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                                      agagCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCaa              <  2:6158898/140‑1 (MQ=255)
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                                        agCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCaaaa            <  2:1542737/140‑1 (MQ=255)
                                        agCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTATTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATCATAGGAAAGCTTATTGTACAGGGTAAAACCATGCGATCTACACGCTAGCgaaa            >  2:6757524/1‑140 (MQ=255)
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                                            tGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc                                                                        <  1:5879625/76‑1 (MQ=255)
                                             ggTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCa       <  1:6985994/140‑1 (MQ=255)
                                             ggTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCa       <  1:859913/140‑1 (MQ=255)
                                             ggTGTAAGAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGACTACAATAACAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCAGCTACCCGCTATCAAAAAATCa       <  1:3073587/140‑1 (MQ=255)
                                             gcagtAAAACCACTTCCCGATAGTCTATTGCTATCGGGAATATAAACGACACCTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGTAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCa       <  2:10516946/137‑1 (MQ=255)
                                               tgtAATAACAATTGCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAAt     >  1:9861322/1‑140 (MQ=255)
                                               tgtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAAt     >  1:5153905/1‑140 (MQ=255)
                                               tgtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATAGGGAATATTAACGACAACTTAAGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGATTATTATACAGGTTAAAACAATGCCATCTACACGCGATCAAAAAATCAAt     >  2:10902475/1‑140 (MQ=255)
                                                gtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATg    <  1:5790298/140‑1 (MQ=255)
                                                gtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATg    <  2:10113217/140‑1 (MQ=255)
                                                gtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATg    <  1:4344885/140‑1 (MQ=255)
                                                gtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATg    <  1:9073700/140‑1 (MQ=255)
                                                  aataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGcc  <  1:2355825/140‑1 (MQ=255)
                                                  |                                                                                                                                           
GCAAGCTCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGCC  >  NZ_CP025268/2861912‑2862101

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑