| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,894,373 | A→G | T281A (ACG→GCG) | mdtL → | multidrug efflux MFS transporter MdtL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,894,373 | 0 | A | G | 99.8% | 1944.8 / NA | 559 | T281A (ACG→GCG) | mdtL | multidrug efflux MFS transporter MdtL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (319/238); minor base T (1/0); total (321/238) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 588 total aligned reads displayed.
TTGAGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGACGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGT > NZ_CP025268/3894236‑3894509 | gAGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCggg < 2:7705254/140‑1 (MQ=255) cgcgGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGAt < 2:3456058/140‑1 (MQ=255) cgcgGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGAt < 2:6864099/140‑1 (MQ=255) cgGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCAGGACCGGTTCTTTCTCCACGGCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCa > 2:7518738/1‑140 (MQ=255) gTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGCACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCAct > 1:750495/1‑140 (MQ=255) gactACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTGAAGCCACGTACGGTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCAGGCGGCGGGGATCActct < 2:8774442/137‑1 (MQ=255) cGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCg > 1:5507953/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGtt > 1:4407560/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGtt > 1:3465712/1‑140 (MQ=255) caccaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGttt > 1:8663355/1‑140 (MQ=255) accaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTc > 1:9619031/1‑140 (MQ=255) accaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACATCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTGTc > 2:4380456/1‑140 (MQ=255) ccaTTATGGCGCTTACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCa < 1:192211/140‑1 (MQ=255) ccaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCa < 2:740464/140‑1 (MQ=255) aTTATGGCGCTGTCCGCTGGCTTCAGCATGACCGTTTGAGTCTCGACGCCTTTTTGGCTGGGAATTTTTTAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCTGCGGGGATCACTCTTGCCGtttgtcg < 2:8210428/140‑5 (MQ=255) gcgcTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCa < 1:305937/140‑1 (MQ=255) gcgcTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCa < 1:6919334/140‑1 (MQ=255) gcgcTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCa > 1:6613587/1‑140 (MQ=255) cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGc > 1:7099663/1‑140 (MQ=255) cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGc > 2:9439008/1‑140 (MQ=255) cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCAGTTGCGCTGGGAATGTTTAAGCCACGTACGGTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATGCCTGGCGGCGGGGTGCACTCTTGCCGTGTCGCCGGCGCATGc > 2:1679526/1‑140 (MQ=255) tGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCg > 1:6751070/1‑140 (MQ=255) aCCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGt > 1:8085278/1‑140 (MQ=255) aCCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGt > 1:2782807/1‑140 (MQ=255) aCCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGt > 1:8331636/1‑140 (MQ=255) aCCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGt > 2:6099089/1‑140 (MQ=255) cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct < 2:1199353/140‑1 (MQ=255) cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct < 1:7854171/140‑1 (MQ=255) cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct < 1:8421037/140‑1 (MQ=255) cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct > 1:6379906/1‑140 (MQ=255) cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct < 1:515187/140‑1 (MQ=255) cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct < 2:6613587/140‑1 (MQ=255) tGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtctc > 1:8816484/1‑140 (MQ=255) ggCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCTCCTTCCCATGCGGTTTctct < 1:3573546/140‑1 (MQ=255) ggCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTctct < 2:5444181/140‑1 (MQ=255) aGCATGACCGTATCATTCTCCACGCCATTTGCGCAGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCTCAGGTGATATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGGTT‑gg > 2:2545546/1‑140 (MQ=255) ccGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACg < 1:3158673/140‑1 (MQ=255) tttCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGGTT‑GGTATCACGCTg > 2:91124/1‑140 (MQ=255) tcCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTgcgc > 2:365519/1‑140 (MQ=255) ccACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGcc < 1:1700538/140‑1 (MQ=255) cACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCg > 1:9535371/1‑140 (MQ=255) cACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGAGTTGCGCCg > 1:7227562/1‑140 (MQ=255) aCGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCgg > 1:4747414/1‑140 (MQ=255) gCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGtt > 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ttGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGTAAACTCTTTCCTTTTAAAATAAAAATGCGGTTTCTCTGCTT‑TTAATCACTCTGTTAAGCGCGGCTTtctag > 1:4006082/1‑138 (MQ=255) ttGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCg > 2:2328582/1‑140 (MQ=255) ttGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCg > 1:2392472/1‑140 (MQ=255) ttGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTGT‑GGTATCACGCGGATTTGCGCCGGGTTCTCg > 2:9709964/1‑140 (MQ=255) gcgcTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGt < 1:2504167/140‑1 (MQ=255) gggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTCTCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAgggt > 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atgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGtt > 2:838200/1‑140 (MQ=255) atgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGtt > 2:7075427/1‑140 (MQ=255) atgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTGTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGtt > 2:380309/1‑140 (MQ=255) atgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGGTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGtt > 1:3691177/1‑140 (MQ=255) tgatAACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCACATGAGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCTGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTa > 2:3246213/1‑140 (MQ=255) gatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGGTAg > 1:4464348/1‑140 (MQ=255) gatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGGTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAg > 1:9174527/1‑140 (MQ=255) cACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGc < 2:797995/140‑1 (MQ=255) aCCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGcc > 1:7377402/1‑140 (MQ=255) aCCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGcc > 1:1591084/1‑140 (MQ=255) aCCTCGCAGGTGTTAGTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGAGTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGcc > 2:2105702/1‑140 (MQ=255) cTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGt > 2:135541/1‑140 (MQ=255) cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 2:1513343/1‑140 (MQ=255) aGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTGTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCCGGCGTTAGGGCCGTTTTCa > 2:8605395/1‑140 (MQ=255) gtgtTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGa > 1:9853577/1‑112 (MQ=255) ttATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGc < 1:4229553/127‑1 (MQ=255) ttATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcg > 2:4593086/1‑140 (MQ=255) agtCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATGTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcgcg < 1:332642/138‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGTCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCTTTAcgcg > 2:3089623/1‑140 (MQ=255) aTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcgcg < 1:3224471/140‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcgcg < 2:4187012/140‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcgcg < 1:5986920/140‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcgcg < 1:3875005/140‑1 (MQ=255) ttCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcgcgc > 2:8502424/1‑140 (MQ=255) ttCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCAGTTT‑GGTAGCACGCTGATTTGCGCCGGTTGCTCGGTAGGGGTTGGTGTGGCGAGGAGTCAGGCGTGAGGGCCGGTTTCATTAcgcgc > 2:5113684/1‑140 (MQ=255) tGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCGCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGGCAGGCGTTAGGGCCGTTGTCATTACGCGCGGGc > 1:6220175/1‑140 (MQ=255) ggcggcGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCg > 2:2724345/1‑140 (MQ=255) ggcggcGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCg > 2:6018223/1‑140 (MQ=255) ggcggcGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGAGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCg > 1:7671497/1‑140 (MQ=255) | TTGAGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGACGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTT‑GGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGT > NZ_CP025268/3894236‑3894509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |