| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,867,449 | G→A | intergenic (‑205/‑137) | msrB ← / → gapA | peptide‑methionine (R)‑S‑oxide reductase MsrB/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,867,449 | 0 | G | A | 99.8% | 1748.1 / ‑5.6 | 449 | intergenic (‑205/‑137) | msrB/gapA | peptide‑methionine (R)‑S‑oxide reductase MsrB/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
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Only 100 of 450 total aligned reads displayed.
TGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGGGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAATAT > NZ_CP025268/1867312‑1867585 | ttcAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCGAGTCGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGTTGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGTGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGc < 2:7760949/138‑1 (MQ=255) cAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGa < 1:7500658/140‑1 (MQ=255) aaaaTTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGag > 1:793324/1‑140 (MQ=255) aaaaTTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGag > 1:8328655/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 1:8125698/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTACGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:4309549/140‑1 (MQ=255) gagTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAat > 2:906795/1‑140 (MQ=255) gagTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAat > 2:2428633/1‑140 (MQ=255) gTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAatat < 2:49445/140‑1 (MQ=255) | TGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGGGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAATAT > NZ_CP025268/1867312‑1867585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |