| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,915,245 | A→G | C115R (TGT→CGT) | glmS ← | glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate transaminase (isomerizing) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,915,245 | 0 | A | G | 99.9% | 3397.1 / NA | 973 | C115R (TGT→CGT) | glmS | glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate transaminase (isomerizing) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (541/431); minor base T (0/1); total (541/432) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 982 total aligned reads displayed.
CACTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACACGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAT > NZ_CP025268/3915108‑3915380 | aCTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACgcgc > 1:9342254/1‑140 (MQ=255) cTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACgcgcg > 1:8770307/1‑139 (MQ=255) cTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCt > 1:2869098/1‑140 (MQ=255) tGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCACTCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCtt > 2:1523904/1‑140 (MQ=255) tACCGTACGCACAACGCAGCTGCGGGATAGCACGCATTACTGCCACACGAAGAGTCCCTCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTAGGTGTCGGTTTCAGAATCGTAGGTATAGCCACGCGCtttt > 1:6193514/1‑140 (MQ=255) aCCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTa < 1:9826895/140‑1 (MQ=255) cGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGc > 1:5649002/1‑140 (MQ=255) cGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGc > 1:642286/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:5028941/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:4545618/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:5778707/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:782787/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:6306509/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:4894890/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:4550928/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:1535768/1‑140 (MQ=255) aCGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctct > 1:9010276/1‑140 (MQ=255) cGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCtt > 1:1125711/1‑140 (MQ=255) gCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCACTCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTc > 1:3778668/1‑140 (MQ=255) gCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTc > 1:1418381/1‑140 (MQ=255) gCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTc > 1:4390718/1‑140 (MQ=255) caccacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCa < 2:9087227/140‑1 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 2:6728318/1‑140 (MQ=255) ccacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTGTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACg < 2:2516281/140‑1 (MQ=255) acGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCa > 2:2898229/1‑140 (MQ=255) cGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCTCTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAg < 1:5229771/140‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAg < 2:3620427/140‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAg < 1:6494752/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGc > 1:3373892/1‑140 (MQ=255) gCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGc > 2:8899542/1‑140 (MQ=255) cTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGtt < 2:8024509/140‑1 (MQ=255) gCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCa < 2:6514078/140‑1 (MQ=255) cGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCAt > 2:5710025/1‑140 (MQ=255) cGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgat > 2:213892/1‑140 (MQ=255) cAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgatga < 1:6659752/140‑1 (MQ=255) aGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgatgat > 1:5485856/1‑140 (MQ=255) aGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTACAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGAAGCGGGTCATGGGTTTCgatgat > 2:7086480/1‑140 (MQ=255) gAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGatgatg < 1:3464146/140‑1 (MQ=255) aaCGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGc < 2:5507802/140‑1 (MQ=255) cGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCg < 2:1724513/140‑1 (MQ=255) cGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCg > 1:1013253/1‑140 (MQ=255) cGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCg < 2:9510593/140‑1 (MQ=255) cGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCg < 2:5888282/140‑1 (MQ=255) ggCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTGCGATGATGCCGt > 2:1896722/1‑140 (MQ=255) ccTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTa < 1:5996960/140‑1 (MQ=255) ccTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTa < 1:8005009/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 2:7601396/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 2:5201467/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 1:4298510/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 1:1283074/140‑1 (MQ=255) cGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcac < 1:9107008/140‑1 (MQ=255) cGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcac < 1:4186652/140‑1 (MQ=255) gCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcacc < 1:4894890/140‑1 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATTCCGTTATGcaccacca > 2:7909961/1‑140 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacca > 1:1878447/1‑140 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTACGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcacaacca > 2:9417367/1‑140 (MQ=255) ccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 1:2469571/140‑1 (MQ=255) ccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 1:2637117/140‑1 (MQ=255) ccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 1:7678063/140‑1 (MQ=255) cGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAtg > 2:6127594/1‑140 (MQ=255) tGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTc > 1:2364569/1‑140 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg < 2:315263/140‑1 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg < 2:9745435/140‑1 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg > 1:8632949/1‑140 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg > 1:2053962/1‑140 (MQ=255) tCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGaa > 1:3004776/1‑140 (MQ=255) cTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACAt > 2:8259127/1‑140 (MQ=255) aGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGa < 2:731280/140‑1 (MQ=255) tCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAACCATGCGGATgc < 1:696171/140‑1 (MQ=255) aCCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATgcgc > 2:3375394/1‑140 (MQ=255) cAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCAt > 2:2382148/1‑140 (MQ=255) aTGGGCAATCACATCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCa > 2:6911766/1‑140 (MQ=255) tGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCCGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCCTTCAc > 2:7472900/1‑140 (MQ=255) gCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTc < 2:7736902/140‑1 (MQ=255) aTCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGa < 1:3592987/140‑1 (MQ=255) cTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGt < 2:3004776/140‑1 (MQ=255) cTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGt < 2:533255/140‑1 (MQ=255) gtCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGt > 1:7240648/1‑140 (MQ=255) tCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGtt > 2:8568077/1‑133 (MQ=255) tCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTg > 2:268293/1‑140 (MQ=255) cGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACCATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTgg < 1:4693205/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGt < 1:9466447/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGt < 1:2198798/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGt > 1:4016616/1‑140 (MQ=255) gTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGt > 2:2268538/1‑140 (MQ=255) gTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTAAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGCTGATGCCGTTATGCACCCCCACACTGGGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGt < 2:503290/140‑1 (MQ=255) aaaCGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAg < 1:846230/140‑1 (MQ=255) aaaCGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAg < 2:8383096/140‑1 (MQ=255) aaaCGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAg < 2:4303900/140‑1 (MQ=255) aaaCGAAGGTAGAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGCTGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAg < 2:9260233/140‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 1:9660953/140‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 1:4764570/140‑1 (MQ=255) aGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgtg < 1:8198833/140‑1 (MQ=255) aGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgtg < 1:3248168/140‑1 (MQ=255) gTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGtgtg < 1:7541193/140‑1 (MQ=255) ttaGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTAGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATTTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCATCGAGTGTGAg < 2:384060/139‑1 (MQ=255) ataGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAg < 2:115469/140‑1 (MQ=255) ataGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTAGGCACAACCACATTGTGTTCAGAAACATGCGGAGGAGCATTCAATTCTGATGGTTCACCGTGGTTCGCCCAGCGAGTGTGAg < 2:1321456/140‑1 (MQ=255) aGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCa > 2:3974352/1‑140 (MQ=255) ccACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAt < 2:4055668/140‑1 (MQ=255) | CACTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACACGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAT > NZ_CP025268/3915108‑3915380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |