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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,549,203 | 0 | T | C | 99.4% | 1180.6 / NA | 342 | pseudogene (1331/1331 nt) | CXP41_RS08190 | leucine‑rich repeat domain‑containing protein |
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Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
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atTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTaataat < 2:8826180/89‑1 (MQ=255) | CAAGCTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATA > NZ_CP025268/1549066‑1549338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |