| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,161,210 | A→G | *270* (TAA→TAG) | pabC → | aminodeoxychorismate lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,161,210 | 0 | A | G | 99.8% | 1691.3 / NA | 489 | *270* (TAA→TAG) | pabC | aminodeoxychorismate lyase |
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Only 100 of 489 total aligned reads displayed.
GAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTG > NZ_CP025268/1161073‑1161344 | gagTCGTTGCAGGCAGTTGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCCGCAACGTTATATGAATATTTATCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTc > 1:1703478/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGGATGTTCCTGTGGCGATGTCTCCGTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTATCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAAATAGTCAt > 1:5043461/1‑140 (MQ=255) tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCAtt > 1:2860381/1‑139 (MQ=255) gTTGCAGGCAGATGAGATTGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTAAGTGCCTGTGGCGTTTTCTCCTTTTAGTCATCAACGTTATATGTATATTTAGCCCCACATTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATTaa > 2:3919807/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 2:7667044/140‑1 (MQ=255) ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 1:6526081/140‑1 (MQ=255) ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 1:5331993/140‑1 (MQ=255) ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 1:7351697/140‑1 (MQ=255) ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTGATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 2:5129210/140‑1 (MQ=255) cgcCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAttt > 2:7131127/1‑140 (MQ=255) cgcCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAttt < 2:6243071/140‑1 (MQ=255) cccGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGAAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAc > 2:1201913/1‑140 (MQ=255) cGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAccc < 2:2726238/140‑1 (MQ=255) aaTTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTg < 1:9351065/140‑1 (MQ=255) | GAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTG > NZ_CP025268/1161073‑1161344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |