| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 468,479 | G→A | E187K (GAG→AAG) | mdlA → | SmdA family multidrug ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 468,479 | 0 | G | A | 99.1% | 2464.7 / NA | 637 | E187K (GAG→AAG) | mdlA | SmdA family multidrug ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (347/281); minor base T (1/5); total (350/287) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.58e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 637 total aligned reads displayed.
CACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTGAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCA > NZ_CP025268/468342‑468614 | cACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAg < 1:359917/140‑1 (MQ=255) aCTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGATGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGc > 2:8919790/1‑140 (MQ=255) tGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTg > 2:4472115/1‑140 (MQ=255) tGGGGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTg > 2:5792562/1‑140 (MQ=255) tGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGca > 1:7378462/1‑140 (MQ=255) aTGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGcaca > 2:4851349/1‑140 (MQ=255) aTGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGcaca > 2:1887457/1‑140 (MQ=255) aTGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGcaca > 1:3020280/1‑140 (MQ=255) gggCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAgg < 1:8084423/140‑1 (MQ=255) gggCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAgg < 1:5043695/140‑1 (MQ=255) tGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAggcggc < 1:3113457/140‑1 (MQ=255) gcgcTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGgcggcg > 1:8519888/1‑140 (MQ=255) gcgcTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGgcggcg > 2:2566312/1‑140 (MQ=255) gcgcTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGgcggcg > 1:7948372/1‑140 (MQ=255) gcgcTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGgcggcg < 1:6098947/140‑1 (MQ=255) gcgcTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGgcggcg > 2:6150166/1‑140 (MQ=255) cgcTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGt > 1:6414537/1‑140 (MQ=255) cgcTGTGTTGATTATGAGGTCTTCGCTAAGTAGGTGGCAGTTGTCCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGTTGGCGATCTTGATTTAGCGCACCGGCGATGCTTTGCTTGACCGATGTAAGCTGGCACAGgcggcgg < 2:52095/140‑2 (MQ=255) gtgtTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTc < 1:8765391/140‑1 (MQ=255) gtgtTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTc < 2:3159044/140‑1 (MQ=255) gtgtTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTc < 1:1679478/140‑1 (MQ=255) tgtTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTcc > 1:6599614/1‑140 (MQ=255) gtTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCa < 1:4493630/140‑1 (MQ=255) gtTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCa < 1:2262634/140‑1 (MQ=255) ttGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAg > 1:8994973/1‑140 (MQ=255) ttGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAg > 1:5900441/1‑140 (MQ=255) aTTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCt > 2:9639662/1‑140 (MQ=255) aTTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCt > 1:7742648/1‑140 (MQ=255) aTTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCt > 1:5587858/1‑140 (MQ=255) tATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTa > 2:1197578/1‑140 (MQ=255) tATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTGTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTa < 2:3301060/140‑1 (MQ=255) atgatgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTaa > 1:3311178/1‑140 (MQ=255) atgatgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGAGGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTTAGCTGGCTCTGGCGGCGTTTTCCAGTCTTaa < 2:8844683/140‑1 (MQ=255) gatgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATg > 1:5422036/1‑140 (MQ=255) gatgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATg > 2:346808/1‑140 (MQ=255) gatgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATg > 2:7517928/1‑140 (MQ=255) gatgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATg > 1:4722816/1‑140 (MQ=255) gatgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATg > 1:4178896/1‑140 (MQ=255) tgTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGAc < 1:1424590/140‑1 (MQ=255) gTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGAcc < 2:4395211/140‑1 (MQ=255) cTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGc < 1:4337002/140‑1 (MQ=255) tACTCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCCTGAACGCTTTAAGCTGGCAGAGGCGGCGGTTTCCAGTCTTAAGGACCGct > 2:8431730/1‑139 (MQ=255) tACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCa > 1:3720315/1‑140 (MQ=255) aCGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCAc > 2:6625985/1‑140 (MQ=255) aCGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCAc > 1:9386407/1‑140 (MQ=255) aCGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCAc < 1:3936747/140‑1 (MQ=255) aCGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCAc < 2:7129038/140‑1 (MQ=255) aaTTAGTTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTGTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAgg < 2:2980232/140‑1 (MQ=255) aaTTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCTCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCTCAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAgg < 2:1417250/140‑1 (MQ=255) aaTTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAgg < 2:3917854/140‑1 (MQ=255) aaTTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAgg < 2:2656577/140‑1 (MQ=255) aTTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCg > 2:7745291/1‑131 (MQ=255) aTTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGa > 1:1912268/1‑140 (MQ=255) ttAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGaa < 1:2854010/140‑1 (MQ=255) aGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAg < 2:4011399/140‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGcc < 2:5534122/140‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGcc < 1:519769/140‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGcc > 2:2831198/1‑140 (MQ=255) tGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCt < 1:1066493/140‑1 (MQ=255) tGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCt < 1:2290631/140‑1 (MQ=255) gCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCa > 2:370540/1‑140 (MQ=255) gCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGATTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCa > 2:5004853/1‑140 (MQ=255) cAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCTCAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCAc < 2:4720024/140‑1 (MQ=255) cAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCAc < 1:7051467/140‑1 (MQ=255) gTTGACCGTATTGTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTCATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCa < 2:8655236/140‑1 (MQ=255) ttGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAg > 2:2021904/1‑140 (MQ=255) tGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGt < 1:9649741/140‑1 (MQ=255) aaggtCCCTCGTGCCGCTGCCAGGGATGGCGAACATGATTAAGCGCACCGGCGAGGATTGGCATGAACGCTATAAGCTGGAACAGGCGGCGTTTTCCAGTCAGACTGACCGCCCCCAGTAAAGCCTCACCAGTATCCGCa < 2:7351254/136‑1 (MQ=255) aTTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTGAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCa < 1:9184080/140‑1 (MQ=255) aTTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCGCCAGTATCCGCa < 1:4817598/140‑1 (MQ=255) aTTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCa < 2:1528042/140‑1 (MQ=255) tttCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATg > 2:2430341/1‑140 (MQ=255) cccTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATc < 1:1814527/140‑1 (MQ=255) cTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCaa < 1:8291202/140‑1 (MQ=255) cTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCaa > 2:1615933/1‑140 (MQ=255) tGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCaaa < 1:6225381/140‑1 (MQ=255) ccGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCtt > 1:1279523/1‑140 (MQ=255) ccGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCtt < 1:5698674/140‑1 (MQ=255) gATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTg < 1:2701473/140‑1 (MQ=255) tGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGCTGCTTTGCATGAACGCTTTATGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCCGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGaa < 2:1005712/140‑1 (MQ=255) gCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCg > 2:807732/1‑140 (MQ=255) aTCATGATTTAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTATTGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCa < 2:933540/140‑1 (MQ=255) aTCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCa > 2:9716900/1‑140 (MQ=255) aTCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCa < 1:2449162/140‑1 (MQ=255) cATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGt < 2:3767525/140‑1 (MQ=255) aGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTa > 2:594490/1‑140 (MQ=255) aaCGGCGATGCGTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCCGTCGGCGTTATTTGc > 2:1092657/1‑140 (MQ=255) aCGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGcc > 2:6960972/1‑140 (MQ=255) cGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCcg < 2:8145362/140‑1 (MQ=255) cGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCcg > 2:6272170/1‑140 (MQ=255) cGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCgg > 2:1751024/1‑140 (MQ=255) cGATGCTGTGCATGTCCGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCCTTTTCCAGACTTAATGACCGCCCCCCGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCACAGCCTTTGGTCGGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTTTTTGCCGCgg < 2:9474659/140‑1 (MQ=255) cGATGCTGTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCgg < 2:7890584/140‑1 (MQ=255) gATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACCGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGa < 2:9242083/140‑1 (MQ=255) aTGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGAt > 1:6791576/1‑140 (MQ=255) aTGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGAt < 2:6832506/140‑1 (MQ=255) aCGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCg > 1:7228753/1‑140 (MQ=255) aCGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCg > 2:4223303/1‑140 (MQ=255) aCGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCg > 2:4618479/1‑140 (MQ=255) aCGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCg > 2:5715412/1‑140 (MQ=255) | CACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTGAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCA > NZ_CP025268/468342‑468614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |