| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 2,457,300 | T→C | pseudogene (1737/2646 nt) | yfcU ← | fimbrial usher protein YfcU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 2,457,300 | 0 | T | C | 99.7% | 2665.6 / NA | 761 | pseudogene (1737/2646 nt) | yfcU | fimbrial usher protein YfcU |
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Only 100 of 761 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) gAAATCTACATGCCCTTATCCGCCCGGTTGTCATACTCGTAGCGGTAGCCAGTCAGGGAAACGCTCATATTACGAATGCTGCCCATATTGATTTAGTGGGAGAGCTTGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATCCCa < 2:5131666/140‑1 (MQ=255) aaaTCTACATGCCCTTATCCGCCCGGTTGTCATACTCGTAGCGGTAGCCAGTCAGGGAAACGCTCATATTACGAATGCTGCCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATCCCAg < 2:246961/140‑1 (MQ=255) aaaTCTACATGCCCTTATCCGCCCGGTTGTCATACTCGTAGCGGTAGCCAGTCAGGGAAACGCTCATATTACGAATGCCGCCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATCCCAg < 2:9639730/140‑1 (MQ=255) aaTCTACATGCCCTTATCCGCCCGGTTGTCATACTCg > 1:173998/1‑37 (MQ=255) aaTCTACATGCCCTTATCCGCCCGGTTGTCATACTCGTAGCGGTAGCCAGTCAGGGAAACGCTCATATTACGAATGCTGCCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATCCCAGt < 1:3147955/140‑1 (MQ=255) | GTGCCGATGTTCAACTGATAGTGAGTCGCGTCATCGACACGGCTAAAATAACCGACCTGGCTGCTGTCCGTCCCACTGCCATAGTTGCCGTTATAGCTAACGGTACTGTTGTCGCCCCACGGCATACTGAGCGAAATTTACATGCCCTTATCCGCCCGGTTGTCATACTCGTAGCGGTAGCCAGTCAGGGAAACGCTCATATTACGAATGCTGCCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATCCCAGT > NZ_CP025268/2457163‑2457436 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |