480,CXP41_RS01490,yagK,yagL,CXP41_RS01505,ykgV,CXP41_RS01515,intF |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
TTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGAT > NZ_CP025268/261839‑262024 | ttGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGtt > 1:5909806/1‑140 (MQ=255) ttGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGtt > 1:436848/1‑140 (MQ=255) tGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTc < 1:4672594/140‑1 (MQ=255) gATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCg < 1:6420653/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCAGCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCAGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 1:166876/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATTGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTTATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 2:5156627/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 1:6796734/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 2:899296/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 1:7236304/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 1:1941002/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 1:2104921/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa > 1:2509687/1‑140 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 2:1861623/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 2:4106273/140‑1 (MQ=255) aTTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTGAGTATTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGa < 1:7043394/140‑1 (MQ=255) ttCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGAc < 2:4922192/140‑1 (MQ=255) ttCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGAc < 2:1762385/140‑1 (MQ=255) ttCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGAc < 2:137862/140‑1 (MQ=255) tCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACt < 2:4832102/140‑1 (MQ=255) cacaAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTc < 2:7170033/140‑1 (MQ=255) acaAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTcc > 1:1107669/1‑140 (MQ=255) caAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCt < 1:4757100/140‑1 (MQ=255) caAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCt < 2:706219/140‑1 (MQ=255) caAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCt < 2:4422671/140‑1 (MQ=255) aaGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCta > 2:3176198/1‑140 (MQ=255) aaGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCta < 2:7152092/140‑1 (MQ=255) aGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCtat > 1:8599145/1‑140 (MQ=255) ggCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCtatt > 1:5639171/1‑140 (MQ=255) ccATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCtattat < 1:1824575/140‑1 (MQ=255) ccATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGGAGGTTCGACTCCtattat > 1:8714880/1‑140 (MQ=255) cATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATc > 2:2518547/1‑140 (MQ=255) ttGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCgg < 2:5993509/140‑1 (MQ=255) ttGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCgg < 2:9558356/140‑1 (MQ=255) ttGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCgg < 1:6119019/140‑1 (MQ=255) ttGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTACTTTCAGGGCCGATATAGCTCTGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCgg < 2:8572825/140‑1 (MQ=255) tGACGCATCTCCCGGTTAGTTTTAACCTTTTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGc < 2:6622057/140‑1 (MQ=255) tGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCGACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGc < 2:203157/140‑1 (MQ=255) ggACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTGGTCCACCGTGAGTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTACGTTCGACTCCTATTATCGGc < 1:7391850/139‑1 (MQ=255) gACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGATCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCa < 2:1680958/140‑1 (MQ=255) gACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCa < 1:5704554/140‑1 (MQ=255) gACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCa < 1:7685191/140‑1 (MQ=255) gCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCa > 2:312486/1‑140 (MQ=255) aTCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCAtt > 1:2923683/1‑140 (MQ=255) aTCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCAtt > 1:8493291/1‑140 (MQ=255) aTCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCAtt > 1:4790024/1‑140 (MQ=255) tCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCCGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTa < 2:1865277/140‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTa < 1:3588454/140‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTa > 2:2985691/1‑140 (MQ=255) tCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTa < 1:3966676/140‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTa < 1:720432/140‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTTAGTTTTAACCTGGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGGTCGACTCCTATTATCGGCACCATTa < 2:9426644/140‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTTAGTTTTAACCGTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTa < 2:2093746/140‑1 (MQ=255) cGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTaa < 1:7329184/140‑1 (MQ=255) gCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTaaa > 1:1550988/1‑140 (MQ=255) ggTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCa < 2:335704/140‑1 (MQ=255) ggTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCa < 2:3903221/140‑1 (MQ=255) ggTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCa < 2:5232540/140‑1 (MQ=255) ggTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCa < 2:8017448/140‑1 (MQ=255) gTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaa < 1:6833917/140‑1 (MQ=255) gTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaa < 1:8268257/140‑1 (MQ=255) ttAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaaa < 2:2232631/140‑1 (MQ=255) ttAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaaa < 1:6865212/140‑1 (MQ=255) ttAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaaa < 1:6233301/140‑1 (MQ=255) ttAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGACGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCCGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaaa > 2:4797759/1‑140 (MQ=255) ttttAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaaagagt < 1:7360022/140‑5 (MQ=255) ttttAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaaagagt < 2:4463470/140‑5 (MQ=255) aaCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAcc < 1:8073491/140‑2 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCTCGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 2:6451882/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 1:4070710/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 2:5684535/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 2:5424498/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 1:379489/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 1:4187856/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc > 2:6805665/1‑138 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 1:9207815/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 1:461517/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 1:7467640/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccc < 1:145879/140‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGACCTTTCAGGGCCGATATCGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAAGGCGCAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATGAGCGGCACCATTAAAATCAAAGCGTTAccc < 2:6187739/140‑3 (MQ=25) aCCTTGGCCTCCGTGCGTCACGTTCGTGCACATGTCCTTTCAGGGCCGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCTTTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTCAAATCAAAGAGTTAccc < 2:6384453/140‑3 (MQ=21) ccTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTGCAGGGCCGATATAGCTCAGTGGGTAGAGCCGCGCCTTCGGAAGGCGACGGTCGTAGGTTCGTCTCCTATTATCGGCACCAGTAATATCCAAGAGTTAcccc > 2:4889467/1‑137 (MQ=255) cTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAcccca < 1:2378672/140‑5 (MQ=255) cTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAcccca < 1:8584024/140‑5 (MQ=255) cTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAcccca < 1:5532431/140‑5 (MQ=255) cTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAcccca < 2:2630686/140‑5 (MQ=255) tGTCCACCGTGATTCCCGTTCGTGAACATGTCCTATCAGGGCCGATATAGCACAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccccata < 2:4313661/140‑7 (MQ=21) tGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccccata > 1:1019920/1‑134 (MQ=255) tGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccccata < 1:9564271/140‑7 (MQ=255) gTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCCTTAAAATCAAAGAGTTAccccatat > 2:3935628/1‑133 (MQ=25) gTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCACAGAGTTAccccctat > 2:7922460/1‑133 (MQ=25) gTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccccatat > 1:3959677/1‑133 (MQ=255) gTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccccatat > 1:7863088/1‑133 (MQ=255) gTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccccatat > 2:100692/1‑133 (MQ=255) gTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAccccatat > 2:2761666/1‑133 (MQ=255) gTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATGAAAATCAAAGAGTTAccccatct > 2:2648085/1‑133 (MQ=25) tGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCg < 2:5322617/75‑1 (MQ=255) tGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCg > 1:5322617/1‑75 (MQ=255) atatAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCaaagag < 2:2418451/86‑4 (MQ=255) atatAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAcc > 2:6605932/1‑90 (MQ=255) atatAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTAcc < 1:6605932/91‑2 (MQ=255) | TTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGAT > NZ_CP025268/261839‑262024 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |