| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,432,916 | C→A | L210L (CTG→CTT) | CXP41_RS07635 ← | IS5‑like element ISKpn26 family transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,432,916 | 0 | C | A | 99.2% | 267.6 / NA | 125 | L210L (CTG→CTT) | CXP41_RS07635 | IS5‑like element ISKpn26 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (52/72); total (53/72) | |||||||||||
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Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
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ccTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCa < 1:9896691/140‑1 (MQ=17) tGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGc > 2:4854773/1‑140 (MQ=17) tGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGc > 1:8298036/1‑140 (MQ=17) tGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCGTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAACTAGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGc > 2:7449025/1‑140 (MQ=11) tGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGATCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTGGGTAGCCGGCATCGGCTGCGACACATTGCTCCTCGCCATGACGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGc > 2:3066930/1‑140 (MQ=11) gCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCGGCTCCTCGCGCTGGGGCGCTCCTTGGTCGCCGGCCTCGGCTGCGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCCGAGTAGCCAGCTGAGTGTGGTCATGcg > 2:8080710/1‑139 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2:6068429/1‑140 (MQ=17) gCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCt > 2:6697867/1‑140 (MQ=17) gCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCt > 1:9683841/1‑140 (MQ=17) gCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCGGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCt > 1:394941/1‑140 (MQ=12) cGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCg < 2:1684473/140‑1 (MQ=17) ggACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGtt > 2:939761/1‑140 (MQ=17) ggACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCAGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGtt < 2:756259/140‑1 (MQ=12) ggACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACAGCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATAGCTCCTCTCCCTGAAGCAGAGTACCCAGCTGAGTGAGGTCCTGCTCGtt < 2:10925646/140‑1 (MQ=11) aCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCTCCTCGGCCAGCTCCGCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGAGTGAGGTCATGCTCGTTgg > 2:5447799/1‑140 (MQ=11) aCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTgg > 2:10102242/1‑140 (MQ=11) | CGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGG > NZ_CP025268/1432779‑1432953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |