| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,371,754 | T→C | *326* (TAA→TAG) | pspF ← | phage shock protein operon transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,371,754 | 0 | T | C | 99.3% | 2002.8 / NA | 581 | *326* (TAA→TAG) | pspF | phage shock protein operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (305/271); minor base A (0/4); total (306/275) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 581 total aligned reads displayed.
GATGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACT > NZ_CP025268/1371617‑1371890 | gATGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTa > 2:4378686/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAAt < 2:5531737/140‑1 (MQ=255) gAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGt < 1:5301031/140‑1 (MQ=255) gAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGt < 1:8978493/140‑1 (MQ=255) gCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGc < 2:9267591/140‑1 (MQ=255) gCGATTAAGAGCCCAACTCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCCGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTACGCTAACTCTGGTGc < 2:5249016/140‑1 (MQ=255) aTTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCttt > 2:5767195/1‑140 (MQ=255) gCCCAACGCAATCATGTCTGAGGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca < 2:8886581/140‑1 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTCAATCGGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 1:774333/1‑140 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca > 2:4833311/1‑136 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 1:7001970/1‑140 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 2:10033028/1‑140 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 1:8760805/1‑140 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 1:4394144/1‑140 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGAAGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 1:10863800/1‑140 (MQ=255) aCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg < 1:8304442/140‑1 (MQ=255) cGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTTATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCGGGTGCTTTTTCAACAAcgcgc > 2:5988106/1‑140 (MQ=255) cGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgc > 2:10941337/1‑140 (MQ=255) cAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTAATCAGGCCTTCAAACGACGTTTAGATTATGTTTGCCGAATATAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTATTCACCAACCCGCgg < 2:6439261/140‑1 (MQ=255) ataatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa < 1:3427086/140‑1 (MQ=255) ataatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa < 2:3889158/140‑1 (MQ=255) ataatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa < 1:3287363/140‑1 (MQ=255) ataatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa < 1:11244194/140‑1 (MQ=255) ataatGTCTGATGCGCTGCGCGTAGCATGCCTGCCACCGACGTCTTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCACCAACGCGCGGaa < 2:10684166/140‑1 (MQ=255) taatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAAc > 2:8524346/1‑140 (MQ=255) taatGTCTGAAGCGCTGCGCTTCTCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGATGTATTGCTCAACATCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAAc > 2:149266/1‑140 (MQ=255) aatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACt < 2:7840244/140‑1 (MQ=255) tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg > 1:4375258/1‑140 (MQ=255) tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg > 1:30883/1‑140 (MQ=255) tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg > 2:5635030/1‑140 (MQ=255) tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg > 1:2407351/1‑140 (MQ=255) tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg < 1:9815717/140‑1 (MQ=255) tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg < 2:4426879/140‑1 (MQ=255) tGATGCTCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTCTGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat < 2:11181892/140‑1 (MQ=255) tGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat > 1:1243461/1‑140 (MQ=255) tGATGCGCTGCGCGGATCAGGCCTGCAAACGCCGTATTGATGATGTAGGCCGAATCAAGCATTCACGCCGCATCCGGCACGTTGTATGGCTCAACTTCGCTAACTCTGGGGCTTTTTCACCAACGCGCGGTACAgatgat < 2:10212181/140‑1 (MQ=255) tGATGCGCTGCGATTATCAGGCCTGCAAACGTCGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGATAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat < 1:6482717/140‑1 (MQ=255) cgctgcgctTATCAGGCCTGCACACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTGTTTCAACAACGCGCGGAACGGATGATAAGtt > 2:7719403/1‑140 (MQ=255) cgctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGtt < 1:9147813/140‑1 (MQ=255) ctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATCAGTTaa > 1:2541627/1‑140 (MQ=255) ctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCGTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGAGAAGTTaa > 2:7029577/1‑140 (MQ=255) tgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 1:7878402/140‑1 (MQ=255) tgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 1:5532176/140‑1 (MQ=255) tgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 2:1993549/140‑1 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cgTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTc < 1:8492007/140‑1 (MQ=255) aTTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACACCGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTCATTCAGCCGCGCGCTTCTgg > 2:2475189/1‑140 (MQ=255) aTTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg > 2:6137605/1‑140 (MQ=255) aTTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg > 2:1261179/1‑140 (MQ=255) aTTGATGATGTCGGCCGCCTAACGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCACCGTCGCGAAATCGGGTGCTTTTTCACCCACGCGCGGAACGGATGAGACGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg < 2:8238588/140‑1 (MQ=255) gATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTta < 2:2778211/140‑1 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1:9254149/1‑140 (MQ=255) gCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCtt > 2:3653888/1‑140 (MQ=255) gCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCtt < 1:10295583/140‑1 (MQ=255) ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttg > 2:10479282/1‑140 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGc > 1:10497620/1‑140 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGc > 2:10358244/1‑140 (MQ=255) tAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCa < 2:3199044/140‑1 (MQ=255) aaGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCaaa < 2:2294301/140‑1 (MQ=255) cATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTg > 1:4076784/1‑140 (MQ=255) cgcATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTgcagc > 1:468775/1‑140 (MQ=255) cgcATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGCGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTgcagc < 2:4123643/140‑1 (MQ=255) gcATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTgcagca > 1:478814/1‑140 (MQ=255) gcATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTgcagca > 1:6754140/1‑140 (MQ=255) aTCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAAc > 1:2681405/1‑140 (MQ=255) tCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAAct < 2:6756618/140‑1 (MQ=255) tCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAAct > 2:8742352/1‑140 (MQ=255) tGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGCTAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCctg < 1:11136731/140‑1 (MQ=255) cTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATc > 1:5754061/1‑140 (MQ=255) cAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTg > 1:491403/1‑140 (MQ=255) cAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCATGCTGCATCTg > 2:9580353/1‑140 (MQ=255) cTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGaaa > 2:8817126/1‑140 (MQ=255) tCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACt < 1:9649262/140‑1 (MQ=255) | GATGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACT > NZ_CP025268/1371617‑1371890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |