| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,333,560 | T→C | V378A (GTG→GCG) | proP → | glycine betaine/L‑proline transporter ProP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,333,560 | 0 | T | C | 99.6% | 1924.2 / NA | 554 | V378A (GTG→GCG) | proP | glycine betaine/L‑proline transporter ProP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (254/298); minor base A (2/0); total (256/298) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 554 total aligned reads displayed.
TGTTGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTAC > NZ_CP025268/4333423‑4333696 | ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGTTTAACACTAACGTCATAGGCCTGATTTTTGACGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 1:3599306/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 2:3729621/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 1:6745222/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCAGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACAGCATTACGGGCGTTATGGCTTATACCTTGCCAGCGAtt > 1:74907/1‑139 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTAGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAAAAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 1:4505139/1‑140 (MQ=255) tGCCCTGTTTGTGNTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTTCTTTACGGGCGNTATTGCTTATACCATGCCAGCGATGt > 1:6255602/1‑140 (MQ=255) cccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTc > 1:5565538/1‑140 (MQ=255) cccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTc > 2:291877/1‑140 (MQ=255) cccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTAAACTGATTAAAAGTAACGTCATCGGCCAGATTTTTGCCCGGTTACTGATGCAGGCGGTGATACTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCAACCATGCCAGCGATGTTc > 1:2422199/1‑140 (MQ=255) ccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTcc < 2:5411858/140‑1 (MQ=255) cTGTTTGTGTTGGCGCTCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTccc < 2:9434429/140‑1 (MQ=255) cTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTccc < 1:3005695/140‑1 (MQ=255) cTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTccc > 1:9256120/1‑140 (MQ=255) tttGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTATACCTTGCCAGCGATGTTCCCGAc > 1:1643936/1‑140 (MQ=255) tgtgTTGGCGATCCCGTCGTTTATTCTGATTAACAGTGACGTCATCGTCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGc < 2:3464498/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGc < 1:801808/140‑1 (MQ=255) tgtgGTGGCGATCCCGGCGATTAGTCTGATTCACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTGACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGc < 2:8255284/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGCTTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 2:2001619/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 1:209097/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 2:3018928/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 2:5086310/140‑1 (MQ=255) cGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGt > 1:8617159/1‑140 (MQ=255) cGATCCCGGCGTGTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACGGATGCTGGCGGTGATCCTTAAATTCTTTACGGGCGGTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGt > 1:3723686/1‑140 (MQ=255) aTCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTa < 2:7220454/140‑1 (MQ=255) aTCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTa < 1:2821778/140‑1 (MQ=255) cGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 1:9827586/128‑1 (MQ=255) tCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg < 1:7701583/140‑1 (MQ=255) tCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg < 2:6127549/140‑1 (MQ=255) tCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg < 2:6904463/140‑1 (MQ=255) gATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcgg > 1:9406107/1‑140 (MQ=255) ttAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCa < 1:4230042/140‑1 (MQ=255) aaCAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCAtt < 2:5807015/140‑1 (MQ=255) aaCAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCAtt < 1:6807499/140‑1 (MQ=255) tAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAata > 1:2220077/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAtt > 2:3982443/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAtt > 2:8000946/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAtt > 2:1804228/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAtt > 1:7157390/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAtt > 1:511839/1‑140 (MQ=255) cATCGGGATTATATTTGCCGGGTAACTGATGGTGGCGGTGATCCTTAAGTGCTTTTGGGTAGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATAACCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTTATttttggt < 2:1592252/140‑4 (MQ=255) tCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTg > 2:2179389/1‑140 (MQ=255) gCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCt < 2:4169885/140‑1 (MQ=255) gCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCt > 1:8335508/1‑140 (MQ=255) aTGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCt < 1:1684646/140‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTg < 2:7437712/140‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTg < 2:7616249/140‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTg < 1:9118058/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggc > 2:439259/1‑140 (MQ=255) cTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggc > 1:5862842/1‑140 (MQ=255) cTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggc > 1:9529135/1‑140 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gTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCt > 1:3655032/1‑140 (MQ=255) gTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCt > 2:3543795/1‑140 (MQ=255) aTGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCtgat < 1:2627405/140‑1 (MQ=255) cTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGatgatg < 1:339141/140‑1 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc > 1:8996193/1‑140 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc < 2:9535470/140‑1 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc < 2:3140974/140‑1 (MQ=255) tCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 2:8447521/140‑1 (MQ=255) tCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 2:2407283/140‑1 (MQ=255) tCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 2:1210798/140‑1 (MQ=255) tCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 1:8869204/140‑1 (MQ=255) tCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 1:3481325/140‑1 (MQ=255) cTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcct > 1:3889221/1‑140 (MQ=255) cTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcct < 1:2572833/140‑1 (MQ=255) tGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAt > 1:532285/1‑140 (MQ=255) tGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAt > 2:4859105/1‑140 (MQ=255) tGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAt < 2:7732806/140‑1 (MQ=255) tGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAt > 1:7399946/1‑140 (MQ=255) ccAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTa < 1:1559230/140‑1 (MQ=255) ccAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTa < 1:1313704/140‑1 (MQ=255) cAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTAc < 2:2769611/140‑1 (MQ=255) cAGCGATGTTCCCGACGCATAACCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAAGATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTAc < 2:6762046/140‑1 (MQ=255) | TGTTGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTAC > NZ_CP025268/4333423‑4333696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |