| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 98.1% | 1950.2 / 25.0 | 570 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/3); new base G (304/255); total (312/258) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 612 total aligned reads displayed.
ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCC > NZ_CP025268/1013379‑1013652 | gggCGATGCGGCCTGCGGTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCCGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACTACCCTGAGTTGTTATAGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑gggcg > 2:1242348/1‑137 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑gggcga > 2:11471502/1‑136 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑gggcga > 1:913005/1‑136 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑gggcgac < 2:3944216/140‑6 (MQ=255) gATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGc > 1:4232308/1‑140 (MQ=255) gATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATGTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAAGGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGTTGCAGT‑TGGGCGACGc > 1:2743831/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCa > 1:11180045/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCa > 1:8334021/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCa > 1:5553596/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCAt > 1:7933251/1‑140 (MQ=255) ccTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTaaa > 1:7551563/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGTTGGTTGAGCGCTACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCGGCTGGCACAACCCGGCGTTGTTATTGGGGGTCGCGCGCTGCCGT‑TGGGCGACGCCAGTaaa > 2:7793585/1‑140 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTaaaa > 1:1639550/1‑140 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTAGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCAGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGCTGCAGT‑TGGGCGACGCCATTaaaa < 2:6803134/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCAt < 1:7282930/140‑1 (MQ=255) ttGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCAGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGa < 1:2958399/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:10424845/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:8764226/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:7008883/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:10126420/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGAGGCAGT‑TGGGCGACGCCAGTAAAATCATGAACGACAg > 2:8102978/1‑140 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa < 1:364647/140‑1 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 2:7278559/1‑140 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 2:751730/1‑140 (MQ=255) cACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAcc < 2:1556678/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:4880397/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:11313678/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:9053879/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:9468177/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAGTCTGGCGAATATGCCGCGCGATGCCTGCTGGCACCACCCTGCGGTGTTATGGCGTGTGGCGCGATGCAGTGG‑GGCGGGGCCATTAGTATCATGAAGGACAGGCTGAGACCGCAggg > 2:6461654/1‑139 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTATAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:4751605/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:4280419/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:5919414/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:10517125/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:11169951/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:8345683/1‑140 (MQ=255) aGGTCAAGTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGtt < 2:4590529/140‑1 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:2823825/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:3451582/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:7604479/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:2472407/1‑140 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 2:5761936/140‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:5148654/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:11368919/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:8206683/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCTCTATGCCTGCTTGATCAACCCTGCGTTGTTATTGCTGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGACATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 2:6195987/140‑1 (MQ=255) cGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCa < 1:11029510/140‑1 (MQ=255) ttGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 1:9889796/140‑1 (MQ=255) tGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGcc > 1:1452992/1‑140 (MQ=255) aaTCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCTTTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAGCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTc > 2:6617992/1‑140 (MQ=255) tGGCGAAAATGCCGCACTAGGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAc < 1:209863/140‑1 (MQ=255) ggCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGGTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACa > 2:1856974/1‑140 (MQ=255) cGAACAGGCCGCACTCTGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCTGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:10047563/140‑1 (MQ=255) cGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAc < 2:6941091/140‑1 (MQ=255) cTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACgcgc < 1:5684795/140‑1 (MQ=255) cTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACgcgc < 1:3388167/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:5124770/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:7095280/140‑1 (MQ=255) tGCCTGGTGGCACAACCCTGCTTTGTTATTGCGGGTCGCGCTATGCAGT‑TGGGCGACGCATTTAAAATCATTAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTTATGTTGTCAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa < 1:6757292/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:9481047/1‑140 (MQ=255) ccTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACt > 2:8653161/1‑140 (MQ=255) gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 1:767396/1‑140 (MQ=255) gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 1:6255704/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 1:7435037/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 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cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:10854282/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:1815134/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACATCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:1232657/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:5555572/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:2228671/140‑1 (MQ=255) aaCCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTc < 1:3923291/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:386043/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg < 1:7991733/140‑1 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 1:10367431/1‑140 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 1:2332359/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGACCGACAGGCTGACACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 1:8454294/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 1:639845/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:10598282/140‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:3750500/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:9233580/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:2603786/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:4317692/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:5618408/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCAAGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTCCACAg > 2:10815394/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGAGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGACAACTGACGTGCAGTCTTCGGTCCACAg > 1:6073043/1‑140 (MQ=255) aTTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCt < 1:3216667/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTACAATCATGAACGCCAGGCGGAAACCGCAGGTGAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCGACCGCGCCACCTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:1939750/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:5488252/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:8532443/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:3164016/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:5370738/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:500634/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 2:251049/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 1:9309580/1‑140 (MQ=255) gcgATGCAGT‑TGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAAt < 2:4100349/140‑1 (MQ=255) | ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCC > NZ_CP025268/1013379‑1013652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |