| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,472,140 | C→T | A84A (GCC→GCT) | yfdG → | bactoprenol glucosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,472,140 | 0 | C | T | 99.7% | 2232.0 / NA | 571 | A84A (GCC→GCT) | yfdG | bactoprenol glucosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (265/303); minor base G (0/2); total (265/306) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 579 total aligned reads displayed.
TCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472004‑2472276 | cGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGctgctg > 2:1764129/1‑140 (MQ=255) gCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGa < 2:7630049/140‑1 (MQ=255) ccAGGGTGCGTTGAGGCTGCGCGCAGTAGCTTCTTCGCGAATGCACAATTCACCTTCCAGGCCTCGCCAACCACGAGGCGCTACCTGCTCTATGGTGGGTTCCTGGGGACACTGAGTGCTACTGGTGGAGGGGCTGCTGa < 2:9717022/139‑1 (MQ=255) ttCGTTGTTGCTGTGAGCATTAGCTTCTTCGCTAATGCATAATTCACATTCAAGGCATCGACTACTACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACAGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTTCTGATAGATg < 2:3697141/140‑1 (MQ=255) tCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgc > 2:2617195/1‑140 (MQ=255) cGTAGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCGTCGCGAATGCACAATTCACATTCAAGGCATCGACTACACCGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTACATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgcg < 2:8596176/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCa < 1:7644433/140‑1 (MQ=255) gtgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccccc < 1:1395985/140‑1 (MQ=255) gtgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccccc < 2:5244655/140‑1 (MQ=255) gtgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccccc < 1:3061676/140‑1 (MQ=255) tgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCg < 2:324259/140‑1 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACAGTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGCCCCTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACGTCCCCCGATGATaa < 2:2896356/140‑1 (MQ=255) aGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAAc > 2:1072202/1‑140 (MQ=255) tcttcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCg < 1:7018804/128‑1 (MQ=255) tcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTc > 2:415383/1‑140 (MQ=255) gCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTtctc < 2:2835165/140‑1 (MQ=255) gCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTtctc < 1:2249229/140‑1 (MQ=255) aTTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCa < 1:9513500/140‑1 (MQ=255) aTTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCa < 1:9211124/140‑1 (MQ=255) aTTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCa < 1:8709043/140‑1 (MQ=255) caTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCGCCCGATGATAACTCTTGTCAACTTCTCCGCCATCAGc < 2:4520445/140‑1 (MQ=255) caTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGc < 1:9341245/140‑1 (MQ=255) caTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGc < 2:8358585/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGcc < 1:6172865/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGcc < 1:3348580/140‑1 (MQ=255) tCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTg < 1:8196057/140‑1 (MQ=255) tCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTg < 2:3134297/140‑1 (MQ=255) tCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTg < 1:5204754/140‑1 (MQ=255) tCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTg < 1:1803447/140‑1 (MQ=255) cAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTgg > 1:5539468/1‑140 (MQ=255) cAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTgg > 2:6797722/1‑140 (MQ=255) tCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCgg > 2:5375907/1‑140 (MQ=255) cGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGt < 1:8478226/140‑1 (MQ=255) cGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGt < 1:7154489/140‑1 (MQ=255) cGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGt < 2:2111473/140‑1 (MQ=255) aCAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGt < 1:7088226/140‑1 (MQ=255) cGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTAt > 1:2016435/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 1:6079658/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:7282652/1‑140 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa < 2:3968698/140‑1 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa < 1:3563002/140‑1 (MQ=255) cgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACTCTGAGTGCTACTGTTGGATGGGATGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATTACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaaa < 1:3947697/140‑1 (MQ=255) cgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGGCTAGTCtaa > 2:6671913/1‑140 (MQ=255) cTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGt > 1:9689288/1‑140 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:4021295/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:54417/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 2:2478782/140‑1 (MQ=255) aTGCTATCTGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAt < 2:6009148/140‑1 (MQ=255) aTGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAt < 1:5982549/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 2:9478342/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 1:2932013/140‑1 (MQ=255) gCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTg > 1:590800/1‑140 (MQ=255) tatGTTGTGTACATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATAAGACTGGTGTGCGGTGTCGTCTATTCAAAGATCATTGTCtt > 2:7085990/1‑140 (MQ=255) tatGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCtt > 2:3328128/1‑140 (MQ=255) tatGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCtt > 1:8094620/1‑140 (MQ=255) tatGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCtt < 1:7762774/140‑1 (MQ=255) tatGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACACTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCtt > 1:7902872/1‑140 (MQ=255) tGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTa < 1:2086533/140‑1 (MQ=255) gTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCTTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAg > 1:1045644/1‑140 (MQ=255) gTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAg > 2:7461020/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTTCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTGCTCCGCCCTCAGCCGGGTGTGCGGTTTCGTCTAGTCAAAGTTCATTGGCTTTAggg > 2:6215936/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTgg > 2:1123343/1‑101 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 1:6371739/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 2:1509287/1‑140 (MQ=255) gggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCAGCAGCCGGGTGGGCGGTTTCGTCTATTCATAGTTCATTGTCTTGAGGGa > 2:4800220/1‑140 (MQ=255) gggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGACATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGa > 2:7885401/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:5069407/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:4416927/1‑140 (MQ=255) gTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATg < 1:4358965/140‑1 (MQ=255) tCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCg > 2:8140682/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAATGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 2:3782092/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 1:6657985/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 1:4175356/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 2:6365563/1‑140 (MQ=255) tGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaaa < 1:8976529/140‑1 (MQ=255) ggggACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAAt < 2:9023822/140‑1 (MQ=255) gACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATCGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGaa > 2:4967392/1‑140 (MQ=255) cacTGAGTGCTACTGCTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGa > 1:3821072/1‑140 (MQ=255) ccTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTATCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:1702963/139‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:5927361/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:5772052/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:2610950/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:2756425/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACGTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 2:9292506/140‑1 (MQ=255) tGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat > 1:4980170/1‑140 (MQ=255) tGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat < 2:3021501/140‑1 (MQ=255) tGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGatat > 1:1542871/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCa > 2:4380687/1‑73 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct < 1:1137715/140‑1 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct > 2:1195268/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGATGATAGATTCTAAATTCACCCGATGATAACTCTTGTCAACTTCTCCTCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATTAatatatat > 2:1861111/1‑138 (MQ=255) cTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCCTCAGCATGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCCAAGTTCATTGTCTTGAGGGATGCGAAATGAAGATATCTATTgatg > 2:5772975/1‑137 (MQ=255) ttGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTc > 1:8372013/1‑140 (MQ=255) ttGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGGCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTc > 2:1415390/1‑140 (MQ=255) tGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTcc < 2:6926514/140‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt < 2:1279916/140‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt > 2:65601/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 1:4658620/1‑140 (MQ=255) ggggCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATACCTCATGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc < 1:9620882/139‑1 (MQ=255) ggCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGt < 1:3265060/42‑1 (MQ=255) | TCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472004‑2472276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |