Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,386,607 | A→G | pseudogene (969/1082 nt) | CXP41_RS07340 → | ABC transporter ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,386,607 | 0 | A | G | 99.8% | 1723.5 / NA | 492 | pseudogene (969/1082 nt) | CXP41_RS07340 | ABC transporter ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (229/262); minor base T (0/1); total (229/263) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 492 total aligned reads displayed.
CCCATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAATGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCC > NZ_CP025268/1386470‑1386743 | cctCGTGATGGGAATACGACCGGATGATAGTCATCCGGACGCGCTAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATGAGCGTGGGAGAATTAACCGGTGCGGAATTTTTGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGATTTAGTGGt < 2:6026061/138‑1 (MQ=255) cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCCCGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 2:5180599/140‑1 (MQ=255) cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 1:6403651/140‑1 (MQ=255) cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 2:5870529/140‑1 (MQ=255) cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 1:4079855/140‑1 (MQ=255) cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATGAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 2:3241165/140‑1 (MQ=255) tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 1:10012704/1‑140 (MQ=255) tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 2:2753935/1‑140 (MQ=255) tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 2:3153099/1‑140 (MQ=255) tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 1:9895694/1‑140 (MQ=255) tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 2:8989453/1‑140 (MQ=255) tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 1:1648528/1‑140 (MQ=255) cGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCg > 1:6971702/1‑140 (MQ=255) cGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCg > 1:5177261/1‑140 (MQ=255) aTGGGAATACGACCGGAAGATCTTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGGTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCt > 1:5696075/1‑140 (MQ=255) aTGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCt > 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aTACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCg < 1:3899452/140‑1 (MQ=255) gACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTaa < 2:7867023/140‑1 (MQ=255) ccGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAAt < 1:120835/140‑1 (MQ=255) ccGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAAATTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAAt < 1:4407722/140‑1 (MQ=255) ggAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGa > 2:4253642/1‑140 (MQ=255) gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 2:9667226/1‑140 (MQ=255) gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 1:5355732/1‑140 (MQ=255) aGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTa < 1:4322020/140‑1 (MQ=255) ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg > 1:6250099/1‑140 (MQ=255) ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg > 1:3137374/1‑140 (MQ=255) ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg < 2:5509770/140‑1 (MQ=255) ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg < 1:6779475/140‑1 (MQ=255) ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATGTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTTTCATg < 2:2495272/140‑1 (MQ=255) tCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGc < 1:11170891/140‑1 (MQ=255) aTCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAg < 2:2167392/140‑1 (MQ=255) tCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAgg > 1:10929558/1‑140 (MQ=255) ccGGACGCGCAAGAGGAAAATCACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 2:3757127/140‑1 (MQ=255) ccGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 2:5047806/140‑1 (MQ=255) ccGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 2:1148505/140‑1 (MQ=255) ccGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 1:8473247/140‑1 (MQ=255) ccGGACGCGCAAGAGGAAAATAACAGTTCCGCCACACTTAGCGTGGCAGAATTAAACGGTGCGGAATTTATGATCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 2:11287665/140‑1 (MQ=255) ggACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGgaga > 1:4724769/1‑140 (MQ=255) gACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGaa > 1:8766981/1‑140 (MQ=255) gcAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCACAATGAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAatat < 1:2162022/140‑1 (MQ=255) cAAGATGAAAATAACCTTTCCGCCAAAAATAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGTAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATc < 2:8545494/140‑1 (MQ=255) aaGAGGAAAAGAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCa < 1:2348193/140‑1 (MQ=255) ggAAAATAACCTTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTAt < 2:8220169/140‑1 (MQ=255) tAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCAttt > 2:4705448/1‑140 (MQ=255) tAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGGGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCAttt > 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ccGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGa > 2:404332/1‑140 (MQ=255) ccAAACTTCGCGTGTCAGAATTAACCGGTGCGGAATGTAAGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGa < 2:10025701/140‑1 (MQ=255) ccAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGa < 2:11122707/140‑1 (MQ=255) aGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCAt < 1:10583839/140‑1 (MQ=255) tGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCt < 1:10171304/140‑1 (MQ=255) gCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCttt > 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aCCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGaa > 1:2488843/1‑140 (MQ=255) tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCCGAAACGGa > 1:9298378/1‑140 (MQ=255) tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGa > 1:11385350/1‑140 (MQ=255) tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGa > 1:2872651/1‑140 (MQ=255) tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGa > 2:8674170/1‑140 (MQ=255) tATGCTCTACACCACTGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAAt < 2:7198771/140‑1 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1:973374/1‑140 (MQ=255) accacGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATa < 1:3756147/140‑1 (MQ=255) ccacGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATAc < 2:1766906/140‑1 (MQ=255) ccacGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATAc < 2:10348438/140‑1 (MQ=255) cGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAgg > 1:7959810/1‑140 (MQ=255) cGGGTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTGTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAgg > 2:7361177/1‑140 (MQ=255) ggTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggg > 2:5643388/1‑140 (MQ=255) ggTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggg < 1:7592770/140‑1 (MQ=255) gTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAgggg < 2:4785151/140‑1 (MQ=255) gCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCa < 1:3317186/140‑1 (MQ=255) cACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCAt < 1:7129092/140‑1 (MQ=255) cACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCAt < 2:7604958/140‑1 (MQ=255) cACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCAt < 2:10929557/140‑1 (MQ=255) gAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcc > 1:3970708/1‑140 (MQ=255) gAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcc > 1:7770718/1‑140 (MQ=255) gAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcc > 2:1328306/1‑140 (MQ=255) gTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAACTGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAAGAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcccc < 2:2349534/140‑1 (MQ=255) gTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcccc < 2:7029594/140‑1 (MQ=255) gTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcccc < 1:5930489/140‑1 (MQ=255) gTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcccc < 2:534617/140‑1 (MQ=255) gTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcccc < 1:8339749/140‑1 (MQ=255) gTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcccc < 1:4559174/140‑1 (MQ=255) gTTAGTGCTCCGTGCTGGAGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTcccc < 2:1589540/140‑1 (MQ=255) | CCCATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAATGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCC > NZ_CP025268/1386470‑1386743 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |