Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 2,108,533 | T→C | I6V (ATC→GTC) *197* (TAA→TAG) |
wbbK ← wbbJ ← |
glycosyltransferase family 1 protein DapH/DapD/GlmU‑related protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 2,108,533 | 0 | T | C | 99.6% | 1774.0 / NA | 511 | I6V (ATC→GTC) *197* (TAA→TAG) | wbbK wbbJ | glycosyltransferase family 1 protein DapH/DapD/GlmU‑related protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (213/296); minor base A (2/0); total (215/296) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 511 total aligned reads displayed.
ATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAA > NZ_CP025268/2108396‑2108669 | ctttctttTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGACAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCt > 1:9190147/1‑140 (MQ=255) tttAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCAAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTcc < 1:7179411/140‑1 (MQ=255) ttAACTCTTTATCTGAATTGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTccc < 2:7176912/140‑1 (MQ=255) ttAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTccc < 1:4803686/140‑1 (MQ=255) 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aacatcGACTATGCTTTTTCCAATAATTTGGTCTCATGTTTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGAAATGACAGTATTTTCGGGAATATAACCTATAACTACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTAcc < 1:4383976/140‑1 (MQ=255) aacaacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTAcc < 1:7755030/140‑1 (MQ=255) acaacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCa < 1:9298715/140‑1 (MQ=255) cGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCaataa < 1:1879759/140‑1 (MQ=255) | ATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAA > NZ_CP025268/2108396‑2108669 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |