| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,472,740 | 0 | T | C | 99.7% | 2386.2 / NA | 712 | *410* (TAA→TAG) | CXP41_RS07810 | IS3‑like element IS2 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (322/387); minor base A (1/1); total (324/388) | |||||||||||
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Only 100 of 712 total aligned reads displayed.
GAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCTTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > NZ_CP025268/1472603‑1472866 | aaTTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTatat > 1:5229475/1‑140 (MQ=255) ctGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAc > 2:9001325/1‑140 (MQ=255) tGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACa < 2:134270/140‑1 (MQ=255) gggTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATc < 1:10211250/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=37) cAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGc < 1:5537378/140‑1 (MQ=37) gAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCctc > 2:7098635/1‑140 (MQ=18) gAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCctc > 1:1483656/1‑140 (MQ=18) gAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCctc > 2:3120312/1‑140 (MQ=18) gAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATAACAAGCCCGCAGCCGCCGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACAATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCctc > 2:4133955/1‑140 (MQ=11) ccTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCa < 1:3377984/140‑1 (MQ=11) ccTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCa < 2:4840240/140‑1 (MQ=11) | GAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCTTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > NZ_CP025268/1472603‑1472866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |