Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 2,907,837 | 0 | C | T | 99.6% | 924.6 / NA | 237 | intergenic (‑114/‑25) | queE/CXP41_RS15220 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE/cell envelope stress response protein YqcG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (67/169); minor base G (0/1); total (67/170) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCGA > NZ_CP025268/2907700‑2907971 | cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 1:7839836/140‑1 (MQ=255) cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 1:3793012/140‑1 (MQ=255) cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:7755836/140‑1 (MQ=255) cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:4035535/140‑1 (MQ=255) 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2:8262088/1‑140 (MQ=255) gTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTCAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAAt > 1:3647789/1‑140 (MQ=255) tAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGAt < 1:9047657/140‑1 (MQ=255) aaaTGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 2:942398/37‑1 (MQ=255) aaTGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAata < 1:7631579/140‑1 (MQ=255) atCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCGa > 2:3525536/1‑140 (MQ=255) | CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCGA > NZ_CP025268/2907700‑2907971 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |