New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 367 (0.550) | 99/272 | 1.4 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase |
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
CTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAATCG > NZ_CP025268/3744419‑3744695 | ctcgttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGa > 1:10950023‑M2/138‑140 (MQ=255) ttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGc > 2:1885763‑M2/134‑140 (MQ=255) ttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGc > 1:551681‑M2/134‑140 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:2016812‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:7017125‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:2696213‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattgtgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:10672660‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttgtgtcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:10492236‑M2/8‑1 (MQ=255) tttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagatactttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGt > 2:2583367‑M2/129‑140 (MQ=255) tttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaa < 2:3791068‑M2/16‑1 (MQ=255) tttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaa < 2:3060491‑M2/16‑1 (MQ=255) atcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGa > 1:5065953‑M2/119‑140 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:8086442‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:10374776‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:2203121‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:1687123‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:7814598‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:1181750‑M2/23‑1 (MQ=255) cttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGa < 2:6618549‑M2/26‑1 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt > 1:3146256‑M2/109‑140 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagagcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGACTTGTTAAAAAGTGTTCGATATAtt > 2:8658349‑M2/109‑140 (MQ=255) cccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTg < 1:3341416‑M2/34‑1 (MQ=255) cccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTg < 1:7995230‑M2/34‑1 (MQ=255) ccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataacccattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGa > 2:1394713‑M2/106‑140 (MQ=255) ccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATATGa > 2:11048167‑M2/106‑140 (MQ=255) tttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATc > 2:7760249‑M2/102‑140 (MQ=255) ttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataacccattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGTAATCa > 2:4369187‑M2/101‑140 (MQ=255) tagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGaaa < 1:6625651‑M2/37‑1 (MQ=255) gcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGAATGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAtt > 2:8478693‑M2/82‑140 (MQ=255) caaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa < 2:11383127‑M2/62‑1 (MQ=255) caaagtgtgccgtagttcaagatctcgacagataatttataaccaatttatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa < 2:61098‑M2/62‑1 (MQ=255) agtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGc > 1:6183848‑M2/76‑140 (MQ=255) tgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCa > 2:3467650‑M2/74‑140 (MQ=255) tgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaa > 2:6031888‑M2/72‑140 (MQ=255) tgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaa > 1:4103584‑M2/72‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAATTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 1:2467624‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAATAGCGAt > 2:9561913‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 1:1019552‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 1:497368‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 2:5137944‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGACAAAAAAGCGAt > 2:9178218‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgagttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 2:158633‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataacaaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 2:4059200‑M2/64‑140 (MQ=255) cacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGTAATTTTAAGCGAAACAAGCGTTCa > 2:10221199‑M2/62‑140 (MQ=255) cacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCa > 2:8995423‑M2/62‑140 (MQ=255) cacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCa > 1:9302238‑M2/62‑140 (MQ=255) acgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa < 1:10283832‑M2/80‑1 (MQ=255) acgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa < 1:2093570‑M2/80‑1 (MQ=255) cgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa < 2:8118792‑M2/62‑1 (MQ=255) cgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaa > 1:7298226‑M2/60‑140 (MQ=255) gatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaa < 1:1885763‑M2/82‑1 (MQ=255) gatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaa > 2:76458‑M2/59‑140 (MQ=255) tctcgacagatactttataaccaattgatttttatgtcttttgtatttgatcaatcTGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAATAAAGCGATCtaaaaa < 2:11242307‑M2/84‑1 (MQ=255) tctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaaaa < 1:9574567‑M2/84‑1 (MQ=255) tctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaaaa > 2:5371621‑M2/57‑140 (MQ=255) ctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 2:6480363‑M2/56‑78 (MQ=255) tcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAAc < 2:6280722‑M2/86‑1 (MQ=255) tcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAAc > 1:4436515‑M2/55‑140 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaaaa > 1:1397821‑M2/54‑71 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTATTCCAAAATAGCGATCAAAAAAACa > 2:7127861‑M2/54‑140 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACa > 1:3390912‑M2/54‑140 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACa > 2:2427491‑M2/54‑140 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAGTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACa > 1:9683377‑M2/54‑140 (MQ=255) cagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAgg < 1:3733029‑M2/90‑1 (MQ=255) agataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGa < 1:2490138‑M2/91‑1 (MQ=255) ataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAg > 1:6412918‑M2/48‑140 (MQ=255) ataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAg > 2:6937120‑M2/48‑140 (MQ=255) aatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATTTTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGcc < 1:6141101‑M2/95‑1 (MQ=255) aatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGcc < 1:10514656‑M2/95‑1 (MQ=255) atttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCt < 2:1288649‑M2/96‑1 (MQ=255) atttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaaacAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCC‑AAAAAGCGATCCAAAAAACAAGGAAGCCTg > 1:8614541‑M2/45‑140 (MQ=255) ataaccaattgaattttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGa < 2:4189027‑M2/100‑1 (MQ=255) accaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTCAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTATCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGa > 2:4307174‑M2/38‑140 (MQ=255) accaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGggagga > 1:5656102‑M2/38‑140 (MQ=255) attgctttttatgtctattgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGATAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt < 1:7156793‑M2/107‑1 (MQ=255) attgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCGTATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 2:8589746‑M2/34‑140 (MQ=255) attgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAATACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 1:7354471‑M2/34‑140 (MQ=255) attgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 2:96589‑M2/34‑140 (MQ=255) attgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 1:3976203‑M2/34‑140 (MQ=255) attgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 1:2997461‑M2/34‑140 (MQ=255) attgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 1:4796692‑M2/34‑140 (MQ=255) atttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACa > 2:8015959‑M2/30‑140 (MQ=255) tatgtcttttgaaattaatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGa > 2:4694786‑M2/25‑140 (MQ=255) atgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGATATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg < 2:1984655‑M2/117‑1 (MQ=255) atgtcttttgaaattcatcaatcAGAGTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg < 1:9130517‑M2/117‑1 (MQ=255) atgtcttttgaaattcatatatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCATGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg < 1:11434568‑M2/117‑1 (MQ=255) ttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg > 1:2863167‑M2/19‑135 (MQ=255) ttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg < 2:2863167‑M2/117‑1 (MQ=255) ttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGtt < 1:5315058‑M2/122‑1 (MQ=255) tgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAg > 1:1698187‑M2/16‑135 (MQ=255) tgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAg < 2:4993134‑M2/120‑1 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 2:11068182‑M2/127‑1 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 2:9393421‑M2/127‑1 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 2:3229668‑M2/127‑1 (MQ=255) aaattcatcaatcAGAGTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:10830412‑M2/127‑1 (MQ=255) aattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAagc < 1:7735318‑M2/128‑1 (MQ=255) aattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAagc < 1:8316343‑M2/128‑1 (MQ=255) aattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAagc < 1:696843‑M2/128‑1 (MQ=255) tcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAagcagc < 1:5216898‑M2/131‑1 (MQ=255) catcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGcc > 1:1113102‑M2/9‑140 (MQ=255) | CTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAATCG > NZ_CP025268/3744419‑3744695 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |