| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,614,205 | A→G | *54* (TAA→TAG) | ytjA → | DUF1328 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,614,205 | 0 | A | G | 99.7% | 965.4 / NA | 283 | *54* (TAA→TAG) | ytjA | DUF1328 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (151/130); minor base T (1/0); total (152/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GGTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAAATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATA > NZ_CP025268/4614070‑4614341 | ggTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGTATACGACCCTAGAttt > 1:1123578/1‑140 (MQ=255) ggtATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAATTTGTCTTTGTCGGCGGGATGATTCTGTGCCTGGTGAGTGTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTc > 2:2912899/3‑140 (MQ=255) gTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCTGCTAAAATTGTCTTAGTCGTCGGGATTATACGGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GTGCCGAAAACGACGCTAGATTTc > 2:4467693/1‑140 (MQ=255) gTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTc > 2:579269/1‑140 (MQ=255) gTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTc > 1:8211337/1‑140 (MQ=255) gTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTc > 1:9826760/1‑140 (MQ=255) tCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGAc > 2:3305786/1‑140 (MQ=255) tCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGGTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTGTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGAc > 2:2586008/1‑140 (MQ=255) cgcgTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGAcc > 1:6403303/1‑140 (MQ=255) cgcgTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGAcc > 2:6428543/1‑140 (MQ=255) cgcgTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGAcc > 1:8538142/1‑140 (MQ=255) aaTAGCCGCCTCACGTGGGTTTGGAGGTCTTGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATATTATTTGTCGTCCGTATTATTCTGATACTGGTGAGAATGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCAAGATTTCAGACCATTAAg > 2:4049956/1‑140 (MQ=255) agcgccgccgcACTTGGGTTCGGGGGTCTGGCCGGTCCCGCTCCAGGCGCAGCTAACATTGTCTTTGTCGGCGGGATTATTCGGTTCCGGGTGAGTTTGTCCAG‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGa < 1:6901802/138‑1 (MQ=255) aTCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCTGGATTATTCTGTTCCTGGTGATTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGa < 1:4141275/140‑1 (MQ=255) gccgccgcACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGaaaa > 2:2026902/1‑140 (MQ=255) cgccgcACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATGGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAACACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAAtt < 2:8663266/140‑1 (MQ=255) cgccgcACTGGGGTTTGGTGGTCGGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGTATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAG‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAAtt < 1:4270616/140‑1 (MQ=255) gccgcACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAAttt > 1:2087730/1‑140 (MQ=255) gccccACTTGGTTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCCGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGATTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAAttt < 1:1528321/140‑1 (MQ=255) aCTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTCCCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGTATTTTTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATcc < 1:8298569/140‑1 (MQ=255) aCTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATcc < 2:965389/140‑1 (MQ=255) cgggTTTGCTGTTCTGGCCGGTACCGCAGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGGTCCTGGTGAGTTTGGTCAG‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCaaa < 2:5935193/139‑1 (MQ=255) gggTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTACCTGGTTAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAg < 1:1336098/140‑1 (MQ=255) tttGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCTGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCa < 2:4652963/140‑1 (MQ=255) tttGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCCGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCa < 2:3435079/140‑1 (MQ=255) tttGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGATAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCa < 2:2294371/140‑1 (MQ=255) ttgggtggaCTGGCCGGTACCGCTGCCGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAG‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATCTTATCCAAAGCCa < 1:9181828/137‑1 (MQ=255) tggtggTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGt > 1:5103743/1‑140 (MQ=255) tggtggTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTAGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GTGCCGAAAACGACCAAAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGACAGt > 2:5660840/1‑140 (MQ=255) ggtggtCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTc > 2:9489533/1‑140 (MQ=255) ggtggtCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTc > 1:7860992/1‑140 (MQ=255) tggtCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCa < 1:7497594/140‑1 (MQ=255) tggtCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCa > 2:1726848/1‑140 (MQ=255) ggtCTGGCCGGTACCGCTGCTGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAg < 2:1093211/140‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCg > 1:6435078/1‑140 (MQ=255) tCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCg > 1:5189343/1‑140 (MQ=255) tGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGa < 2:8500434/140‑1 (MQ=255) gCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACt > 1:805286/1‑140 (MQ=255) gCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCAGTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACt > 1:2775303/1‑140 (MQ=255) tACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCtt > 1:1086709/1‑140 (MQ=255) cGCTGCTGGCGCAGCTAAATGTATCTTTCTCGTCGGTCGTCTTCGGTGCCTGGTGAG‑TTGTGCCTACGGCCGAAAACGACCCTACATTTCAGACCATTAAGAACACTTTATCCTAAGCCAGCCCAGCGGACTGGCTTTTg < 2:7093281/140‑1 (MQ=255) cGCTGCAGGCGCAGCTAAATTTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTg < 2:2258597/140‑1 (MQ=255) cGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTg < 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ggCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTGGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGAGTTCAGACGATGAAGAAAATTTTATCCAAGGCCCGTCCAGCGGACTGGCTATTGCGGtttt > 2:6005839/1‑140 (MQ=255) gcAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGTATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGc < 1:1768072/140‑1 (MQ=255) cAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCg < 2:4999863/140‑1 (MQ=255) gCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATGAAGACAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGaa > 2:5400788/1‑140 (MQ=255) cTAAATTTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGaat < 1:8731578/140‑1 (MQ=255) aaTTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAataata < 1:8846600/140‑1 (MQ=255) ttGTCATTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATaaa < 2:480498/140‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTATATTTCAGACCATTAATAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAAtt > 2:4180936/1‑140 (MQ=255) gTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAAtt > 2:7508911/1‑140 (MQ=255) gTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAAtt > 1:7827597/1‑140 (MQ=255) cTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTGTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGc > 1:2867452/1‑140 (MQ=255) 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2:7777762/1‑140 (MQ=255) attGTTCAT‑GGGCCTAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTNGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAgg < 1:6308269/139‑1 (MQ=255) gTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATAGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAg > 1:2016454/1‑140 (MQ=255) tCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCATTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCAGTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGc < 1:5879877/140‑1 (MQ=255) aT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCag < 1:6843382/140‑1 (MQ=255) aT‑GGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCag < 2:7583592/140‑1 (MQ=255) 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1:6226306/140‑1 (MQ=255) gACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCg < 1:455099/140‑1 (MQ=255) gACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTGACTGTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCg < 1:4600084/140‑1 (MQ=255) gACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCATTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCg < 1:1851399/140‑1 (MQ=255) ccTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAAt < 1:4747466/140‑1 (MQ=255) ccTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAAt < 1:5409298/140‑1 (MQ=255) ccTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAAt < 1:3766597/140‑1 (MQ=255) | GGTTATCGCGTTAATCGCCGCCGCACTTGGGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCAT‑GGGCCGAAAACGACCCTAAATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATA > NZ_CP025268/4614070‑4614341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |