Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,016,740 | T→C | *105* (TAA→TAG) | fliE ← | flagellar hook‑basal body complex protein FliE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,016,740 | 0 | T | C | 99.6% | 1738.9 / NA | 500 | *105* (TAA→TAG) | fliE | flagellar hook‑basal body complex protein FliE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (329/169); minor base A (2/0); total (331/169) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 500 total aligned reads displayed.
GTTATCGCGTATACGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACTTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGTTCACCGAGAG > NZ_CP025268/2016603‑2016876 | tATCGCGTATACGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTa > 2:10889902/1‑138 (MQ=255) aTCGCGTATACGGATCGTGGAAGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTacac > 2:6376865/1‑140 (MQ=255) cgTATACGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGAAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGc > 2:7834457/1‑140 (MQ=255) tataCGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTCCACCTGCAt > 1:3698436/1‑140 (MQ=255) ataCGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATg > 1:3624120/1‑140 (MQ=255) taCGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGc < 2:9556815/140‑1 (MQ=255) gATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCtcat < 2:11213864/140‑1 (MQ=255) gATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCtcat < 2:7641554/140‑1 (MQ=255) aTCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCtcatc > 1:5616055/1‑140 (MQ=255) tCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGTGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCtcatca < 1:7425521/140‑1 (MQ=255) tCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCtcatca < 1:4068151/140‑1 (MQ=255) tCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCtcatca > 1:10933423/1‑140 (MQ=255) tCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCtcatca < 2:3856070/140‑1 (MQ=255) cGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATTTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCAc > 2:5432145/1‑140 (MQ=255) cGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCAc > 2:7027412/1‑140 (MQ=255) gTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACt > 1:8123024/1‑140 (MQ=255) gTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACt > 2:11114389/1‑140 (MQ=255) tGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACtt > 1:2536592/1‑140 (MQ=255) tGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACtt > 2:8096382/1‑140 (MQ=255) tGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACtt > 1:1692476/1‑140 (MQ=255) tGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACtt > 1:8533092/1‑140 (MQ=255) gCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGAt > 1:10481823/1‑140 (MQ=255) aGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATAc > 1:4474292/1‑140 (MQ=255) gAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATAcg < 1:7800474/140‑1 (MQ=255) aaCGTTCAGGATCAGGTATCCATTGTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCTGATGTAATTAACAACATGTTACAAAAACTACACCTGCATGCTCATGACTTCCTGATAcgccg > 2:4866551/1‑140 (MQ=255) ttCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTCCATGCTCAACACTTCCTGATACGCCGccac < 2:10680097/140‑1 (MQ=255) ttCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACAAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGccac < 2:2270311/140‑1 (MQ=255) tCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGccacc > 1:4868971/1‑140 (MQ=255) tCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGccacc < 2:6904429/140‑1 (MQ=255) ggATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGc > 1:1035450/1‑140 (MQ=255) gATCAGGTATCCACTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCt < 1:6305635/140‑1 (MQ=255) tCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCtta < 2:5171118/140‑1 (MQ=255) ggTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCttatta > 2:1243750/1‑140 (MQ=255) ggTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCttatta < 1:1831732/140‑1 (MQ=255) aTCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGc > 1:9066055/1‑140 (MQ=255) aTCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGc > 1:902745/1‑140 (MQ=255) ccATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCAc > 2:7265150/1‑140 (MQ=255) ccATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCAc > 2:9343162/1‑140 (MQ=255) ccATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCAc > 1:10888325/1‑140 (MQ=255) ccATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCAc > 2:8305554/1‑140 (MQ=255) aTTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCt < 1:4227639/140‑1 (MQ=255) ttAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGaa < 2:10474947/140‑1 (MQ=255) tAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAAt > 2:6541004/1‑140 (MQ=255) tAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAAt > 1:9929786/1‑140 (MQ=255) aaaCCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATc < 1:11114390/140‑1 (MQ=255) aCCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATccc < 1:1985024/140‑1 (MQ=255) aGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCAt > 1:2730346/1‑140 (MQ=255) gAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCAtt < 1:4667191/140‑1 (MQ=255) gAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCAtt < 1:6541004/140‑1 (MQ=255) aaaTTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCAttt > 2:3397072/1‑140 (MQ=255) aaaTTGAGTGAGTTTGCACCATCCATGCCCAACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCAttt > 2:2491063/1‑140 (MQ=255) agtgagtTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAg > 1:5210866/1‑140 (MQ=255) gtTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACt > 1:11468946/1‑140 (MQ=255) tttGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTg > 1:2151694/1‑140 (MQ=255) tGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAg > 2:260634/1‑140 (MQ=255) ccccATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGc < 2:3616641/140‑1 (MQ=255) atccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCtttt > 1:7520701/1‑140 (MQ=255) atccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCtttt > 1:3946079/1‑140 (MQ=255) atccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCtttt > 2:4031499/1‑140 (MQ=255) atccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCtttt > 1:8396382/1‑140 (MQ=255) atGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCa < 2:10190147/140‑1 (MQ=255) atGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCa < 1:681401/140‑1 (MQ=255) tGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCat > 2:8900127/1‑140 (MQ=255) tGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCat > 1:7218801/1‑140 (MQ=255) gCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCata > 1:10166764/1‑140 (MQ=255) gCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCata < 2:200274/140‑1 (MQ=255) gCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCata > 1:3446736/1‑140 (MQ=255) ccccACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCatat < 2:4760661/140‑1 (MQ=255) cccACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATc < 1:586599/140‑1 (MQ=255) cccACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATc < 1:6015356/140‑1 (MQ=255) cccACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATc < 2:8702287/140‑1 (MQ=255) cccACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATc < 2:2822334/140‑1 (MQ=255) aCGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACg < 1:2946881/92‑1 (MQ=255) aCGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACg > 2:2947075/1‑92 (MQ=255) aCGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGt > 2:1844944/1‑140 (MQ=255) aCGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGt > 1:796211/1‑140 (MQ=255) aCGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGt > 2:5071617/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACATGTTACAAAACCTAAACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGAACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAAATGAGGCTTTTTGCATATCGGtc > 2:6117107/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCCCCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTATGCATATCGGtc > 1:10715406/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGTCTTTTTGCATATCGGtc > 2:10785191/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtc > 2:2148700/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtc > 2:7580168/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtc > 1:1464472/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtc > 1:5191534/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGACACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtc > 2:4230044/1‑140 (MQ=255) gcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtca < 1:9522031/140‑1 (MQ=255) gTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtcatca < 1:3331914/140‑1 (MQ=255) cGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTCCACCTGCCTGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGtt > 2:5959911/1‑140 (MQ=255) gATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATg > 2:1654947/1‑40 (MQ=255) gATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTa > 1:8469440/1‑140 (MQ=255) tGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAac > 1:7612024/1‑140 (MQ=255) aTTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGtca < 1:6764408/122‑1 (MQ=255) aTTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAacgcca > 2:30643/1‑140 (MQ=255) aacaacAGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAacgccacgc < 2:4651784/140‑1 (MQ=255) caacaGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTg > 2:6750641/1‑96 (MQ=255) caacaGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCg > 1:3122380/1‑140 (MQ=255) caacaGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCg > 1:10006732/1‑140 (MQ=255) acaGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCggg < 1:5380578/140‑1 (MQ=255) caGGTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGACACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGt > 1:8881656/1‑140 (MQ=255) gTTACAAAACCTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTg < 2:9714450/90‑1 (MQ=255) | GTTATCGCGTATACGGATCGTGGATGGCAGAAAACGTTCAGGATCAGGTATCCATTTTAAACCAGAAATTGAGTGAGTTTGCCCCATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACTTACACCTGCATGCTCATCACTTCCTGATACGCCGCCACCAGCTTATTACGCACCTGAATCCCCATTTGCATAGAAACTGAGGCTTTTTGCATATCGGTCATCACATCGTTTAACGCCACGCCGGGTTCACCGAGAG > NZ_CP025268/2016603‑2016876 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |